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2007 Fiscal Year Annual Research Report

テロメアDNAを利用したカリウムイオンの蛍光イメージング試薬の開発

Research Project

Project/Area Number 19021037
Research InstitutionKyushu Institute of Technology

Principal Investigator

竹中 繁織  Kyushu Institute of Technology, 工学部, 教授 (60188208)

Keywordsヒトテロメア配列 / オリゴヌクレオチド / ピレン / カリウムイオン / エキシマー発光 / ハイブリット型4本鎖構造 / トロンビンアプタマー / FRET
Research Abstract

ヒトテロメア配列を有するオリゴヌクレオチドの両末端にピレンを導入したPSO誘導体(Py-Htelom-Py(C3),Py-Htelom-Py(C6))を合成した。これを用いてカリウムイオンまたはナトリウムイオン存在下で蛍光スペクトル測定を行った。その結果、カリウムイオン存在下で、Py-Htelom-Py(C3),Py-Htelom-Py(C6)いずれもピレンエキシマー発光は見られず蛍光強度の大幅な減少が観察された。吸収スペクトル、円二色性(CD)スペクトルまたはその温度変化、蛍光偏光の測定等によってハイブリット型4本鎖構造が優先して形成することが明らかとなった。カリウムイオンのセンシングの観点からは不十分なものであったが、ヒトテロメアDNAのカリウムイオン、ナトリウムイオン存在下での4本鎖構造に関しては有益な知見が得られた。そこで、両末端にFRET色素の組み合わせたトロンビンアプタマー(TBA)配列を利用したPSO誘導体(PSO-2)を利用した細胞内のカリウムイオンのイメージングについて検討した。PSOを細胞に導入したときに核へ輸送される可能性が示された.その際,核に存在するヌクレオリンとの相互作用の可能性が示唆された.また,これに伴い細胞死が引き起こされたが、このメカニズムはまだ明らかとなっていない。今後、細胞死を回避するためにアビジンなどのタンパクをPSOへ導入し,核への移行の抑制を試みることによって、細胞内のカリウムイオン変化をPSOにより蛍光イメージングできるものと期待される。

  • Research Products

    (4 results)

All 2007

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Sequence-dependent DNA deformability studied using molecular dynamics simulations2007

    • Author(s)
      Satoshi F, Kono H, Takenaka S, Go N, Sarai A
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 35

      Pages: 6063-6074

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Study on the interaction of potassium ion with Synthetic human telomere DNA carrying pyrene moieties at both termini2007

    • Author(s)
      Hirohisa Hayashida, Shigeori Takenaka
    • Organizer
      The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • Place of Presentation
      早稲田大学国際会議場
    • Year and Date
      20070906-07
  • [Presentation] Fluorometric visualization of potassium ion in biological system by using quadraplex DNA probe carrying pyrene moieties(招待講演)2007

    • Author(s)
      Shigeori Takenaka
    • Organizer
      4th International Symposium on Innovative Bio. Physio Sensor Technology
    • Place of Presentation
      JEJU Oriental Hotel (Korea)
    • Year and Date
      20070629-30
  • [Presentation] Probing approach to realize the fluorometric visualization reagent of potassium ion in the living cell2007

    • Author(s)
      Shigeori Takenaka
    • Organizer
      1st Japanese-Swiss Symposium on Chemical Biology
    • Place of Presentation
      Swiss Federal Institute of Technology (EPFL) (Lausanne-Switzerland)
    • Year and Date
      20070624-26

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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