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2009 Fiscal Year Annual Research Report

異物排出トランスポーターの構造・機能・制御と生理的役割

Research Project

Project/Area Number 19109002
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山口 明人  Osaka University, 産業科学研究所, 教授 (60114336)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中島 良介  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (20379100)
Keywords発現制御 / マイクロアレイ / 薬剤耐性 / 異物排出 / 構造解析
Research Abstract

基盤Sでは、細菌の異物排出タンパクの構造に基づく異物認識機構の解明と、その発現制御機構ならびに生理的役割の解明を目指している。まず、発現制御機構については、様々な新しい知見が明らかになってきた。外膜のリポタンパク質NlpEは環境センサーの一つとされているが、その高発現によって二成分情報伝達系CpxARを介してAcrD, MdtABCという異物排出タンパクを誘導し多剤耐性化をもたらすという新しい機構を発見した(AAC, 2010)。同様の機構は大腸菌だけでなく病原細菌サルモネラでも発動しており、臨床的にも重要な発見と言える。近年注目されているRNAシャペロンHfqの多剤耐性への関与も解明した(JAC, 2010)。このほか、異物排出による多剤耐性調節機構に関して2009年度中に5編の論文を発表した。構造に基づく異物認識機構については大きな前進があった。これまで、ミノサイクリンとドキソルビシン2つの基質結合構造解析から、多剤認識の構造的基盤としてマルチサイト結合という考えを提唱してきた。しかし、もっと大きな基質についてもタンパクの構造変化無しに認識可能かどうか疑問が残されていた。本年度、ミノサイクリンの1.5倍から2倍の分子量を持つエリスロマイシンとリファンピシンの結合構造決定にほぼ成功し、その結合位置を特定した。驚くべきことに、3つのモノマーのうち、結合モノマーに結合しているのではなく、待機モノマーに結合していた。一見、大きくかけ離れた位置のように見えるが、子細に検討すると、基質の入り口から、ミノサイクリンが結合しているフェニルクラスター領域に続く分子内チャネルのうち、クラスターへの入り口の外に結合していることがわかった。すなわち、大分子量故に、経路の途中に引っかかっていたのである。これらは最終的には排出されるので、そこで詰まっているわけではなく、そこが認識部位になっているものと考えられる。マルチサイト結合領域は当初の予想よりも広範囲にわたっていることが明らかとなった。

  • Research Products

    (45 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (36 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A subdomain of the endoplasmic reticulum forms a cradle for autophago someformation2010

    • Author(s)
      Hayashi-Nishino M., Fujita N., Noda T., Yamaguchi A., Yoshimori T., Yamamoto A.
    • Journal Title

      Nature cell Biology 11

      Pages: 1433-1437

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] H-NS modulates multidrug resistance of Salmonella enterica serovar Typhimurium by repressing multidrug efflux genes acrEF2009

    • Author(s)
      Nishino K., Hayashi-Nishino M., Yamaguchi A.
    • Journal Title

      Antimicrob Agents Chemother. 53

      Pages: 3541-3543

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of the ATP-dependent sphingosine-1-phosphate transporter in rat erythrocytes2009

    • Author(s)
      Kobayashi N., Kobayashi N., Yamaguchi A., Tsuyoshi N.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 284

      Pages: 21192-21200

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] スフィンゴシン-1-リン酸の輸送体Spns2は心臓前駆細胞の移動を制御よる2009

    • Author(s)
      川原敦雄、西毅、山口明人、望月直樹
    • Journal Title

      細胞工学 28

      Pages: 390-391

  • [Journal Article] Role of the AraC/XylS family regulator YdeO in multidrug resistance of Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Nishino K., Senda Y., Hayashi-Nishino M., Yamaguchi A.
    • Journal Title

      J.Antibiot. 62

      Pages: 251-257

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation and physiological function of multidrug efflux pumps in Escherichia coli and Salmonella2009

    • Author(s)
      Nishino K., Nikaido E., Yamaguchi A.
    • Journal Title

      Biochim.Biophys.Acta-Proteins and Proteomics 1794

      Pages: 834-843

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of NlpE overproduction on multidrug resistance in Escherichia coli

    • Author(s)
      Nishino K., Yamasaki S., Hayashi-Nishino M., Yamaguchi A.
    • Journal Title

