2020 Fiscal Year Annual Research Report
Dynamic evolution and different pathogenesis of HTLV-1 across multiple continents revealed by next generation sequencing technology
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18KK0230
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
佐藤 賢文 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 教授 (70402807)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
上野 貴将 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 教授 (10322314)
勝屋 弘雄 佐賀大学, 医学部, 助教 (80632041)
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| Project Period (FY) |
2018-10-09 – 2021-03-31
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| Keywords | HTLV-1 / 国際共同研究 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は研究計画に従って、以下の研究を遂行した。
イギリスとの共同研究に関しては、HIV-1, HTLV-1二重感染者の経時的血液検体を用いて、感染細胞のクローン性解析、ウイルス組み込み部位解析を行った。解析の結果、HIV-1, HTLV-1二重感染者血液検体では単感染者に比べ、HIV-1, HTLV-1のいずれの感染クローンも、クローン性増殖が顕著であった。また、重感染者ではＨＩＶ－１のウイルス組み込み部位が、遺伝子間領域に頻度が高いことも判明した。HTLV-1との二重感染による免疫学的機序の結果と考察された。結果をThe Journal of Infectious diseasesに投稿しアクセプトとなった。今年度内にImperial 大学Charles Bangham教授の研究グループとzoomによる合同研究ミーティングを行う、研究進捗の確認と意見交換を行った。また、日英の国際ウェブシンポジウムを開催して日本側２名、イギリス型２名の研究成果発表の機会を設けることで、国際共同研究の加速化を行った。
次に、アフリカのHTLV-1感染状況を探索するために、分担研究者上野と共にMuhimbili大学： Lyamuya教授との共同研究にて同地域のHIV感染者検体約294例の血清サンプルを取得し解析した結果、陽性者が０名で同地域のHTLV感染割合は極めて少ないという結果が判明した。
南アメリカにおけるHTLV-1感染者症例解析に関しては、新型コロナウイルス感染拡大の影響を受けて、現在休止中である。インペリアル大学：Bangham教授研究室から日本に受け入れたJocelyn Turpin博士はイギリス帰国後しばらくしてから、R02年度中にフランスリヨン大学に教員ポストを取得して移動した。レトロウイルス研究を継続中であり、今後の共同研究についてメールにて打ち合わせを継続して行っている。
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[Journal Article] Clonality of HIV-1 and HTLV-1 infected cells in naturally coinfected individuals2021
Author(s)
Katsuya H, Cook L, Rowan AG, Melamed A, Turpin J, Ito J, Islam S, Miyazato P, Tan B, Matsuo M, Miyakawa T, Nakata H, Matsushita S, Taylor GP, Bangham CRM, Kimura S, Satou Y.
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Journal Title
The Journal of Infectious Diseases
Volume: 0
Pages: 0
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] A target enrichment high throughput sequencing system for characterization of BLV whole genome sequence, integration sites, clonality and host SNP2021
Author(s)
Ohnuki N, Kobayashi T, Matsuo M, Nishikaku K, Kusama K, Torii Y, Inagaki Y, Hori M, Imakawa K, Satou Y
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Journal Title
Scientific Reports
Volume: 11
Pages: 4521
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Blood and lymphatic systems are segregated by the FLCN tumor suppressor2020
Author(s)
Tai-Nagara I, Hasumi Y, Kusumoto D, Hasumi H, Okabe K, Ando T, Matsuzaki F, Itoh F, Saya H, Liu C, Mukouyama Y, Linehan W, Liu X, Hirashima M, Suzuki Y, Funasaki S, Satou Y, Furuya M, Baba M, and Kubota Y
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Journal Title
Nature Communications
Volume: 11
Pages: 6314
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Multi-omics investigation revealing comprehensive characteristics of HIV-1-infected cells in vivo2020
Author(s)
Aso H, Nagaoka S, Kawakami E, Ito J, Misawa N, Islam S, Tan B, Nakaoka S, Ashizaki K, Shiroguchi K, Suzuki Y, Satou Y, Koyanagi Y, Sato K
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Journal Title
Cell Reports
Volume: 32
Pages: 107887
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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