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2007 Fiscal Year Annual Research Report

染色体ダイナミクスの生化学・構造生物学的解析

Research Project

Project/Area Number 19038022
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

胡桃坂 仁志  Waseda University, 理工学術院, 准教授 (80300870)

Keywords遺伝子及び染色体 / タンパク質と酵素 / 生体高分子 / 構造活性相関 / 生体機能関連物質 / 構造生物学 / 生体分子立体構造解析及び予測 / X線結晶解析
Research Abstract

染色体ダイナミクスをヌクレオソームレベルで解析するために、ヒト由来のヒストンをリコンビナントタンパク質として精製し、試験管内再構成系によりヌクレオソームの再構成を行った。特に、ヒトにおいて確認されているピストンH3バリアント、H3.1、H3.2、H3.3、H3.1tに着目し、それらをリコンビナントとして発現精製して、ヌクレオソーム形成能を調べた。その結果、これら全て4種類のヒストンH3バリアントは、いずれも試験管内でヌクレオソーム構造を形成することが明らかになった。次に、クロマチン構造ダイナミクスにおいて、ヌクレオソームの形成や解離のステップで重要な役割を果たすヒストンシャペロンに着目し、それらの反応機構をリコンビナントタンパク質を用いた試験管内再構成系によって検討した。本年度では、NAP1、NAP2、そして新規ヒストンシャペロンPP2Cgammaを特に取り上げ、それらの精製系を確立した。そして、それらのヒストンシャペロンとヒストンバリアントとの相互作用およびそれらのヌクレオソーム形成に及ぼす影響の解析を、試験管内再構成系を用いて行った。その結果、NAP2およびPP2Cgammaは全てのヒストンH3バリアントのヌクレオソーム形成を触媒することができるが、NAP1は精巣にて高発現が確認されているH3tのヌクレオソーム形成能において顕著な欠損を有することが明らかになった。NAP1は、その他のヒストンバリアントと同様に、H3t-H4複合体への結合能は持っているが、H3t-H4複合体をDNA上ヘローディングする能力が低いことが分かった。これらのことは、ヒストンシャペロンによる染色体ダイナミクスを理解する上で、重要な新発見であった。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Nucleosome formation with the testis-specific histone H3 variant, H3t, by human nucleosome assembly proteins in vitro2008

    • Author(s)
      Tachiwana, H., Osakabe, A., Kimura, H., and Kurumizaka, H.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A common mechanism for the ATP-DnaA-dependent formation of open complexes at the replication origin2008

    • Author(s)
      Ozaki, S. et al.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The actin-related protein hArp8 accumulate on the mitotic chromosomes and functions in chromosome alignment2008

    • Author(s)
      Aoyama, N., Oka, A., Kitayama, K., Kurumizaka, H., and Harata, M.
    • Journal Title

      Exp. Cell Res. 314

      Pages: 859-868

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vivo and in vitro footprinting of nucleosomes and transcriptional activators using an infrared-fluorescence DNA sequencer2008

    • Author(s)
      Morohashi, N, et al.
    • Journal Title

      Biol. Pharm. Bull. 31

      Pages: 187-192

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Lys313 residue of the human Rad51 protein negatively regulates the strand-exchange activity2008

    • Author(s)
      Ishida, T., Takizawa, Y., Sakane, I., and Kurumizaka, H.
    • Journal Title

      Genes Cells 13

      Pages: 91-103

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The interaction of DiaA and DnaA regulates the replication cycle in E. coli by directly promoting ATP-DnaA-specific initiation complexes2007

    • Author(s)
      Keyamura, K. et. al.
    • Journal Title

      Genes & Development 21

      Pages: 2083-2099

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Altered DNA binding by the human Rad51-R150Q mutant found in breast cancer patients.2007

    • Author(s)
      Ishida, T., Takizawa, Y., Sakane, I., and Kurumizaka, H.
    • Journal Title

      Biol. Pharm. Bull. 30

      Pages: 1374-1378

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ヒストンH3バリアントの生化学的・物理化学的解析2008

    • Author(s)
      越阪部晃永、他
    • Organizer
      染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      修善寺、静岡
    • Year and Date
      20080100
  • [Presentation] ヒト由来ヒストンH3バリアントの機能解析2008

    • Author(s)
      胡桃坂仁志、他
    • Organizer
      染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      修善寺、静岡
    • Year and Date
      20080100
  • [Presentation] S. pombe Rap1のS. pombe Bqt1-Bqt2複合体との結合領域同定2007

    • Author(s)
      田渕 英莉、他
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071200
  • [Presentation] シャペロン依存的なヒストンH3バリアントのヌクレオソーム形成機構2007

    • Author(s)
      立和名博昭、 他
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071200
  • [Presentation] ヒストンH3バリアントの生化学的解析2007

    • Author(s)
      越阪部晃永、他
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071200
  • [Presentation] ヒストン交換と修飾のダイナミクス2007

    • Author(s)
      木村宏、他
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071200

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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