      Antimicrob.Agents Chemother. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impact of RNA chaperone Hfq on Multidrug resistance in Escherichia coli

    • Author(s)
      Yamada J., Yamasaki S., Hirakawa H., Hayashi-Nishino M., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Journal Title

      J.Antimicrob.Chemother. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] スフィンゴシン1リン酸輸送体の同定と機能解析2010

    • Author(s)
      西毅、小林直木、久野悠、川原敦雄、山口明人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第35回討論会
    • Place of Presentation
      北海道
    • Year and Date
      2010-12-19
  • [Presentation] 大腸菌マクロライド排出蛋白質の膜局在2010

    • Author(s)
      平田隆弘、北村昭夫、西野邦彦、山口明人
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] 大腸菌薬剤排出ポンプ制御におけるNlpEの役割2010

    • Author(s)
      山崎聖司、西野美都子、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] S1P輸送体Spns2のヒトオルソログの機能解析2010

    • Author(s)
      久野悠、川原敦雄、山口明人、西毅
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrABの発現制御ネットワーク解析2010

    • Author(s)
      二階堂英司、城阪郁江、中島良介、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第83回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      2010-03-27
  • [Presentation] Effects of pyridopyrimidine(PP)and Phe-Arg-β-naphthylamide(PAN)on MexB & MexY in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      Matsumoto Y., Hayama K., Iino R., Nishino K., Noji H., Yamaguchi A.
    • Organizer
      第83回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      2010-03-27
  • [Presentation] 大腸菌を用いた緑膿菌のRND型排出ポンプMexABおよびMexXYの活性測定2010

    • Author(s)
      松本佳巳、葉山浩平、飯野亮太、西野邦彦、野地博行、山口明人
    • Organizer
      第42回緑膿菌感染症研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2010-02-12
  • [Presentation] Effects of NlpE overproduction on the induction of xenobiotic transporters involved in multidrug resistance in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      Yamasaki S., Nishino-Hayashi M., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Organizer
      The 13th SANKEN International Symposium
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-01-18
  • [Presentation] 新規S1P輸送体Spns2の機能解析2009

    • Author(s)
      久野悠、川原敦雄、山口明人、西毅
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第35回討論会
    • Place of Presentation
      北海道
    • Year and Date
      2009-12-19
  • [Presentation] Functional analysis of human spinster-like protein 3 ; a homologue of sphingosine 1-phosphate transporter, spns22009

    • Author(s)
      Murata M., Hisano Y., Yamaguchi A., Nishi T.
    • Organizer
      第31回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-12-01
  • [Presentation] Electron tomography revealed a subdomain of the endoplasmic reticulum as a cradle for autophagosome formation2009

    • Author(s)
      Hayashi-Nishino M., Fujita N., Noda T., Yamaguchi A., Nishino K., Yoshimori T., Yamamoto A.
    • Organizer
      第31回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-12-01
  • [Presentation] Characterization of the sphingoshin-1-phosphate transporter2009

    • Author(s)
      Nishi N., Kobayashi N., Hisano Y., Yamaguchi A.
    • Organizer
      第31回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-11-30
  • [Presentation] The localization study of a bacterial efflux transporter2009

    • Author(s)
      Hirata T., Kitamura A., Nishino K., Yamaguchi A.
    • Organizer
      第31回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-11-30
  • [Presentation] Regulation mechanism of Salmonella AcrAB Multidrug Efflux Pump in Response to Extracellular Signals2009

    • Author(s)
      Nikaido E., Shirosaka I., Nakashima R., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Organizer
      第31回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-11-30
  • [Presentation] サルモネラ多剤排出トランスポーターの生理機能解明2009

    • Author(s)
      西野邦彦、二階堂英司、松本佳巳、山口明人
    • Organizer
      第57回日本化学療法学会西日本支部総会
    • Place of Presentation
      愛知
    • Year and Date
      2009-11-28
  • [Presentation] スフィンゴシン1-リン酸(S1P)輸送体Spns2による心臓発生の制御機構2009

    • Author(s)
      久野悠、川原敦雄、山口明人、西毅、望月直樹
    • Organizer
      第19回日本循環薬理学会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2009-11-27
  • [Presentation] Fluorescein di-β-D-galactopyranoside(FDG)を用いた排出ポンプ阻害剤の評価2009

