Computational prediction of mitochondrial protein interactome

2020 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K18149
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: Ohue Masahito 東京工業大学, 情報理工学院, 助教 (50743209)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: バイオインフォマティクス / タンパク質間相互作用 / インタラクトーム / ミトコンドリアタンパク質

Outline of Final Research Achievements

A comprehensive understanding of mitochondrial proteins has been a major challenge in biology and medicine. In particular, protein-protein interactions (PPIs) involving mitochondrial proteins have been little investigated and information on them is scattered, although they are highly valuable as drug targets. The aim of this project was to develop a technology to elucidate the comprehensive interactome of mitochondrial proteins. We have developed an advanced PPI prediction technology, MEGADOCK. In addition, we developed a database of the results of the comprehensive PPI prediction, integrated the related information, and published it.

Free Research Field

バイオインフォマティクス

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ミトコンドリアに存在するタンパク質はミトコンドリア病をはじめとする様々な疾病と関係しているため、治療手段の無い疾病のための薬の開発などにミトコンドリアタンパク質の理解を進めることが重要である。本研究では、タンパク質同士の相互作用という機能に着目し、そのような相互作用が行われているかを計算によって網羅的に予測することを行った。開発したデータベースであるMEGADOCK-Web-Mitoは自由にアクセスすることができ、創薬研究開発などの加速に貢献することが期待される。