2020 Fiscal Year Final Research Report
Time-series muti-layered omics analysis during gestation period towards precision medicine
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18KT0015
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 特設分野 |
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| Research Field |
Complex Systems Disease Theory
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| Research Institution | Kyoto University (2019-2020)
Tohoku University (2018) |
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Principal Investigator |
Nagasaki Masao 京都大学, スーパーグローバルコース医学生命系ユニット, 特定教授 (90396862)
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| Project Period (FY) |
2018-07-18 – 2021-03-31
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| Keywords | ライフログ / オミクス / メタボローム / 妊娠期間 / 出産 / 統合解析 / ロジスティック回帰 |
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| Outline of Final Research Achievements |
To our time-series multilayered omics profiling information (metabolome and transcriptome) from Japanese pregnant women during pregnancy, we have developed a mathematical model that can explicitly model the time-course expression data. Using this model, we detected many candidate markers associated with gestational diabetes, gestational hypertension, hypertension (excluding hypertension of pregnancy), gender of the child, and whether multipara or not. We have also identified enrichment biological groups among these markers. Additionally, part of the phenotype could be estimated from the omics profiling information.
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| Free Research Field |
バイオインフォマティクス
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究において、妊娠期間中の児の性別、経産婦かどうかなどの形質、妊娠糖尿病、妊娠高血圧症、高血圧（妊娠高血圧除く）などの疾患に関連する遺伝子群および、関連する機能グループを同定することができた。さらに、一部非侵襲の情報からの予測においても一定の成果が得られている。国内外での独立した調査研究などにより、本研究で得られた候補が検証されることで、原因の解明に近づくとともに、新しい早期診断法・治療法の開発が進んでいくと考えている。
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