2018 Fiscal Year Research-status Report
Comprehensive analysis of gut microbiome and sarcopenia in gastrointestinal cancers
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18K19586
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Research Institution | Kumamoto University |
Principal Investigator |
馬場 秀夫 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (20240905)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
馬場 祥史 熊本大学, 医学部附属病院, 特任講師 (20599708)
石本 崇胤 熊本大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (00594889)
美馬 浩介 熊本大学, 医学部附属病院, 非常勤診療医師 (00546559)
原田 和人 熊本大学, 医学部附属病院, 非常勤診療医師 (70608869)
今村 裕 公益財団法人がん研究会, 有明病院 消化器外科, 副医長 (70583045)
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Project Period (FY) |
2018-06-29 – 2020-03-31
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Keywords | Microbiome / 栄養状態 / 食道癌 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、消化器癌切除・再建術後のmicrobiomeの変化を網羅的に解析し、体重減少に影響を及ぼすmicrobiomeを同定することである。食道癌・胃癌に対して切除・再建術を行う患者50例の手術前及び後の糞便からDNAを抽出し、16S rRNAシークエンスによりmicrobiomeの変化を網羅的に評価する予定であり、現在施設倫理委員会の審査を経て、サンプル収集を開始している。術前、及び術後一年での糞便を検体として使用する予定であり、現在までに約30例の糞便サンプルの収集を行っており、順次16S rRNAシーケンスに提出している。海外共同研究者であるDana-Farber Cancer InsituteのDr. Shuji Oginoとも適宜連絡を取っており、今後の解析の際には協力を得られる体制である。 また、栄養状態を評価するために、Prognostic Nutritional Index: PNIのデータベースを構築しており、そのデータベースを用いて、術前の栄養状態と腫瘍免疫の関連を明らかにした。全身栄養状態(PNI)が腫瘍局所免疫に影響を与え、予後にも影響を与えるという結果を、Ann Surg誌に投稿し採択された。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、食道癌・胃癌に対して切除・再建術を行う患者50例の手術前及び後の糞便からDNAを抽出し、16S rRNAシークエンスによりmicrobiomeの変化を網羅的に評価する予定である。現在施設倫理委員会の審査を経て、サンプル収集を開始している。術前、及び術後一年での糞便を検体として使用する予定であり、現在までに約30例の糞便サンプルの収集を行っており、順次16S rRNAシーケンスに提出している。このように、研究はおおむね順調に進捗している。
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Strategy for Future Research Activity |
今後は、16S rRNAシーケンスに提出しているデータを随時網羅的に解析していく予定である。海外共同研究者であるDana-Farber Cancer InstituteのDr. Shuji Oginoとも適宜連絡を取っており、今後の解析の際には協力を得られる体制をとっており、順調に解析が進むと考えている。また、栄養状態を評価するために、Prognostic Nutritional Index: PNIなどを含むデータベースを構築しており、そのデータベースを用いて、統合解析を行っていく予定としている。
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Causes of Carryover |
理由:医局内保管の試薬・消耗品を使用することができたため。 使用計画:主に実験試薬、消耗品の購入に充てたいと考える。また、研究成果発表および情報収集のための旅費、実験データの管理、資料整理等のため事務補佐員の雇用経費にも充てたいと考える。
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Research Products
(6 results)