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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the mechanism of extracellular membrane vesicle production with a novel bacterium that abundantly produces vesicles and their application

Research Project

Project/Area Number 18K19178
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

栗原 達夫  京都大学, 化学研究所, 教授 (70243087)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2021-03-31
Keywords細胞外膜小胞 / タンパク質輸送 / タンパク質分泌 / 表層糖鎖
Outline of Annual Research Achievements

【膜小胞積荷タンパク質の機能】細胞外膜小胞高生産性のグラム陰性細菌Shewanella vesiculosa HM13は、膜小胞の主要な積荷として49 kDaのタンパク質P49を生産する。立体構造予測サーバーI-TASSERでの解析により、P49がS-layerタンパク質と類似した立体構造をもつことが示唆された。S-layerタンパク質としての機能を想定して調べた結果、P49がバイオフィルム形成や接着に関与することが示された。HM13株は魚類腸内細菌であり、P49が宿主との相互作用に関与する可能性が考えられた。
【膜小胞へのタンパク質積み込み機構】HM13株のゲノム上でP49遺伝子近傍の遺伝子群がコードするタンパク質群のP49膜小胞積み込みへの関与を解析した。P49遺伝子上流にコードされるII型分泌装置ホモログの欠損株ではP49が細胞に蓄積し、本装置のP49細胞外移行への関与が示された。一方、P49遺伝子下流にコードされる表層糖鎖生合成関連タンパク質群の欠損株では、P49は細胞外に分泌されるものの、膜小胞には積み込まれなかった。また、P49欠損株由来の膜小胞と精製P49をin vitroでインキュベートしたところ、P49が膜小胞に積み込まれたのに対し、上記の表層糖鎖生合成関連タンパク質群の欠損株由来の膜小胞にはP49は積み込まれなかった。以上の結果から、P49は表層糖鎖との相互作用を介して膜小胞に積み込まれることが示唆された。
【膜小胞形成に関与する因子】HM13株の膜小胞生産量が培地中のリシン濃度依存的に増加することを見いだし、この応答にセンサータンパク質ホモログHM1275が関与することを見いだした。一方、外膜とペプチドグリカンを架橋するリポタンパク質や、ペプチドグリカンとリポタンパク質の架橋形成を触媒する酵素の欠損により、膜小胞生産性が向上することを見いだした。

  • Research Products

    (11 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Naples "Federico II"(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      University of Naples "Federico II"
  • [Journal Article] Identification of a Putative Sensor Protein Involved in Regulation of Vesicle Production by a Hypervesiculating Bacterium, Shewanella vesiculosa HM132021

    • Author(s)
      Fumiaki Yokoyama、Tomoya Imai、Wataru Aoki、Mitsuyoshi Ueda、Jun Kawamoto、Tatsuo Kurihara
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: 629023

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.629023

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genetic characterization and functional implications of the gene cluster for selective protein transport to extracellular membrane vesicles of Shewanella vesiculosa HM132020

    • Author(s)
      Kouhei Kamasaka、Jun Kawamoto、Chen Chen、Fumiaki Yokoyama、Tomoya Imai、Takuya Ogawa、Tatsuo Kurihara
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 526 Pages: 525~531

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.03.125

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detailed Structural Characterization of the Lipooligosaccharide from the Extracellular Membrane Vesicles of Shewanella vesiculosa HM132020

    • Author(s)
      Rossella Di Guida、Angela Casillo、Fumiaki Yokoyama、Jun Kawamoto、Tatsuo Kurihara、Maria Michela Corsaro
    • Journal Title

      Marine Drugs

      Volume: 18 Pages: 231~231

    • DOI

      10.3390/md18050231

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of a Simple and Rapid Method for In Situ Vesicle Detection in Cultured Media2020

    • Author(s)
      Kenichi Kawano、Fumiaki Yokoyama、Jun Kawamoto、Takuya Ogawa、Tatsuo Kurihara、Shiroh Futaki
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 432 Pages: 5876~5888

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.09.009

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 膜小胞高生産性細菌 Shewanella vesiculosa HM13 における細胞外膜小胞生産の分子基盤2021

    • Author(s)
      栗原達夫
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Invited
  • [Presentation] 細胞外膜小胞へのタンパク質輸送における Wzx フリッパーゼホモログの機能2020

    • Author(s)
      釜阪紘平、川本純、小川拓哉、栗原達夫
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
  • [Presentation] 低温菌 Shewanella vesiculosa HM13 における膜小胞生産への膜リン脂質の関与2020

    • Author(s)
      中野咲梨、小川拓哉、川本純、栗原達夫
    • Organizer
      第21回極限環境生物学会年会
  • [Presentation] Shewanella vesiculosa HM13 の表層糖鎖合成酵素による細胞外膜小胞構造と積荷タンパク質輸送の制御2020

    • Author(s)
      都築大空、釡阪紘平、Liu Yuying、今井友也、川本純、小川拓哉、栗原達夫
    • Organizer
      第21回極限環境生物学会年会
  • [Presentation] 細菌の細胞外膜小胞へのタンパク質輸送機構2020

    • Author(s)
      栗原達夫
    • Organizer
      令和2年度日本農芸化学会東北支部シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Mechanistic analysis of protein transport to extracellular membrane vesicles of a hypervesiculating bacterial strain, Shewanella vesiculosa HM132020

    • Author(s)
      Tatsuo Kurihara
    • Organizer
      ASEMV2020 (Annual meeting of the American Society for Exosomes and Microvesicles)
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2021-12-27  

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