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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Development and application of expression system for active selenoproteins

Research Project

Project/Area Number 18K19189
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

三原 久明  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30324693)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 戸部 隆太  立命館大学, 生命科学部, 講師 (00758823)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Keywordsセレンタンパク質 / SECIS
Outline of Annual Research Achievements

セレンタンパク質は、21番目のタンパク質構成アミノ酸であるセレノシステイン (Sec) 残基が特異的に挿入されたタンパク質の総称であり、真核生物や細菌、アーキアに広く存在している。Sec は、本来タンパク質の翻訳が終結する終止コドン UGA によってコードされている。UGA をSecとして翻訳するためには、mRNAのUGA下流に存在してステム-ループ型二次構造を形成するセレノシステイン挿入配列 (SECIS) と、それに結合する特殊な翻訳伸長因子 (SelB)が必要である。複数種の異なるセレンタンパク質をもつ生物において、各々のセレンタンパク質mRNAのSECIS の配列、長さ、形状には多様性が認められる。このように多様なSECISをSelBがどのようにして認識するのかは未だ解明されていない。また一方で、ある特定の生物種のセレンタンパク質遺伝子を異種宿主内で発現させる場合に、異種のSECISへの宿主SelBの結合がうまく行かずに翻訳が進まないことがある。本研究では、様々な生物種のセレンタンパク質の SECIS が大腸菌において機能し得るかどうかを判別するためのアッセイ系を構築し、Geobacter sulfurreducensが有する9種のセレンタンパク質に対応した SECIS において大腸菌内で機能し得るものを明らかにすることを目的とした。大腸菌宿主において、どのようなSECISが機能しやすいのかを定量的に解析するために、大腸菌のセレンタンパク質であるギ酸脱水素酵素遺伝子(fdhF)の開始コドンからSECIS配列までを含むDNA断片にホタル由来ルシフェラーゼ遺伝子 (fLuc) 断片を連結したコンストラクトを挿入したプラスミドを作製し、SECIS の機能を評価する系を構築した。G. sulfurreducens が有する9種のセレンタンパク質に対応する SECIS を推定し、本アッセイ系を用いて解析を行った。その結果、解析した SECIS のうち5 種が大腸菌内でも機能し得ることが示唆された。

  • Research Products

    (28 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Thapar Institute of Eng. Technol.(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      Thapar Institute of Eng. Technol.
  • [Journal Article] Selenite uptake by outer membrane porin ExtI and its involvement in the subcellular localization of rhodanese-like lipoprotein ExtH in Geobacter sulfurreducens2019

    • Author(s)
      Jahan Mst. Ishrat、Juengwiwattanakitti Panudeth、Izu Yukiko、Tobe Ryuta、Imai Tomoya、Mihara Hisaaki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 516 Pages: 474~479

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.06.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Apolipoprotein E-mediated regulation of selenoprotein P transportation via exosomes2019

    • Author(s)
      Jin, Y., Chung, Y. W., Jung, M. K., Lee, J. H., Ko, K. Y., Jang, J. K., Ham, M., Kang, H., Pack, C. G., Mihara, H., and Kim, I. Y.
    • Journal Title

      Cell Mol Life Sci

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s00018-019-03287-y

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 転写調節因子 NsrR のモリブデン補因子生合成における役割2020

    • Author(s)
      藤田大樹, 西田亮, 戸部隆太 三原久明
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] セレン耐性菌 Cellulomonas sp. D3a 株における亜セレン酸還元機構の解析2020

    • Author(s)
      戸部隆太, 牧村康平, 坂本暁紀, T. N. Prakash, 三原久明
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] Pseudomonas putida KT2440株由来D-リジントランスポーターによる基質認識2020

    • Author(s)
      三原久明, S. Champas, 山内美咲, 戸部隆太
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] 大腸菌におけるセレン酸・テルル酸還元関連遺伝子群の解析2019

    • Author(s)
      藤田大樹, 森聡美, 西田亮, 安間友香理, 田島寛隆, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      第36回日本微量栄養素学会学術集会
  • [Presentation] 大腸菌におけるセレン酸・テルル酸還元関連遺伝子群の解析2019

    • Author(s)
      藤田大樹, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      メタルバイオサイエンス研究会2019
  • [Presentation] Bacillus sp. NTP-1由来新奇DMSOレダクターゼファミリー酵素の研究2019

    • Author(s)
      葛野侑香, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      酵素・補酵素研究会2019
  • [Presentation] Geobacter sulfurreducens由来のロダネーゼ様酵素ExtHの精製条件検討と諸性質解析2019

