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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the signaling pathways that induce gene amplification

Research Project

Project/Area Number 18K19281
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

中山 啓子  東北大学, 医学系研究科, 教授 (60294972)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 城田 松之  東北大学, 医学系研究科, 講師 (00549462)
舟山 亮  東北大学, 医学系研究科, 助教 (20452295)
中川 直  東北大学, 医学系研究科, 助教 (30707013)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Keywords遺伝子増幅 / TGF-β刺激 / Myc遺伝子 / シグナル伝達経路
Outline of Annual Research Achievements

遺伝子の過剰な増幅を誘導するシグナル伝達経路を明らかにすることを目的として本研究を行った。私たちは、TGF-βシグナルの活性化による特異的にかつ再現性を持ったマウス染色体15番上のがん遺伝子myc を含む領域とその近接する領域が遺伝子増幅することを見出している。そこで、このシステムを活用して、遺伝子増幅を誘導するファクターの同定を試みた。
まず、遺伝子増幅を起こすシグナル経路の探索を行った。TGF-β刺激によってどのようなタイムコースで増幅が起こるか探索を行ったところ、刺激開始後2日目ですでに細胞の増殖は停止したが、刺激後7日目でも遺伝子増幅は認められなかったが、28日目には増幅が起こっていた。
TGF-βの下流分子として知られているSMAD2の遺伝子増幅へ関与を検討するために、SMAD2の発現誘導株を作製した。また、遺伝子増幅領域に存在するタンパク質を探索するために、遺伝子増幅領域に特異的に結合する3xFLAG-dCas9を作製し、それに結合するタンパク質の探索した。
増幅した遺伝子の核内局在を調べるためにTGF-β刺激後、時間経過を追って細胞を回収し、FISH (Fluorescent in situ hybridization)によって、この増幅した遺伝子が細胞内のどこに存在するか確認を行った。その結果、増幅遺伝子はタンデムに増幅していることが確認され、該当するゲノム領域に増幅を誘導する配列が存在することが示唆された。
一方、CRISPR-Cas9 ライブラリーシステムを用いて網羅的なゲノムスクリーニングを行い、アポトーシスを指標として遺伝子増幅に必要なシグナル経路の同定を試みた。遺伝子増幅が起こるAbcd2遺伝子領域に Caspase-ER(T2)遺伝子を挿入し、遺伝子増幅するとtamoxifenの培地添加によってアポトーシスが誘導できる細胞の作製を行った。

  • Research Products

    (16 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 7 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Metabolic and pathologic profiles of human LSS deficiency recapitulated in mice2020

    • Author(s)
      Wada Yoichi、Kikuchi Atsuo、Kaga Akimune、Shimizu Naoki、Ito Junya、Onuma Ryo、Fujishima Fumiyoshi、Totsune Eriko、Sato Ryo、Niihori Tetsuya、Shirota Matsuyuki、Funayama Ryo、Sato Kota、Nakazawa Toru、Nakayama Keiko、Aoki Yoko、Aiba Setsuya、Nakagawa Kiyotaka、Kure Shigeo
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 16 Pages: e1008628~8628

    • DOI

      doi: 10.1371/journal.pgen.1008628

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Study profile of The Tohoku Medical Megabank Community-Based Cohort Study2020

    • Author(s)
      Hozawa Atsushi、Tanno Kozo et.al
    • Journal Title

      Journal of Epidemiology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      doi: 10.2188/jea.JE20190271

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Variants That Affect Function of Calcium Channel TRPV6 Are Associated With Early-Onset Chronic Pancreatitis2020

    • Author(s)
      Masamune Atsushi、Kotani Hiroshi et.al
    • Journal Title

      Gastroenterology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      doi: 10.1053/j.gastro.2020.01.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] BACH1 Promotes Pancreatic Cancer Metastasis by Repressing Epithelial Genes and Enhancing Epithelial-Mesenchymal Transition2020

    • Author(s)
      Sato Masaki、Matsumoto Mitsuyo、Saiki Yuriko、Alam Mahabub、Nishizawa Hironari、Rokugo Masahiro、Brydun Andrey、Yamada Shinji、Kaneko Mika K.、Funayama Ryo、Ito Mamoru、Kato Yukinari、Nakayama Keiko、Unno Michiaki、Igarashi Kazuhiko
    • Journal Title

      Cancer Research

      Volume: 80 Pages: 1279~1292

    • DOI

      doi: 10.1158/0008-5472.CAN-18-4099

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Knockout Mouse Models Provide Insight into the Biological Functions of CRL1 Components2020

    • Author(s)
      Nakagawa Tadashi、Nakayama Keiko、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      Adv Exp Med Biol

      Volume: - Pages: 147~171

    • DOI

      doi: 10.1007/978-981-15-1025-0_10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biallelic variants/mutations of IL1RAP in patients with steroid-sensitive nephrotic syndrome2019

