Single-cell RNA-seq reveals the platinum resistance genes and their function.

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K16746
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 56030:Urology-related
• Research Institution: Keio University
• Principal Investigator: NIWA NAOYA 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師(非常勤) (40626743)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 尿路上皮癌 / 抗がん剤耐性 / 腫瘍内不均一性 / シングルセルRNAシークエンス法

Outline of Final Research Achievements

We have introduced the green fluorescent protein (GFP), a novel fluorescent genetic reporter, into a mouse bladder tumor cell line (MBT2). We have established an murine orthotopic and subcutaneous bladder tumor model using the cell line. We have also developed an novel protocol to collect only tumor cells from bulk tumor.

Free Research Field

尿路上皮癌

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

シングルセルRNAシークエンス法は腫瘍塊を形成する細胞集団の転写産物(RNA)を1細胞毎に網羅的に解析できる画期的な技術であるが、実際の腫瘍塊を用いての解析では超えるべきハードルが多い。
本研究においては、GFP遺伝子を導入したマウス膀胱癌細胞株を用いて正所性膀胱癌マウスを独自に樹立、マウス膀胱癌腫瘍塊から生きたまま腫瘍細胞のみを生きたまま効率よく1細胞毎に回収するプロトコールを確立した。
本研究は膀胱癌のみならず他癌のモデルマウスも含めて腫瘍塊の1細胞毎の解析を可能にする。