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2009 Fiscal Year Annual Research Report

実用化に向けた酸素添加酵素の分子設計

Research Project

Project/Area Number 19105004
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

渡辺 芳人  Nagoya University, 物質科学国際研究センター, 教授 (10201245)

KeywordsP450 / 酸化反応 / 過酸化水素 / 水酸化反応 / エポキシ化反応
Research Abstract

昨年度の研究で、P450_<BSβ>のデコイ分子としてパラ位に置換基を有するフェニル酢酸を反応系に加えると、酸化生成物のキラリティーを反転させられることを明らかとすると共に、デコイ分子を用いるシステムで、芳香環水酸化反応が進行することも併せて見出し出している。構造解析では、P450_<BSβ>と同じく過酸化水素を利用することができるP450_<SPα>の基質結合型の高分解能結晶構造解析(分解能1.65Å)に成功した。P450_<SPα>はP450_<BSβ>に比べて反応空間が狭く、逆に長鎖脂肪酸が取り込まれている疎水性のチャネルは広いことが分かった。長鎖脂肪酸のカルボキシル基は、241番目のアルギニンと静電相互作用してヘム近傍に固定化されており、P450_<SPα>もP450_<BSβ>と同じ過酸化水素の活性化機構を持つことが明らかとなった。P450_<SPα>に鎖長の短いカルボン酸をデコイ分子として反応系に添加すると、スチレンのエポキシ化反応が進行した。興味深いことに、P450_<BSβ>と同じデコイ分子を用いた場合に、酸化生成物のエポキシドのキラリティーが逆転することを見出している。同じ過酸化水素駆動型P450でも反応空間の形状が異なるために、デコイ分子の作用も異なることが示された。さらに、P450_<SPα>の反応空間を変異導入によって改変すると酸化活性が大幅に向上し、スチレンのエポキシ化反応の初期活性が毎分1000回転に達した。この活性は、これまでに報告されているヘム酵素の中でも最大である。ミオグロビン変異体にカルボキシル基を有する基質を対象とする基質固定化部位を設けるために、ヘムポケットの入り口にアルギニンを導入したアルギニン変異体を作成した。このアルギニン変異体は、カルボキシル基を有する基質の(S)-ナプロキセンを水酸化し、その活性はアルギニンを導入していない変異体に比べて高いことが分かった。また、このアルギニン変異体は、S体のナプロキセンを優先的に水酸化することも見出している。

  • Research Products

    (16 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The role of the Fe-S cluster in the sensory domain of nitrogenase transcriptional activator VnfA from Azotobacter vinelandii2010

    • Author(s)
      H.Nakajima, N.Takatani, K.Yoshimitsu, M.Itoh, S.Aono, Y.Takahashi, Y.Watanabe
    • Journal Title

      FEBS Journal 277

      Pages: 817-832

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Elucidation of Metal-Ion Accumulation Induced by Hydrogen Bonds on Protein Surfaces by Using Porous Lysozyme Crystals Containing RhIIIIons as the Model Surfaces2010

    • Author(s)
      T.Ueno, S.Abe, T.Koshiyama, T.Ohki, T.Hikage, Y.Watanabe
    • Journal Title

      Chem.Eur.J. 16

      Pages: 2730-2740

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modification of Porous Protein Crystals in Development of Biohybrid Materials2010

    • Author(s)
      T.Koshiyama, N.Kawaba, T.Hikage, M.Shirai, Y.Miura, Cheng-Yuan Huang, K.Tanaka, Y.Watanabe, T.Ueno
    • Journal Title

      Bioconjugate Chem. 21

      Pages: 264-269

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Preparation and catalytic reaction of Au/Pd bimetallic nanoparticles in Apo-Ferritin2009

    • Author(s)
      M.Suzuki, M.Abe, T.Ueno, S.Abe, T.Goto, Y.Toda, T.Akita, Y.Yamada, Y.Watanabe
    • Journal Title

      Chem.Commun. 32

      Pages: 4871-4873

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of an Energy Transfer System in the Bio-nanocup Space by Heteromeric Assembly of gp27 and gp5 Protein Isolated from Bacteriophage T42009

    • Author(s)
      T.Koshiyama, T.Ueno, S.Kanamaru, F.Arisaka, Y.Watanabe
    • Journal Title

      Org.Biomol.Chem. 7

      Pages: 2649-2654

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polymerization of Phenylacetylene by Rhodium Complexes within a Discrete Space of apo-Ferritin2009

    • Author(s)
      S.Abe, K.Hirata, T.Ueno, K.Morino, N.Shimizu, M.Yamamoto, M.Takata, E.Yashima, Y.Watanabe
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 131

      Pages: 6958-6960

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Process of Accumulation of Metal Ions on the Interior Surface of apo-Ferritin : Crystal Structures of a Series of apo-Ferritins Containing Variable Quantities of Pd(II) Ions2009

    • Author(s)
      T.Ueno, M.Abe, K.Hirata, S.Abe, M.Suzuki, N.Shimizu, M.Yamamoto, M.Takata, Y.Watanabe
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 131

      Pages: 5094-5100

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      渡辺芳人, 上野隆史
    • Journal Title

      配位空間の化学―最新技術と応用―(シーエムシー出版)

      Pages: 301-311

  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      渡辺芳人, 安部聡, 上野隆史
    • Journal Title

      ナノ空間材料の創製と応用(フロンティア出版)

      Pages: 72-79

  • [Presentation] Coordination Chemistry in Protein Cages2010

    • Author(s)
      Y.Watanabe
    • Organizer
      The Metals In Biology Gordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Ventura, USA
    • Year and Date
      20100131-20100205
  • [Presentation] Coordination Chemistry in Proteins : Construction of Organomatalloproteins2010

    • Author(s)
      Y.Watanabe
    • Organizer
      The 3rd International Conference on Joint Project of Chemical Synthesis Core Research Institutions
    • Place of Presentation
      Nagoya, Japan
    • Year and Date
      20100107-20100108
  • [Presentation] Inorganic chemistry in proteins2009

    • Author(s)
      Y.Watanabe
    • Organizer
      Modern Trends in Inorganic Chemistry (MTIC-XIII)
    • Place of Presentation
      Bangalore, India
    • Year and Date
      20091207-20091210
  • [Presentation] Hydrogen Peroxide-Dependent Cytochrome P450 from Bacillus Subtilis (P450BSβ)2009

    • Author(s)
      Y.Watanabe
    • Organizer
      Symposium on Advanced Biological Inorganic Chemistry (SABIC-2009)
    • Place of Presentation
      Mumbai, India
    • Year and Date
      20091104-20091107
  • [Presentation] Coordination Chemistry in Protein Cages : Construction of Metalloproteins2009

    • Author(s)
      Y.Watanabe
    • Organizer
      2nd Asian Conference on Coordination Chemistry (2^<nd>ACCC 2009)
    • Place of Presentation
      Nanjing, China
    • Year and Date
      20091101-20091104
  • [Presentation] Organometallo-Ferritins : A New Approach for Bioinorganic Chemistry2009

    • Author(s)
      Y.Watanabe
    • Organizer
      2nd Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Parry Sound, Canada
    • Year and Date
      20090526-20090529
  • [Remarks]

    • URL

      http://bioinorg.chem.nagoya-u.ac.jp/

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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