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2018 Fiscal Year Research-status Report

タンパク質ケージによるアミロイドオリゴマーの精密構造決定

Research Project

Project/Area Number 18K19143
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

上野 隆史  東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (70332179)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Keywordsフェリチン / アミロイド / 超分子集合体
Outline of Annual Research Achievements

アルツハイマー病発症の鍵をにぎるアミロイドファイバーの形成過程は、国内外の研究者によって精力的に研究が進められている。特に、超高齢化が進む日本では、大きな社会的問題の一つとなっており大変注目されているものの、分子レベルでの機構解明は未だに達成されていない。最近では、少数のアミロイドベータペプチド単量体(Ab)からなるAbオリゴマーが、Abファイバー形成時に比べ高い毒性を持つことが報告されており、単量体からファイバー形成への中間反応となるオリゴマー形成プロセスの理解が重要かつ緊急な課題となっている。しかしながら、42残基からなるAb42)が高い凝集性を有することから、特定のオリゴマーの単離、溶解が困難であり、現状では、化学的な修飾を施した10-20残基程度のAbのフラグメントを調製し、X線結晶構造解析や固体NMRによる静的な構造決定が達成されているのみである。従って、アミロイド研究では、全長のAbオリゴマーの原子レベルの構造決定に加え、オリゴマー形成からファイバー形成反応までの動的な挙動を追跡できる手法の開発が強く求められている。本研究では、平成30年度にオリゴマー形成過程の全容解明に向けた革新的な手法として、Ab42の凝集や溶解性の問題を解決するため、蛋白質ケージへの内包を利用したAb42オリゴマーの孤立化手法を確立し、様々なフラグメントをタンパク質ケージ内に集合させることに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

初年度内に最終目標であるリアルタイム観察の条件最適化を進めているため。

Strategy for Future Research Activity

(1)高分解能結晶構造決定システムの開発
(2)金属イオンや各種阻害剤によるオリゴマーの構造変化追跡
(3)蛋白質ケージ解離をトリガーとするファイバー形成のリアルタイム観察
の実現を目指すとともに、理論化学的なアプローチも視野に入れた展開を計画している。

Causes of Carryover

節約したため、その分を合成試薬購入に当て、追加の変異体を作成する。

  • Research Products

    (29 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 10 results,  Invited: 10 results) Book (4 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 清華大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      清華大学
  • [Int'l Joint Research] KAIST(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      KAIST
  • [Int'l Joint Research] NTU(シンガポール)

    • Country Name
      SINGAPORE
    • Counterpart Institution
      NTU
  • [Journal Article] Coordination design of cadmium ions at the 4-fold axis channel of the apo-ferritin cage2019

    • Author(s)
      Abe Satoshi、Ito Nozomi、Maity Basudev、Lu Chenlin、Lu Diannan、Ueno Takafumi
    • Journal Title

      Dalton Transactions

      Volume: 48 Pages: 9759~9764

    • DOI

      10.1039/C9DT00609E

  • [Journal Article] Recent progresses in the accumulation of metal ions into the apo-ferritin cage: Experimental and theoretical perspectives2019

    • Author(s)
      Maity Basudev、Hishikawa Yuki、Lu Diannan、Ueno Takafumi
    • Journal Title

      Polyhedron

      Volume: 172 Pages: 104~111

    • DOI

      10.1016/j.poly.2019.03.048

  • [Journal Article] Encapsulation of biomacromolecules by soaking and co-crystallization into porous protein crystals of hemocyanin2019

    • Author(s)
      Hashimoto Tsubasa、Ye Yuxin、Matsuno Asuka、Ohnishi Yuki、Kitamura Akira、Kinjo Masataka、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Yao Min、Ogawa Tomohisa、Matsui Takashi、Tanaka Yoshikazu
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 509 Pages: 577~584

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.12.096

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Construction of supramolecular nanotubes from protein crystals2019

    • Author(s)
      Nguyen Tien Khanh、Negishi Hashiru、Abe Satoshi、Ueno Takafumi
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 10 Pages: 1046~1051

    • DOI

      10.1039/C8SC04167A

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Engineering of protein crystals for development of bionanomaterials2019

    • Author(s)
      T. K. Nguyen, T. T. Pham, and T Ueno
    • Journal Title

      Jpn. J. Appl. Phys.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photoinduced in?Vivo Magnetic Resonance Imaging (MRI) with Rapid CO Release from an MnCO-Protein Needle Composite2018