    • Author(s)
      Niitsuma Sou、Kudo Hiroki、Kikuchi Atsuo、Hayashi Takaya、Kumakura Satoshi、Kobayashi Shuhei、Okuyama Yuko、Kumagai Naonori、Niihori Tetsuya、Aoki Yoko、So Takanori、Funayama Ryo、Nakayama Keiko、Shirota Matsuyuki、Kondo Shuji、Kagami Shoji、Tsukaguchi Hiroyasu、Iijima Kazumoto、Kure Shigeo、Ishii Naoto
    • Journal Title

      International Immunology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      doi: 10.1093/intimm/dxz081

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pathogenic mutations in the ALS gene CCNF cause cytoplasmic mislocalization of Cyclin F and elevated VCP ATPase activity2019

    • Author(s)
      Yu Yujiao、Nakagawa Tadashi、Morohoshi Akane、Nakagawa Makiko、Ishida Noriko、Suzuki Naoki、Aoki Masashi、Nakayama Keiko
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics

      Volume: 28 Pages: 3486~3497

    • DOI

      doi: 10.1093/hmg/ddz119

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of NRAS mutation in cell-free DNA biological fluids from patients with kaposiform lymphangiomatosis2019

    • Author(s)
      Ozeki Michio、Aoki Yoko、Nozawa Akifumi、Yasue Shiho、Endo Saori、Hori Yumiko、Matsuoka Kentaro、Niihori Tetsuya、Funayama Ryo、Shirota Matsuyuki、Nakayama Keiko、Fukao Toshiyuki
    • Journal Title

      Orphanet Journal of Rare Diseases

      Volume: 14 Pages: -

    • DOI

      doi: 10.1186/s13023-019-1191-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cohort Profile: Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study (TMM BirThree Cohort Study): Rationale, Progress and Perspective2019

    • Author(s)
      Kuriyama Shinichi、Metoki Hirohito et al. Tohoku Medical Megabank Project Study Group, Kure S, Yaegashi N, Yamamoto M.
    • Journal Title

      International Journal of Epidemiology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      doi: 10.1093/ije/dyz169

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cancer‐associated fibroblasts secrete Wnt2 to promote cancer progression in colorectal cancer2019

    • Author(s)
      Aizawa Takashi、Karasawa Hideaki、Funayama Ryo、Shirota Matsuyuki、Suzuki Takashi、Maeda Shimpei、Suzuki Hideyuki、Yamamura Akihiro、Naitoh Takeshi、Nakayama Keiko、Unno Michiaki
    • Journal Title

      Cancer Medicine

      Volume: 8 Pages: 6370~6382

    • DOI

      doi: 10.1002/cam4.2523

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Aberrant axon branching via Fos-B dysregulation in FUS-ALS motor neurons2019

    • Author(s)
      Akiyama Tetsuya、Suzuki Naoki、Ishikawa Mitsuru、et al.
    • Journal Title

      EBioMedicine

      Volume: 45 Pages: 362~378

    • DOI

      doi: 10.1016/j.ebiom.2019.06.013

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Germline-Activating RRAS2 Mutations Cause Noonan Syndrome2019

    • Author(s)
      Niihori Tetsuya、Nagai Koki、Fujita Atsushi、Ohashi Hirofumi、Okamoto Nobuhiko、Okada Satoshi、Harada Atsuko、Kihara Hirotaka、Arbogast Thomas、Funayama Ryo、Shirota Matsuyuki、Nakayama Keiko、Abe Taiki、Inoue Shin-ichi、Tsai I-Chun、Matsumoto Naomichi、Davis Erica E.、Katsanis Nicholas、Aoki Yoko
    • Journal Title

      The American Journal of Human Genetics

      Volume: 104 Pages: 1233~1240

    • DOI

      doi: 10.1016/j.ajhg.2019.04.014

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 蛋白分解異常による新規筋萎縮性側索硬化症の発症機構2019

    • Author(s)
      渡辺 靖章, 中川 直, 鈴木 直輝, 割田 仁, 中山 啓子, 青木 正志
    • Organizer
      第42回日本神経科学大会
  • [Presentation] 知的障害・自閉症関連因子SETD5によるrDNAのエピジェネティック制御2019

    • Author(s)
      中川 直, 中山 啓子
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Alternative Splicing of FBLN2 generates two proteins with different N-linked glycosylation patterns2019

    • Author(s)
      Wei Chen Kao,Ryo Funayama, Keiko Nakayama
    • Organizer
      第42回日本神経科学大会
  • [Remarks] 東北大学大学院医学系研究科附属創生応用医学研究センターがん医学コアセンター細胞増殖制御分野

    • URL

      http://www.devgen.med.tohoku.ac.jp/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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