• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Development and characterization of small molecules for analysis of circadian rhythm amplitude

Research Project

Project/Area Number 18K19171
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

廣田 毅  名古屋大学, トランスフォーマティブ生命分子研究所, 特任准教授 (50372412)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Keywords概日時計 / ケミカルバイオロジー / 化合物 / 振幅
Outline of Annual Research Achievements

概日時計は分子から個体の各階層を時間・空間的に統合して多様な生理現象の日内リズムを生み出す。申請者はケミカルバイオロジーの手法を応用し、概日リズムの周期を変化させる新規化合物を発見して鍵となる制御機構を明らかにしてきた。一方、核内受容体REV-ERBαの生化学的な解析から、この因子のリン酸化を介した分解調節が概日リズムの振幅に影響することを見出した。振幅は肥満や老化によって減少し、生理機能の調節における重要性が知られているものの、分子レベルの理解が遅れている。本研究では振幅を増加させる新規化合物を見出し、標的タンパク質の同定と解析から振幅制御の理解に突破口を開くとともに、肥満や老化に応用する起点とする。本年度は、同定した化合物の誘導体の効果を解析して振幅調節に必要な部位を明らかにした。さらに、化合物の作用解析から標的タンパク質の候補を絞り込んだ。このタンパク質に対する既知の阻害剤ならびに遺伝子ノックダウンがともにルシフェラーゼレポーターリズムの振幅を増加させたことから、見出した化合物はこのタンパク質に対する新規の阻害剤であると考えられる。並行して、概日リズムの周期延長と振幅増加を引き起こす化合物として以前に見出したlongdaysinを用い、ケージド化合物を開発した。この化合物は暗条件では活性をもたず、紫色光の照射によって活性化し、標的タンパク質であるCKIを阻害した。この化合物を用い、濃度および光照射時間に依存して精密に概日リズムを制御することに成功した。

  • Research Products

    (15 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Southern California/University of California Santa Cruz/California Institute of Technology(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Southern California/University of California Santa Cruz/California Institute of Technology
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] University of Groningen(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      University of Groningen
  • [Journal Article] Isoform-selective regulation of mammalian cryptochromes2020

    • Author(s)
      Miller Simon、Son You Lee、Aikawa Yoshiki、Makino Eri、Nagai Yoshiko、Srivastava Ashutosh、Oshima Tsuyoshi、Sugiyama Akiko、Hara Aya、Abe Kazuhiro、Hirata Kunio、Oishi Shinya、Hagihara Shinya、Sato Ayato、Tama Florence、Itami Kenichiro、Kay Steve A.、Hatori Megumi、Hirota Tsuyoshi
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41589-020-0505-1

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dynamics at the serine loop underlie differential affinity of cryptochromes for CLOCK:BMAL1 to control circadian timing2020

    • Author(s)
      Fribourgh Jennifer L、Srivastava Ashutosh、Sandate Colby R、Michael Alicia K、Hsu Peter L、Rakers Christin、Nguyen Leslee T、Torgrimson Megan R、Parico Gian Carlo G、Tripathi Sarvind、Zheng Ning、Lander Gabriel C、Hirota Tsuyoshi、Tama Florence、Partch Carrie L
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 9 Pages: e55275

    • DOI

      10.7554/eLife.55275

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Pharmacological Interventions to Circadian Clocks and Their Molecular Bases2020

    • Author(s)
      Miller Simon、Hirota Tsuyoshi
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.01.003

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Controlling the Circadian Clock with High Temporal Resolution through Photodosing2019

    • Author(s)
      Kolarski Dusan、Sugiyama Akiko、Breton Ghislain、Rakers Christin、Ono Daisuke、Schulte Albert、Tama Florence、Itami Kenichiro、Szymanski Wiktor、Hirota Tsuyoshi、Feringa Ben L.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 141 Pages: 15784~15791

    • DOI

      10.1021/jacs.9b05445

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of pathways that regulate circadian rhythms using a larval zebrafish small molecule screen2019

    • Author(s)
      Mosser Eric A.、Chiu Cindy N.、Tamai T. Katherine、Hirota Tsuyoshi、Li Suna、Hui May、Wang Amy、Singh Chanpreet、Giovanni Andrew、Kay Steve A.、Prober David A.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 12405

    • DOI

      10.1038/s41598-019-48914-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chemical Synthesis of Atomically Tailored SUMO E2 Conjugating Enzymes for the Formation of Covalently Linked SUMO?E2?E3 Ligase Ternary Complexes2019

    • Author(s)
      Zhang Yinfeng、Hirota Tsuyoshi、Kuwata Keiko、Oishi Shunsuke、Gramani Subramanian G.、Bode Jeffrey W.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 141 Pages: 14742~14751

    • DOI

      10.1021/jacs.9b06820

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Casein kinase 1 family regulates PRR5 and TOC1 in the Arabidopsis circadian clock2019

    • Author(s)
      Uehara TN、Mizutani Y、Kuwata K、Hirota T、Sato A、Mizoi J、Takao S、Matsuo H、Suzuki T、Ito S、Saito AN、Nishiwaki-Ohkawa T、Yamaguchi-Shinozaki K、Yoshimura T、Kay SA、Itami K、Kinoshita T、Yamaguchi J、Nakamichi N
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 11528~11536

    • DOI

      10.1073/pnas.1903357116

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Small molecule modulators of the circadian clock function2020

    • Author(s)
      Tsuyoshi Hirota
    • Organizer
      日本薬理学会 第93回年会
    • Invited
  • [Presentation] 哺乳類CRYタンパク質のアイソフォーム選択的な制御2019

    • Author(s)
      廣田 毅
    • Organizer
      第2回構造生命科学研究会
  • [Presentation] 概日時計タンパク質を標的とする低分子化合物2019

    • Author(s)
      廣田 毅
    • Organizer
      2019年度BINDS公開シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Chemical and structural biology approach for circadian biochemistry of clock proteins2019

    • Author(s)
      Tsuyoshi Hirota
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Small molecule modulators of mammalian clock proteins2019

    • Author(s)
      Tsuyoshi Hirota
    • Organizer
      2019 CIBR Beijing Conference on Brain & Behavior
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所Kay-廣田グループ

    • URL

      http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/kay-hirota_group/

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi