2018 Fiscal Year Research-status Report
Joint International Research for identification of disease-susceptible genes and drug-sensitive genes in childhood nephrotic syndrome
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18KK0244
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| Research Institution | Kobe University |
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Principal Investigator |
飯島 一誠 神戸大学, 医学研究科, 教授 (00240854)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
人見 祐基 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 (10525819)
堀之内 智子 神戸大学, 医学研究科, 医学研究員 (30754593)
長野 智那 神戸大学, 医学研究科, 特命助教 (60814316)
野津 寛大 神戸大学, 医学研究科, 特命教授 (70362796)
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| Project Period (FY) |
2018-10-09 – 2021-03-31
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| Keywords | 腎臓学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、日本国内で収集した1,300例を超える小児特発性ネフローゼ症候群患者の血液から単離したDNAを日本人に最適化したSNPsアレイであるジャポニカアレイを用いてタイピングし、そのうちのステロイド感受性ネフローゼ症候群(SSNS)、約1,017例と健常コントロール3,332例によるゲノムワイド関連解析(GWAS)を行ったところ、19番染色体及び9番染色体にゲノムワイド有意(P<5.0E-08)な複数のSNPsを検出した。そのなかから19番染色体から5つ、9番染色体から2つのSNPsを選択し、韓国ソウル大学小児病院で収集した249例のSSNS検体と健常コントロール3,805例を用いてreplication studyを行ったところ、すべてのSNPsでreplicationされた。この時期に、米国及びフランスを中心とするヨーロッパのグループとの共同研究も進行し、彼らの検体を用いたreplication study及び日本、韓国のデータも含めたtrans-ethnic メタ解析を行ったところ、19番染色体のNPHS1領域の2つのSNPsと9番染色体のTNFSF15領域の1つのSNPでゲノムワイド有意な関連が認められた。NPHS1領域の2つのSNPsについては、ミニジーン解析でエクソンスキッピングを誘導することが明らかになり、TNFSF15領域の1つのSNPは、他の研究でTNFSF15のeQTLであることが明らかにされていた。以上のような国際共同研究で、NPHS1とTNFSF15が小児のSSNSの疾患感受性遺伝子であることを世界で初めて明らかにした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
当初の計画よりも大規模な国際共同研究に発展し、HLAクラスII以外の小児SSNSの疾患感受性遺伝子を世界で初めて同定することができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在、平成30年度に得た成果を論文にまとめており、今年度中に国際誌で公表したいと考えている。さらに、SNPsアレイによる韓国人検体のタイピングを実施中であり、可及的速やかにタイピングを完了する。また、タイでの検体及び臨床情報の収集中であるが、可及的速やかに収集を完了し、SNPsアレイによるタイ人のタイピングを実施する。これらのタイピングテータと、既に完了している日本人タイピングデータ、及び米国及びヨーロッパのタイピングデータを統合した国際GWASメタ解析を行い、NPHS1, TNFSF15以外のSSNS疾患感受性遺伝子の同定を試みる。また、日本人、韓国人、タイ人では、ステロイド抵抗性ではあるが免疫抑制薬に反応して寛解となった症例の検体も収集しているので、ステロイド抵抗性vs. ステロイド感受性のGWASを実施し、ステロイド抵抗性に関与するSNPsの同定も試みる予定である。
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Research Products
(21 results)
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[Journal Article] Strong Association of the HLA-DR/DQ Locus with Childhood Steroid-Sensitive Nephrotic Syndrome in the Japanese Population2018
Author(s)
Jia X, Horinouchi T, Hitomi Y, Shono A, Khor SS, Omae Y, Kojima K, Kawai Y, Nagasaki M, Kaku Y, Okamoto T, Ohwada Y, Ohta K, Okuda Y, Fujimaru R, Hatae K, Kumagai N, Sawanobori E, Nakazato H, Ohtsuka Y, Nakanishi K, Shima Y, Tanaka R, Ashida A, Kamei K, Ishikura K, Nozu K, Tokunaga K, Iijima K
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Journal Title
Journal of the American Society of Nephrology
Volume: 29
Pages: 2189～2199
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Mutations in six nephrosis genes delineate a pathogenic pathway amenable to treatment2018
Author(s)
Ashraf S,Kudo H,Rao J,Kikuchi A,Widmeier E,Lawson JA,Tan W,Hermle T,Warejko JK,Shril S,Airik M,Jobst-Schwan T,Lovric S,Braun DA,Gee HY,Schapiro D,Majmundar AJ,Sadowski CE,Pabst WL,Daga A,van der Ven AT,Schmidt JM,Low BC,Gupta AB,Tripathi BK,Wong J,Campbell K,Metcalfe K,Schanze D
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Journal Title
Nature Communications
Volume: 9
Pages: 1960
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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