    • Author(s)
      Hyodo Fuminori、Sho Takeya、Maity Basudev、Fujita Kenta、Tachibana Yoko、Akashi Satoko、Mano Megumi、Hishikawa Yuki、Matsuo Masayuki、Ueno Takafumi
    • Journal Title

      Chemistry - A European Journal

      Volume: 24 Pages: 11578~11583

    • DOI

      10.1002/chem.201802445

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Raman spectroscopy insight into Norovirus encapsulation in Bombyx mori cypovirus cubic microcrystals2018

    • Author(s)
      Mori Hajime、Oda Naoki、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Zhu Wenliang、Pernstich Chris、Pezzotti Giuseppe
    • Journal Title

      Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy

      Volume: 203 Pages: 19~30

    • DOI

      10.1016/j.saa.2018.05.066

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Supramolecular protein cages constructed from a crystalline protein matrix2018

    • Author(s)
      Negishi Hashiru、Abe Satoshi、Yamashita Keitaro、Hirata Kunio、Niwase Kento、Boudes Marion、Coulibaly Fass?li、Mori Hajime、Ueno Takafumi
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 54 Pages: 1988~1991

    • DOI

      10.1039/C7CC08689J

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Photocatalytic hydrogen evolution systems constructed in cross-linked porous protein crystals2018

    • Author(s)
      Tabe Hiroyasu、Takahashi Hikaru、Shimoi Takuya、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Yamada Yusuke
    • Journal Title

      Applied Catalysis B: Environmental

      Volume: 237 Pages: 1124~1129

    • DOI

      10.1016/j.apcatb.2018.01.046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functionalization of protein crystals with metal ions, complexes and nanoparticles2018

    • Author(s)
      Abe Satoshi、Maity Basudev、Ueno Takafumi
    • Journal Title

      Current Opinion in Chemical Biology

      Volume: 43 Pages: 68~76

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2017.11.015

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Protein crystals for designing biosupramolecular materials2019

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      Tokyo Tech NCCR Molecular Systems Engineering Joint Symposium, Basel,
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bioinorganic Design of Protein Assembly2019

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      2019 KAIST School of Molecular Science BK21 Workshop
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Metal Coordination Functions Designed in Protein Cage2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      3rd Japan-UK Joint Symposium on Coordination Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Metal Coordination and Function Designed in Protein Assembly2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      2018 Korea-Taiwan-Japan Bioinorganic Chemistry Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Functional Design of Protein Cage for Sustainable Bionanomaterial2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      ASPIRE League forum
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Functions designed in Crystalline Protein Assembly?2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      JST Fujita ACCEL International Symposium Coordination Chemistry for Structural Elucidation ICCC2018?
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Dynamic Process of Proteins Observed in Crystalline Cages2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      The 79th Okazaki Conference Synthetic, Biological, and Hybrid Molecular Engines
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Dynamic Function of Crystalline Protein Assembly2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      ACSIN-14 & ICSPM26, Nanobiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Artificial metalloproteins constructed with protein assemblies for bioinorganic materials2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      The 18th Japan-Korea Joint Symposium on Organometallic and Coordination Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Artificial metalloproteins constructed with protein assemblies for bionano applications2018

    • Author(s)
      Takafumi Ueno
    • Organizer
      The 9th Asian Biological Inorganic Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 光エネルギー変換における分子触媒の新展開2019

    • Author(s)
      安部 聡、上野隆史
    • Total Pages
      印刷中
    • Publisher
      化学同人
  • [Book] 機能性高分子金属錯体2019

    • Author(s)
      安部 聡、上野隆史
    • Total Pages
      印刷中
    • Publisher
      三共出版
  • [Book] Advances in Bioorganometallic Chemistry2018

    • Author(s)
      B. Maity, S. Abe, T. Ueno
    • Total Pages
      472
    • Publisher
      Wiley
    • ISBN
      9780128141977
  • [Book] 生命機能に迫る分子化学2018

    • Author(s)
      上野隆史
    • Total Pages
      204
    • Publisher
      化学同人
  • [Remarks] Ueno Lab

    • URL

      http://www.ueno.bio.titech.ac.jp/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 融合タンパク質及びその使用2018

    • Inventor(s)
      上野隆史、亀山詩織
    • Industrial Property Rights Holder
      上野隆史、亀山詩織
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2018-088420

URL: 

Published: 2019-12-27  

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