2007 Fiscal Year Annual Research Report
核内染色体テリトリーおよび核内小分子群の同一細胞内での可視化系の開発
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19038008
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| Research Institution | The Graduate University for Advanced Studies |
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Principal Investigator |
田辺 秀之 The Graduate University for Advanced Studies, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
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| Keywords | 染色体テリトリー / 核内配置 / 3D-FISH法 / RNA分子群 / 可視化 / クロマチン間領域 / 生細胞蛍光観察 / ゲノム配置 |
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| Research Abstract |
細胞核における核内染色体は高度に区画化された「染色体テリトリー(CT)」を持ち、染色体の物理サイズ、遺伝子密度、遺伝子発現状態などに関連して、その核内配置が規定されているものと考えられている。CTのダイナミクスを探る一環として、主としてクロマチン間領域に存在する核タンパク質とCTとの間で、空間的にどのような相互作用が生じているかを明らかにすることを目的とし、核タンパク質とCTおよび特定遺伝子領域の同一核内での可視化プロトコールの開発を行った(H17-18年度、本特定領域研究)。この成果に基づいて、本研究では、CTとタンパク質だけではなく、RNA分子を主体とした核内小分子群を対象とし、3D-FISH法をベースとした同時可視化系の開発を目指している。まず、RNA分子群の細胞内局在の全体像を把握するために、哺乳類細胞を材料としてRNA特異的染色試薬であるsyto RNA select用いて、間期および分裂期における局在と動態を調べた。その結果、1)分裂期細胞では染色体周辺部にRNA分子群が高濃度に局在すること、2)間期核ではRNA polymerase IIおよびKi-67と共局在するRNA分子群の頻度が高く、HP1と共局在する頻度が低いこと、3)RNA分子群の多くの成分が核内タンパク質と高次構造体を形成している可能性があること、が明らかにされた。RNA分子群のうち、今後はCTの空間配置トポロジー制御に関与するものに着目し、RNA分子群とCTおよびタンパク質の同時可視化系プロトコールの開発を通して、細胞核内をシステムとして動かしている様々な小分子群の核内オペレーターとしての本態を明らかにしていく。
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[Journal Article] NELF interacts with CBC and participates in 30 end processing of replication-dependent histone mRNAs.2007
Author(s)
Narita, T., Yung, TMC., Yamamoto, J., Tsuboi, Y., Tanabe. H., Tanaka, K., Yamaguchi, Y., Handa, H.
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Journal Title
Molecular Cell 26
Pages: 349-365
Peer Reviewed
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[Presentation] Simultaneous visualization of chromosome territories, genes, and proteins in the same nucleus.2007
Author(s)
Tanabe, H., Yung, TMC., Chiba, M., Yamaguchi, Y., Handa, H.
Organizer
EMBO Conference on Nuclear Structure and Dynamics
Place of Presentation
Golf de Massane, Montpellier, France
Year and Date
20070901-05
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[Presentation] Evolutionary dynamics of nuclear 3D-positioning of human 2p and 2q homologous chromosome territories in primate lymphocytes.2007
Author(s)
Tanabe, H., Chiba, M., Nagata, T., Hirai, H., lshida, T.
Organizer
16th International Chormosome Conference
Place of Presentation
RAI Conference Centre, Amsterdam, Netherland
Year and Date
20070825-29
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