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2021 Fiscal Year Research-status Report

ウイルスを摂動とする病態発現原理のマルチオミクス解析とその包括的理解

Research Project

Project/Area Number 18KK0447
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

佐藤 佳  東京大学, 医科学研究所, 准教授 (10593684)

Project Period (FY) 2019 – 2022
Keywordsウイルス学
Outline of Annual Research Achievements

本年度では、生体内におけるHIV-1感染細胞の性状の多角的な解析に取り組んだ。HIV-1感染ヒト化マウスとマルチオミクス解析を実施し、生体内における 「真の」HIV-1感染細胞の特徴を多角的に描き出すことに成功した。本研究で用いた研究手法は、きわめて汎用的であり、さまざまなウイルス研究への応用が可能であ る。つまり本研究は、ウイルスと宿主の新たな関係性の一端を明らかにした研究であり、また、ウイルスと宿主の相互作用のさらなる解明や、エイズの制圧法の 開発に向けた基礎学術基盤の形成に直結する研究であると言える。以上の研究成果を、学術論文にまとめ、Cell Reports誌にcorresponding authorとして発表した。
さらに、本研究を通して構築した解析方法を駆使し、新型コロナウイルスに関する研究も実施し、複数の学術論文をcorresponding authorとして発表した。 具体的には、出現が続く新型コロナウイルスの変異株(デルタ株、ラムダ株、ミュー株、オミクロン株)のウイルス学的性状を包括的に解析し、それらを世界に先駆けて解明した。これらの研究成果は、NatureやNew England Journal of Medicine、Cell姉妹誌などに、corresponding authorとして発表した。
しかし、当課題で予定していた渡航と研究打ち合わせは、新型コロナウイルスのパンデミックにより実行できなかったため、オンライン会議を実施することで代替した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

新型コロナウイルスのパンデミックにより、予定していた海外研究機関への渡航が実行できなかったため。研究が停滞しないよう、オンライン会議を定期的に実施し、代替した。当課題は1年繰り越し、予定していた研究は今年度に完遂することを目標とする。

Strategy for Future Research Activity

新型コロナウイルスのパンデミックにより、予定していた海外研究機関への渡航が実行できなかったため。研究が停滞しないよう、オンライン会議を定期的に実施し、代替した。当課題は1年繰り越し、予定していた研究は今年度に完遂することを目標とする。

  • Research Products

    (16 results)

All 2022 2021

All Journal Article (16 results) (of which Int'l Joint Research: 13 results,  Peer Reviewed: 16 results,  Open Access: 15 results)

  • [Journal Article] The SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits enhanced infectivity and immune resistance2022

    • Author(s)
      Kimura Izumi et al.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 38 Pages: 110218~110218

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.110218

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts infectivity and fusogenicity2022

    • Author(s)
      Meng Bo et al.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 603 Pages: 706~714

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04474-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant2022

    • Author(s)
      Suzuki Rigel et al.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 603 Pages: 700~705

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04462-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Characterization of the Immune Resistance of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Mu Variant and the Robust Immunity Induced by Mu Infection2022

    • Author(s)
      Uriu Keiya et al.
    • Journal Title

      The Journal of Infectious Diseases

      Volume: 0 Pages: 0

    • DOI

      10.1093/infdis/jiac053

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Sarbecovirus ORF6 proteins hamper induction of interferon signaling2021

    • Author(s)
      Kimura Izumi、Konno Yoriyuki、Uriu Keiya、Hopfensperger Kristina、Sauter Daniel、Nakagawa So、Sato Kei
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 34 Pages: 108916~108916

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.108916

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comprehensive Investigation on the Interplay between Feline APOBEC3Z3 Proteins and Feline Immunodeficiency Virus Vif Proteins2021

    • Author(s)
      Kosugi Yusuke、Uriu Keiya、Suzuki Narumi、Yamamoto Keisuke、Nagaoka Shumpei、Kimura Izumi、Konno Yoriyuki、Aso Hirofumi、Willett Brian J.、Kobayashi Tomoko、Koyanagi Yoshio、Ueda Mahoko Takahashi、Ito Jumpei、Sato Kei
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 95 Pages: 0

    • DOI

      10.1128/JVI.00178-21

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Elucidation of the Complicated Scenario of Primate APOBEC3 Gene Evolution2021

    • Author(s)
      Uriu Keiya、Kosugi Yusuke、Suzuki Narumi、Ito Jumpei、Sato Kei
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 95 Pages: 0

    • DOI

      10.1128/JVI.00144-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] SARS-CoV-2 spike L452R variant evades cellular immunity and increases infectivity2021

    • Author(s)
      Motozono Chihiro et al.
    • Journal Title

      Cell Host & Microbe

      Volume: 29 Pages: 1124~1136.e11

    • DOI

      10.1016/j.chom.2021.06.006

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SARS-CoV-2 B.1.617 Mutations L452R and E484Q Are Not Synergistic for Antibody Evasion2021

    • Author(s)
      Ferreira Isabella A T M et al.
    • Journal Title

      The Journal of Infectious Diseases

      Volume: 224 Pages: 989~994

    • DOI

      10.1093/infdis/jiab368

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] IFITM proteins promote SARS-CoV-2 infection and are targets for virus inhibition in vitro2021

    • Author(s)
      Prelli Bozzo Caterina et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 0

    • DOI

      10.1038/s41467-021-24817-y

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SARS-CoV-2 B.1.617.2 Delta variant replication and immune evasion2021

    • Author(s)
      Mlcochova Petra et al.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 599 Pages: 114~119

    • DOI

      10.1038/s41586-021-03944-y

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An additional NF-κB site allows HIV-1 subtype C to evade restriction by nuclear PYHIN proteins2021

    • Author(s)
      Bosso Matteo、Sturzel Christina M.、Kmiec Dorota、Badarinarayan Smitha Srinivasachar、Braun Elisabeth、Ito Jumpei、Sato Kei、Hahn Beatrice H.、Sparrer Konstantin M.J.、Sauter Daniel、Kirchhoff Frank
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 36 Pages: 109735~109735

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109735

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Neutralization of the SARS-CoV-2 Mu Variant by Convalescent and Vaccine Serum2021

    • Author(s)
      Uriu Keiya、Kimura Izumi、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi、Nakada Taka-aki、Kaneda Atsushi、Nakagawa So、Sato Kei
    • Journal Title

      New England Journal of Medicine

      Volume: 385 Pages: 2397~2399

    • DOI

      10.1056/NEJMc2114706

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Enhanced fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R mutation2021

    • Author(s)
      Saito Akatsuki et al.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 602 Pages: 300~306

    • DOI

      10.1038/s41586-021-04266-9

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Evolutionary plasticity of SH3 domain binding by Nef proteins of the HIV-1/SIVcpz lentiviral lineage2021

    • Author(s)
      Zhao Zhe、Fagerlund Riku、Tossavainen Helena、Hopfensperger Kristina、Lotke Rishikesh、Srinivasachar Badarinarayan Smitha、Kirchhoff Frank、Permi Perttu、Sato Kei、Sauter Daniel、Saksela Kalle
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 17 Pages: 0

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1009728

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The True Nature of Viruses Elucidated by Systems Virology2021

    • Author(s)
      Sato Kei
    • Journal Title

      Frontiers in Virology

      Volume: 1 Pages: 0

    • DOI

      10.3389/fviro.2021.808865

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2022-12-28  

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