Identification of HPV-associated oropharyngeal carcinoma poor prognostic factor using microRNA and epigenome analysis

2019 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 18K16850
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: 波多野 孝 横浜市立大学, 附属病院, 助教 (40807583)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: ヒト乳頭腫ウイルス関連中咽頭癌 / 頭頸部癌 / エピゲノム / マイクロRNA / HPV

Outline of Annual Research Achievements

ヒト乳頭腫ウイルス（HPV）関連中咽頭癌はHPV陰性癌と比較し予後が良好と考えられているが、その中にも予後不良な症例は依然として存在しており、その理由は明らかではない。
我々は今までのNGSを用いた研究でHPV関連頭頸部癌細胞株においてHPVは遺伝子間領域に組み込まれていることを確認した。
そこで、本研究ではまず代表的なnon-coding RNAであるマイクロRNAに着目し、HPV関連頭頸部癌細胞株を用いて網羅的マイクロRNAプロファイリングを行い、HPV感染により発現が変動するマイクロRNA群の中から予後に影響を及ぼすと考えられるマイクロRNAを同定することより開始した。その結果をThe Cancer Genome Atlas(TCGA) database上のマイクロRNA発現と比較解析し、HPV感染と発現に相関があり、HPV関連頭頸部癌の予後不良因子となりうるマイクロRNAを抽出した(mirA-E)。これらのマイクロRNAの発現変動と予後との関連を調べるため、in vitroで細胞増殖、遊走能の関連について検討を行った。その結果mirBの発現変動を行うことで細胞増殖能、遊走能に有意に差が得られたため、今回同定したmirBがOncomiRである可能性が考えられた。
続いて、複数のPublic databaseを組み合わせて用いることで、mirBにより制御されるtarget geneの絞り込みを行った。その結果、mirBの発現制御によりgeneX、Yの発現変動が生じることが明らかとなった。
以上より、HPV関連中咽頭癌の発癌機構において、mirBは増殖能、遊走能を亢進することを明らかとした。

Research Products

• [Journal Article] The Advances in Research of Human Papillomavirus-Induced Carcinogenesis in Oropharyngeal Cancers (2019)
  • Author(s): Hatano Takashi, Sano Daisuke, Oridate Nobuhiko.
  • Journal Title: Gan To Kagaku Ryoho. Volume: 46(7) Pages: 1128-1130
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Real-world Treatment Outcomes of the EXTREME Regimen as First-line Therapy for Recurrent/Metastatic Squamous Cell Carcinoma of the Head and Neck: A Multi-center Retrospective Cohort Study in Japan. (2019)
  • Author(s): Sano Daisuke, Fujisawa Takuo, Tokuhisa Motohiko, Shimizu Minaki, Sakagami Tomofumi, Hatano Takashi, Nishimura Goshi, Ichikawa Yasushi, Iwai Hiroshi, Oridate Nobuhiko.
  • Journal Title: Anticancer Research. Volume: 39(12) Pages: 6819-6827
  • DOI: doi: 10.21873/anticanres.13898.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A prospective clinical trial of the second-look procedure for transoral surgery in patients with T1 and T2 laryngeal, oropharyngeal, and hypopharyngeal cancer. (2019)
  • Author(s): Nishimura Goshi, Sano Daisuke, Arai Yasuhiro, Hatano Takashi, Takahashi Hideaki, Tanabe Teruhiko, Wada Takashi, Morishita Daiki, Oridate Nobuhiko.
  • Journal Title: Cancer Medecine. Volume: 8(17) Pages: 7197-7206
  • DOI: doi: 10.1002/cam4.2588.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Establishment of PDX-derived salivary gland adenoid cystic carcinoma cell lines using organoid culture method (2019)
  • Author(s): 高田 顕太郎, 相澤 圭洋, 佐野 大佑, 奥田 諒, 関根 圭輔, 上野 康晴, 青山 準, 波多野 孝, 荒井 康裕, 谷口 英樹, 折舘 伸彦
  • Organizer: 第78回日本癌学会総会
  • Int'l Joint Research