    • Author(s)
      石戸雄大, 山根祥延, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      第62回日本生化学会近畿支部例会
  • [Presentation] ペルオキシダーゼ活性を有するTruncated hemoglobin (YjbI) の過酸化水素に対する反応2019

    • Author(s)
      田中麻衣, 今井岳志, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      日本生物高分子学会2019年度大会
  • [Presentation] Bacillus属細菌のテルル酸還元酵素の同定2019

    • Author(s)
      渡邊樹, 生田帆河, 戸部隆太, 川本純, 栗原達夫, 広瀬侑, 今井友也, N. T. Prakash, 三原久明
    • Organizer
      第30回日本微量元素学会学術集会
  • [Presentation] Bacillus subtilisのテルル酸還元メカニズムの解明2019

    • Author(s)
      渡邊樹, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      メタルバイオサイエンス研究会2019
  • [Presentation] タンパク質の工学的創製と高活性セレンタンパク質2019

    • Author(s)
      戸部隆太, 川上百香, 三原久明
    • Organizer
      メタルバイオサイエンス研究会2019
    • Invited
  • [Presentation] Geobacter sulfurreducensのマルチヘムセレンタンパク質型亜セレン酸還元酵素の機能・構造解析2019

    • Author(s)
      戸部隆太, 吉澤拓也, 伊豆由記子, 吉村文太, 松村浩由, 三原久明
    • Organizer
      第5回日本セレン研究会
  • [Presentation] 大腸菌ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼが触媒する複数反応2019

    • Author(s)
      大場杏奈, 吉田吉孝, 石田哲夫, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      日本ビタミン学会第71回大会
  • [Presentation] 大腸菌ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼの触媒特性について2019

    • Author(s)
      三原久明, 大場杏奈, 吉田吉孝, 石田哲夫, 戸部隆太
    • Organizer
      第457回ビタミンB研究協議会
  • [Presentation] Pseudomonas putidaのD-リジントランスポーターの基質特異性2019

    • Author(s)
      三原久明
    • Organizer
      第458回ビタミンB研究協議会
  • [Presentation] Function and structure of multiheme-containing selenoprotein2019

    • Author(s)
      Ryuta Tobe, T. Yoshizawa, Y. Izu, M. I. Jahan, B. Yoshimura, H. Matsumura, H. Mihara
    • Organizer
      The 8th International Selenium Conference (Se2019)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Role of outer membrane porin ExtI in selenite reduction in a metal-reducing bacterium2019

    • Author(s)
      H. Mihara, M. I. Jahan, P. Juengwiwattanakitti, Y. Izu, R. Tobe
    • Organizer
      The 8th International Selenium Conference (Se2019)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A novel selenite-reducing system in the dissimilatory metal-reducing bacterium Geobacter sulfurreducens2019

    • Author(s)
      H. Mihara, M. I. Jahan, M. Jinno, N. Shimamoto, Y. Ishido, P. Juengwiwattanakitti, Y. Izu, R. Tobe
    • Organizer
      Goldschmidt 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Selenium metabolism in bacteria2019

    • Author(s)
      H. Mihara
    • Organizer
      The 1st International Workshop on Metallomoics and Nanoparticles
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Interaction between rhodanese-related sulfurtransferase ExtH and outer membrane porin ExtI in Geobacter sulfurreducens2019

    • Author(s)
      P. Juengwiwattanakitti, M. I. Jahan, Y. Izu, Y. Ishido, R. Tobe, H. Mihara
    • Organizer
      第5回日本セレン研究会
  • [Presentation] Purification of glyoxylate oxidase from Gluconobacter dioxyacetonicus A152019

    • Author(s)
      K. Jakkaphan, R. Tobe, H. Mihara
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
  • [Presentation] The NsrR is essential for the function of selenate/tellurate reductase via activation of the moeA gene in Escherichia coli2019

    • Author(s)
      Daiki FUJITA, Ryo NISHIDA, Ryuta TOBE, H. MIHARA
    • Organizer
      The 1st International Workshop on Metallomoics and Nanoparticles
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Substrate specificity of DlcA of D-lysine ABC transporter from Psuedomonas putida2019

    • Author(s)
      S. Champas, M. Yamauchi, R. Tobe, H. Mihara
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同神戸大会
  • [Presentation] Characterization of the substrate-binding protein DlcA of D-lysine transporter from Pseudomonas putida KT24402019

    • Author(s)
      S. Champas, M. Yamauchi, R. Tobe, H. Mihara
    • Organizer
      第36回日本微量栄養素学会学術集会
  • [Remarks] 立命館大学 研究者学術情報 データベース

    • URL

      http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/64/0006361/profile.html

URL: 

Published: 2021-01-27  

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