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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Regulation of CAZyme genes expression in a cellulolytic Clostridium bacterium

Research Project

Project/Area Number 18K18218
Research InstitutionMie University

Principal Investigator

市川 俊輔  三重大学, 教育学部, 講師 (50781118)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywordsバイオリファイナリー / セルロース系バイオマス / Clostridium thermocellum / 糖質関連酵素
Outline of Annual Research Achievements

未利用資源であるセルロース系バイオマスからの原油代替化合物生産(バイオリファイナリー)を実現するために、セルロース系バイオマスの効率的分解を達成する必要がある。細菌Clostridium thermocellumはセルロース系バイオマスの構造や構成成分を認識し、遺伝子発現調節因子(σ因子)を介して、その分解に適した多種の分解酵素を分泌する。本研究では、σ因子の機能を明らかにすることでC. thermocellumのバイオマス分解酵素生産の調節メカニズムを解明する。
C. thermocellumのσ因子(sigI7)遺伝子構成的発現株では、47つの糖質関連酵素遺伝子の発現が促進、8つの糖質関連酵素遺伝子の発現が抑制されていることを、トランスクリプトーム解析によって明らかにした。sigI7発現株の培養液のセルロース系バイオマス分解活性は、野生株のものより小さかった。セルラーゼ活性には変化がなかったが、キシラナーゼ活性などが低下していることがわかった。この株の培養液中の分子量約75kDaおよび約50kDaのキシラナーゼが減少していることを、SDS-PAGEとキシラナーゼ活性染色により確認した。
C. thermocellumは100以上の糖質関連酵素を用いて効率よくセルロース系バイオマスを分解するが、どの糖質関連酵素の活性がセルロース系バイオマス分解活性に重要なのか、明らかでない。ここまでのトランスクリプトームや活性染色による結果を踏まえて、sigI7発現株で減少している糖質関連酵素を推定した。糖質関連酵素遺伝子Clo1313_1002またはClo1313_0522から調製したリコンビナントタンパク質は、セルロース系バイオマスの分解活性をほとんど示さないが、sigI7発現株培養液に添加することで、そのセルロース系バイオマス分解活性を復帰できることを明らかにした。

  • Research Products

    (3 results)

All 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Cellulosomes localize on the surface of membrane vesicles from the cellulolytic bacterium Clostridium thermocellum2019

    • Author(s)
      Shunsuke Ichikawa, Satoru Ogawa, Ayami Nishida, Yuzuki Kobayashi, Toshihito Kurosawa, Shuichi Karita
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters

      Volume: 366 Pages: fnz145

    • DOI

      doi: 10.1093/femsle/fnz145

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Physcomitrella STEMIN transcription factor induces stem cell formation with epigenetic reprogramming2019

    • Author(s)
      Masaki Ishikawa, Mio Morishita, Yohei Higuchi, Shunsuke Ichikawa, Takaaki Ishikawa, Tomoaki Nishiyama, Yukiko Kabeya, Yuji Hiwatashi, Tetsuya Kurata, Minoru Kubo, Shuji Shigenobu, Yosuke Tamada, Yoshikatsu Sato, Mitsuyasu Hasebe
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 5 Pages: 681-690

    • DOI

      10.1038/s41477-019-0464-2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 細菌 Clostridium thermocellum のセルロース分解メカニズム2019

    • Author(s)
      市川俊輔
    • Organizer
      第33回セルラーゼ研究会
    • Invited

URL: 

Published: 2021-01-27  

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