2018 Fiscal Year Research-status Report

側頭骨癌におけるインフラマゾーム関連分子の網羅的解析による炎症性発癌機構の解明

Research Project

Project/Area Number	18K16895
Research Institution	Kyushu University
Principal Investigator	小宗徳孝九州大学, 大学病院, 助教 (80529884)
Project Period (FY)	2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords	外耳道扁平上皮癌 / 発癌機構 / インフラマゾーム
Outline of Annual Research Achievements	本研究は、外耳道扁平上皮癌の炎症性発癌においてInflammasome関連分子の関与の有無を検証するものである。腫瘍細胞自身もしくは微小環境中の骨髄由来細胞内のinflammasome関連分子の発現が、癌抑制や癌形成促進に関するという研究が報告されるようになってきているものの、発癌機構や癌促進機構へのinflammasomeの関与は、現在も議論の余地が残る。外耳道癌は、耳かきぐせが一つの発がんの原因と言われており、慢性炎症が発がんに関与している可能性は非常に高い。そのため、まずは、昨年までに当院を受診され、根治術もしくは治療前の生検時に採取した検体から、RNAを抽出し、RNA-sea解析により発癌・癌進展に関与するinflammasome関連遺伝子の絞り込みを行う方針とした。当科に昨年末までに受診され加療された患者検体から抽出したRNAのうち、濃度が200ng/sample以上抽出可能であった２０検体を、RNA-seq解析に提出した。現在は、解析結果の報告を待っているところである。また、予備実験として、TCGAのData Baseから、頭頚部癌SCCでのinflammasome関連分子の発現比較を行ったところ下咽頭癌、上顎癌、耳下腺癌において、下咽頭癌では、上顎癌と耳下腺癌と比べるとNLRP3の発現が低い傾向にあった。そのため、SCCの発現部位にて、inflammasome関連分子の発現に特性がある可能性があることがわかった。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 3: Progress in research has been slightly delayed. Reason 検体を解析に提出はできているが、提出できた検体が２０検体であり、解析結果報告を待っているところである。解析結果を検証して、Vitroの実験を行う予定であるが、予定では、本年度中にVitroの実験に移行する予定であった。
Strategy for Future Research Activity	RAN-Seqの解析結果から、Inflammasome関連分子の発現を検証して、TCGAのData baseから、他癌腫とのInflammasome関連分子の発現パターンの頃なる分子を絞り込む予定である。それらの分子を用いて、Vitroで、目的遺伝子を過剰発現もしくはノックダウンして、細胞形態や増殖活性の変化などを検討していく予定である。
Causes of Carryover	RNA-seq解析結果がかえってきていないため、Vitroの実験が行えていないため、来年度へ予算を繰越すこととなった。また、予定していたRNA-seqの検体数が十分でなかった場合は、さらに追加の検体を提出する予定である。