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2019 Fiscal Year Annual Research Report

A disease therapy by read-through of nonsense mutations via artificial nucleobase modification

Research Project

Project/Area Number 18K19288
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

塚原 俊文  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (60207339)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 盛 真友  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 研究員 (90466772)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Keywords修飾塩基 / リードスルー / 遺伝コード修復 / 終止コドン / 無細胞翻訳系 / 合成RNA / IRES
Outline of Annual Research Achievements

終止コドンのUをΨ(Pseudouridine)に変換することで終止コドンがリードスルーされることが示されている。本研究はナンセンス変異を原因とする疾患の治療法として、Ψ以外の修飾塩基を用いることで翻訳リードスルーが実現するか否かを検証し、またリードスルー化に有効な修飾塩基を同定することを目標としている。昨年度までにin vitro翻訳系で、終止コドンに修飾塩基を含んだ全合成RNAを用いたタンパク質合成実験系を確立したが、翻訳効率が低いため、実験の再現性に問題があった。本年度は合成RNAの上流にSD(Shine‐Dalgarno)配列を付加することで翻訳効率を改善し、検証可能な実験系を確立することが出来た。具体的にはSD配列RNAと合成RNAを両者に相補的なsplint oligo DNAとRNAリガーゼによって結合させることで、大腸菌由来の無細胞翻訳系での翻訳効率は従来の10倍以上に向上した。同様に、IRES(internal ribosome entry site)配列を合成RNAの上流に結合させることで、哺乳動物由来の無細胞翻訳系でも同様に、再現性良くタンパク質への翻訳確認ができることを確認した。
修飾塩基としてはこれまでに、5-methyl Uおよび5-fluoro Uにin vitro翻訳系での終止コドンではリードスルー現象が発生することを確認した他、新たにAの誘導体であるClitocineに翻訳リードスルー効果を認めた。これらの結果は、終止コドンのAまたはUを部位特異的に修飾することによって、ナンセンス変異を有するmRNAだけを特異的にリードスルーできることを示した。即ち、細胞内で塩基配列特異的にAまたはUを修飾することができればナンセンス変異はリードスルーされ、完全長タンパク質の翻訳が実現できることが示唆され、翻訳リードスルー療法に新しい可能性が拓かれた。

  • Research Products

    (8 results)

All 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] The m6A methyltransferase METTL3 contributes to Transforming Growth Factor-beta-induced epithelial-mesenchymal transition of lung cancer cells through the regulation of JUNB2020

    • Author(s)
      Sasithorn Wanna-Udom, Minoru Terashima, Hanbing Lyu, Akihiko Ishimura, Takahisa Takino, Matomo Sakari, Toshifumi Tsukahara, Takeshi Suzuki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 524 Pages: 150 - 155

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2020.01.042

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of Tissue-specific RNA Editing Events of Genes Involved in RNA Editing in Arabidopsis thaliana2019

    • Author(s)
      Umme Qulsum, Md Thoufic Anam Azad, Toshifumi Tsukahara
    • Journal Title

      Journal of Plant Biology

      Volume: 62 Pages: 351 - 358

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/s12374-018-0452-5

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comparative Activity of Adenosine Deaminase Acting on RNA (ADARs) Isoforms for Correction of Genetic Code in Gene Therapy2019

    • Author(s)
      Md. Thoufic Anam Azad, Umme Qulsum, Toshifumi Tsukahar
    • Journal Title

      Current Gene Therapy

      Volume: 19 Pages: 31 - 39

    • DOI

      https://doi.org/10.2174/1566523218666181114122116

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genetic Code Rest oration by Using Artificial RNA Editing for G to A mutated mRNAs2019

    • Author(s)
      Toshifumi Tsukahara, Sonali Bhakta, Md. Thoufic Anam Azad
    • Organizer
      World Congress of Molecular & Cell Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Artificial RNA Editing in (BFP) Blue Fluorescence Protein (Derivative of GFP) by Using APOBEC1 Deaminase for Restoration of Genetic Code2019

    • Author(s)
      Sonali Bhakta, Md. Thoufic Anam Azad, Toshifumi Tsukahara,
    • Organizer
      World Congress of Molecular & Cell Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Application of CRISPR-Cas13 machinery to disease treatment2019

    • Author(s)
      Saifullah, Matomo Sakari, Toshifumi Tsukahara
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Genetic code restoration by using APOBEC1 artificial cytidine deaminase2019

    • Author(s)
      Sonali Bhakta and Toshifumi Tsukahara
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Investigation of tissue-specific alternative splicing of Organelle RNA Recognition Motif(ORRM) family genes in Arabidopsis thaliana2019

    • Author(s)
      John MW Munene and Toshifumi Tsukahara
    • Organizer
      日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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