2020 Fiscal Year Research-status Report
不完全情報あるいは間接的情報に基づく感染性の指標、基本再生産数の推定
Project/Area Number |
18K17371
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Research Institution | National Center for Global Health and Medicine |
Principal Investigator |
浅井 雄介 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 国際感染症センター, 研究員 (70779991)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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Keywords | 理論疫学 / 感染症 |
Outline of Annual Research Achievements |
基本再生産数R0は,一人の感染者が生み出す二次感染者数の平均値で与えられ,ワクチン接種率の目標設定や累積罹患率の予測など,感染症制御に係る保健医療政策の判断に欠かせない指標である.しかしながら,感染症の観察データは症候群に基づく患者数データに頼ることが多く,また小規模流行や流行の初期では観察情報が少ないため,R0の推定が困難な事例が多々存在する.本研究では,従来の理想的な観察データに基づくR0の推定を補間可能な不完全情報や間接情報を用いて実現することを目標としており,研究3年目である本年度は以下の研究を行った. 報告の遅れを実装したR0の推定:流行初期では感染症が流行しつつあることがまだ広く知られていないことがあり,感染者の報告に遅れが生じる.そのため,報告者数を各時点における感染者とする推定には不確実性が伴う.さらに,流行が認識されることによりマスクの着用や手指衛生の強化といった行動変容がおきるため,感染リスクも一定ではない.本研究では,2020年の1月から始まったCOVID-19のデータを用いて,報告の遅れと感染者および感受性集団の行動変容を実装したモデルを構築し,感染性の推定を行った.本研究は論文としてまとめ出版した. 人口属性を含めた感染拡大のシナリオ分析:COVID-19流行では,感染リスクは一様ではなく,人口属性によって行動が大きく異なること,また罹患リスクも変化することがデータによって明らかになってきた.そのため,前年度に構築した報告の遅れを記述するモデルに性別や年齢を加味し,一人一人の属性に合わせた感染リスク推定モデルを構築した.性別や年齢により行動も異なることが知られており,外食の有無や三密空間の滞在といった要因もモデルに組み込み,感染拡大のシミュレーションを行った.
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
本年度の計画では,2009年に起きたインフルエンザのパンデミックデータを用いて,実効距離と到着時間を用いた感染性の推定する予定であったが,予定していたインフルエンザのデータより詳細な,COVID-19の各国の流行データと日本での空港検疫のデータが入手できた.現在第3波,第4波とCOVID-19は国内外を問わず流行しており,引き続き各国の流行データと人の移動に関連するデータを収集中である. クラスターデータを用いた数理モデル研究については,こちらもCOVID-19の院内感染のデータを含め複数収集できており,現在,時系列データを記述する数理モデルを複数構築し,データのあてはめとパラメータ推定を行っている状況である. 研究の理論的な側面は順調に進んでいるが,解析データの変更に伴い,当初の計画よりも遅れがある.
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Strategy for Future Research Activity |
2020年度は参加を予定していた学会がキャンセルとなったため,研究成果の発表をする機会がなかった.本年度はオンライン学会なども積極的に利用し,研究成果の発表と情報収集を行う予定である. また,COVID-19の流行に関するオープンデータだけでなく,コビレジを通して患者一人一人の人口属性データなど,研究の計画段階では想定していなかったデータも手に入りつつある.本年度はこれらのデータを利用し,構築した数理モデルを用いて感染リスクの推定を行う.さらに,人の行動変容も加味し,より現実に即した数理モデルの構築を目指す予定である.
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Causes of Carryover |
理由:本年度はCOVID-19の流行により,予定していた学会発表や出張ができなかった.また,COVID-19のデータ収集に焦点を当て研究を遂行したため,図書の購入が少なかったことも理由としてあげられる.
使用計画:学会発表や出張等を行う予定であるが,国内外の感染状況によっては,海外出張よりも国内出張の比重を大きくするということも考えている.また,図書や物品購入費など,他の使用目的への振り分けも検討している.
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