• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2007 Fiscal Year Annual Research Report

生体膜を介した物質輸送の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 19036004
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

石谷 隆一郎  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (30401186)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 濡木 理  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (10272460)
塚崎 智也  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, COE助教 (80436716)
Keywords膜蛋白質 / 金属イオンの膜透過 / ペプチドの膜透過 / X線結晶構造解析 / ペプチドの膜組込み / 恒常性 / Sec蛋白質膜透過装置 / トランスロコン
Research Abstract

金属イオン輸送体の構造解析に関しては、MgtE全長の結晶化・セレノメチオニン置換体タンパク質を用いた多波長異常分散法による位相決定に成功し、最終的に3.5Å分解能での構造決定を行った。さらに、マグネシウムイオンあり・なし両条件下でのMgtE細胞質ドメインの構造決定にも成功した。その結果,Mg^2+欠乏条件下の細胞質ドメインの構造ではMg^<2+>過剰条件下と比較し、大きな構造変化がみられた。この構造変化がMgtEの膜貫通ドメインの構造変化を誘起し、イオン透過孔を開閉してMg^<2+>透過を制御すると推測される。したがって、MgtEの細胞質ドメインがセンサーとして生体内のマグネシウムの濃度を感知することで、Mg^<2+>が過剰な時には輸送体によるMg^<2+>取り込みを阻害し、欠乏している場合には輸送体によるMg^<2+>が取り込みを促進させるという、Mg^<2+>バランス維持のメカニズムが示唆された(Nature, 2007)。ペプチド膜透過装置に関しては、SecYEのセレノメチオニン置換体結晶を用いた多波長異常分散法により位相決定に成功し、最終的に3.2Å分解能での構造決定を行った(論文準備中)。TSecDFについては,ペリプラズム領域のみの高分解能構造を、結晶構造解析・NMR法を用いて決定した。今後全長の電子密度マップにこれらの構造を当てはめ、新規膜タンパク質TSecDFの分子モデルを決定する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Refinement of comparative models of protein structure by using multicanonical molecular dynamics simulations2008

    • Author(s)
      Ishitani R, Terada T, & ShimizuK
    • Journal Title

      Mol. Simul. In press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural insights into RNA-dependent etikaryal and archaeal selenocys teine formation2008

    • Author(s)
      Araiso Y, Palioura S, Ishitani R 他8名
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 36(4)

      Pages: 1187-1199

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the C5rtosolic domain of a cation diffusion facilitator family protein2007

    • Author(s)
      Hattori M, Tanaka Y, Ishitani R, Nureki o
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F63

      Pages: 771-773

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the radical SAM. enzyme catalyzing tricyclic modified base formation in tENA2007

    • Author(s)
      (5名) Ishitani R, Nureki o
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 372(5)

      Pages: 1204-1214

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the MgtE Mg^2+ transporter2007

    • Author(s)
      Hattori M, Tanaka Y, Fukai S, Ishitani R, Nureki o
    • Journal Title

      Nature 448(7157)

      Pages: 1072-1075

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary χ-ray diffraction analysis of the full-length Mg^2+ transporter MμE2007

    • Author(s)
      Hattori M, Tanaka Y, Fukai S, Ishitani R, Nureki o
    • Journal Title

      Acta CrystEillogr; F63

      Pages: 682-684

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structuie of the Sec4p.Sec2p complex in the nucleotide exchangine intermediate state2007

    • Author(s)
      Sato Y, Fukai S, Ishitani R, Nureki o
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A 104(20)

      Pages: 8305-8310

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] マグネシウム輸送体MgtEの分子動力学シミュレーション2007

    • Author(s)
      石谷隆一郎, 杉田有給, 濡木理
    • Organizer
      生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      パシフイコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi