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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanism by which plants in autumn sense the winter coming through noisy changes in air temperature

Research Project

Project/Area Number 18K19319
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

河村 幸男  岩手大学, 農学部, 准教授 (10400186)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2022-03-31
Keywords低温馴化 / 植物 / 冬季感知 / 温度ノイズ / 季節情報 / 機械学習
Outline of Annual Research Achievements

本研究では植物の野外における秋から初冬にかけての冬季感知メカニズムの解明を目指す。特に、1)植物が冬季感知に利用している環境パラメーターの特定、2) その分子メカニズムの解明、を目標とする。 1の項目では、昨年度に引き続き、凍結耐性と気象データとの関連を機械学習により解析を行った。昨年度は、凍結耐性の季節的な変遷は、馴化期間中の葉温データのみでほぼ100%予測できることを報告したが、この予測には未知データ予測による検証は含まれていなかった。そこで、一個抜き交差法による未知データ予測を検討したところ、予測値と実験値とのズレは-0.056±1.5°C(ズレの平均値±標準偏差)であり、それなりの予測は出来ているが正確なシュミレーションを行うにはまだ精度不足であることが明らかとなった。そこで、2021年9月から2022年4月にかけて追加の野外実験を行った。解析終了後に、2018年のデータと組み合わせ、機械学習による解析を行う予定である。次に、2の項目の分子メカニズムの解明では、フィトクロム(phyB)欠損株を用いた解析を、9月下旬(最大23℃最低15℃)、11月初旬(最大15℃最低7℃)12月中旬(最大5℃最低0℃)における気温の日周変化を再現した人工気象器で行い、フィトクロムを介した日長による低温馴化制御について検討を行った。それぞれの温度区で12時間日長(9月)、11時間日長(11月)、9.5時間日長(12月)を検討したところ、まず、9月や11月の気温では日長の影響は僅かであり、また、フィトクロムを介した影響も同様であった。一方で、12月の気温では、野生型では日長の影響はあまり見られなかったが、フィトクロム欠損株では日長が短くなると凍結耐性が低下する傾向が見られた。すなわち、フィトクロムPHYBは、野外では晩秋よりも真冬において凍結耐性を上昇させるために働いていると予想された。

  • Research Products

    (3 results)

All 2021

All Presentation (3 results)

  • [Presentation] 野外でのシロイヌナズナの凍結耐性の季節的変遷と機械学習によるその予測2021

    • Author(s)
      河村幸男、上村松生
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会(東京(オンライン大会))
  • [Presentation] フィトクロムを介した日長および温度による低温誘導性遺伝子の発現制御とその解析2021

    • Author(s)
      笠松勇登、上村松生、河村幸男
    • Organizer
      東北植物学会第11回大会(福島)
  • [Presentation] 光を介した低温馴化プロセスにおけるクリプトクロムの役割2021

    • Author(s)
      下平基、高橋亜未、上村松生、河村幸男
    • Organizer
      東北植物学会第11回大会(福島)

URL: 

Published: 2022-12-28  

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