2021 Fiscal Year Annual Research Report
Construction of chimeric bacteria and analysis of host specificity determination mechanism of pathogenic bacteria
Project/Area Number |
18K19446
|
Research Institution | Osaka University |
Principal Investigator |
堀口 安彦 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (00183939)
|
Project Period (FY) |
2018-06-29 – 2022-03-31
|
Keywords | 細胞融合 / 気管支敗血症菌 / パラ百日咳菌 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、病原性細菌の宿主特異性の決定機構を遺伝子レベルで解析することにある。この目的を達成するために、全体的なゲノム構造はよく類似するがヒトにのみ感染するパラ百日咳菌と広範な哺乳動物種を宿主とする気管支敗血症菌を融合させて、ヒト以外の実験動物に感染するキメラ細菌の作製を試みた。その結果、ゲノム交雑の可能性を示す候補株が分離できた。それら全ての株のゲノム配列解析を決定したところ、明らかなゲノムの交雑を示す菌株は見出せなかった。しかし一方で、4株に一部のゲノム領域の逆位が認められた。これらのゲノム逆位は相互に相同性の高いfhaB遺伝子とfhaSの間で生じており、逆位領域は700 kbpに及んでいた。本研究課題のキメラ細菌の作製とは目的が異なるが、この新知見の現象をさらに探索するため、該当の逆位を検出する方法を開発し、逆位の発生頻度や機序の解析を目指した。そこで、ゲノム中の逆位の存否を簡便に検出するPCR法を確立するため、fhaSおよびfhaBの接続領域近辺の遺伝子配列をもとに種々のプローブのデザインを試みたが、fhaB遺伝子とfhaS遺伝子相同領域がきわめて長いため、明らかな逆位を検出する方法を構築することができなかった。また、遺伝子逆位のある菌株の表現型を親株と比較したが、明らかな違いは認められなかった。この遺伝子逆位のある4株は研究室内で保管し、引き続き解析に当たるべく方法論を検討中である。
|
Research Products
(10 results)