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2018 Fiscal Year Research-status Report

Molecular mechanism of how antifreeze glycoproteins adsorb to ice

Research Project

Project/Area Number 18K19060
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

望月 建爾  信州大学, 学術研究院繊維学系, 助教 (40734554)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2021-03-31
Keywords不凍タンパク質 / 氷 / 相転移
Outline of Annual Research Achievements

不凍タンパク質は氷に吸着し氷の成長を止めることができる。不凍タンパク質の機能を理解することは、極限環境に適応する生命の仕組みを理解するだけでなく、食品や細胞の保存技術、不凍機能を有する材料開発など多方面への応用が期待できる。我々は主に分子動力学計算を用いて、その分子機構の解明に挑戦する。H30年度は、珪藻から発見された不凍タンパク質fcIBPを対象に、成長する氷面に吸着する様子を分子シミュレーションを用いて調べた。fcIBPは氷格子に類似した秩序を分子表面に持たないため、氷に吸着する分子面が不明であった。我々は、fcIBPは異なる分子面で、氷のベーサル面とプリズム面に吸着することを見つけた。さらに、fcIBPの氷と直接触れない面と氷との間に、氷とは構造が異なるが動きが鈍い水が存在する事がわかった。この研究内容をPhys.Chem.Chem.Phys.誌に発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

珪藻の不凍タンパクが氷に吸着する分子機構を明らかにし、研究成果を論文として発表できた

Strategy for Future Research Activity

多くの不凍タンパク質は大きな疎水面を持ちながら、水中で凝集する事なく単独で存在し、氷面に選択的に吸着する。氷面近傍だけでなく、水中での振る舞いも含めて、大局的な視点から不凍タンパク質の機能を理解する。

Causes of Carryover

次年度予算と合算して、高性能GPU計算機を購入するため

  • Research Products

    (5 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Alfred Wegener Institute(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Alfred Wegener Institute
  • [Journal Article] Collective Transformation of Water between Hyperactive Antifreeze Proteins: RiAFPs2019

    • Author(s)
      Mochizuki Kenji、Matsumoto Masakazu
    • Journal Title

      Crystals

      Volume: 9 Pages: 188~188

    • DOI

      10.3390/cryst9040188

  • [Journal Article] Multiple binding modes of a moderate ice-binding protein from a polar microalga2018

    • Author(s)
      Kondo Hidemasa、Mochizuki Kenji、Bayer-Giraldi Maddalena
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 20 Pages: 25295~25303

    • DOI

      10.1039/C8CP04727H

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分子動力学計算を用いた不凍タンパク質と氷の相互作用の研究2019

    • Author(s)
      望月建爾
    • Organizer
      ワークショップ:結晶表面・界面での相転移ダイナミクスに関するその場観察および理論(北海道大学低温科学研究所)
    • Invited
  • [Presentation] 不凍糖タンパク質の氷吸着メカニズム2019

    • Author(s)
      望月建爾
    • Organizer
      研究会「化学反応のポテンシャル曲面とダイナミクス」(理化学研究所計算科学研究センター R-CCS)
    • Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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