    • Author(s)
      松本佳巳、葉山浩平、飯野亮太、西野邦彦、野地博行、山口明人
    • Organizer
      第38回薬剤耐性菌研究会
    • Place of Presentation
      群馬
    • Year and Date
      2009-11-19
  • [Presentation] Sphingosine 1-phosphate Exporter Spins2 Identification of the transporter that export sphingosine 1-phosphate from the cells2009

    • Author(s)
      Yamaguchi A.
    • Organizer
      11th International Conference
    • Place of Presentation
      Cancun, Mexico
    • Year and Date
      2009-10-27
  • [Presentation] 外部シグナルによるサルモネラ異物排出トランスポーターAcrAB発現制御メカニズム解析2009

    • Author(s)
      二階堂英司、城阪郁江、中島良介、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第3回細菌学・若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      宮崎
    • Year and Date
      2009-10-26
  • [Presentation] Salmonella gene regulation mechanism by RamA in response to signals(口頭)2009

    • Author(s)
      Nikaido E., Shirosaka I, Nakashima R., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-24
  • [Presentation] Salmonella gene regulation mechanism by RamA in response to signals(ポスター)2009

    • Author(s)
      Nikaido E., Shirosaka I, Nakashima R., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-24
  • [Presentation] Spns2はスフィンゴシン-1-リン酸(S1P)の細胞外への放出を制御する2009

    • Author(s)
      川原敦雄、西毅、久野悠、山口明人、望月直樹
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] スフィンゴシン1-リン酸(S1P)の光反応性アナログを用いたS1P輸送体の探索2009

    • Author(s)
      小林直木、西毅、山口明人
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] 血小板モデル細胞を用いたS1P輸送体の探索2009

    • Author(s)
      久野悠、山口明人、西毅
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] Roles of xenobiotic transporters in bacterial drug resistance and virulence2009

    • Author(s)
      Nishino K., Yamaguchi A.
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] Effects of lipoprotein overproduction on the induction of xenobiotic transporters involved in multidrug resistance in Salmonella enterica2009

    • Author(s)
      Shirosaka I., Nikaido E., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] Roles of bacterial xenobiotic transporters in immune evasion2009

    • Author(s)
      Ueda T., Hayashi-Nishino M., Yamaguchi A., Nishino K.
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] Autophagy and the Endoplasmic Reticulum2009

    • Author(s)
      Hayashi-Nishino M., Fujita N., Noda T., Yamaguchi A., Yoshimori T., Yamamoto A.
    • Organizer
      5th International Symposium on Autophagy
    • Place of Presentation
      滋賀
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] Membrane-damaging activity of Phe-Arg-β-Naphthylamide in Escherichiacol2009

    • Author(s)
      Matsumoto Y., Hayama K., Iino R., Nishino K., Noji H., Yamaguchi A.
    • Organizer
      49years ICAAC, Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
    • Year and Date
      2009-09-14
  • [Presentation] Roles of xenobiotic transporters in bacterial drug resistance and virulence2009

    • Author(s)
      Nishino, K., Yamaguchi A.
    • Organizer
      The Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2009-09-08
  • [Presentation] 大腸菌RND型薬剤排出ポンプの進化2009

    • Author(s)
      田中真奈美、川下理日人、高木達也、安永照雄、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第11回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      北海道
    • Year and Date
      2009-09-03
  • [Presentation] 排出ポンプ阻害活性と膜障害作用の分離評価2009

    • Author(s)
      松本佳巳、西野邦彦、飯野亮太、野地博行、山口明人
    • Organizer
      第57回日本化学療法学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Electron Tomography Revealed a Subdomain of the Endoplasmic Reticulum as a Cradle for Autophagosome Formation2009

    • Author(s)
      Hayashi-Nishlino M., Fujita N., Noda T., Yamaguchi A., Yoshimori T., Yamamoto A.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      愛知
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] ラット赤血球におけるATP依存的スフィンゴシン1リン酸輸送体の解析2009

    • Author(s)
      小林直木、小林伸好、西毅、山口明人
    • Organizer
      第4回トランスポーター研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-05-23
  • [Presentation] 血小板様分子を産生するMEG-01細胞を用いたS1P輸送体の探索2009

    • Author(s)
      久野悠、西毅、山口明人
    • Organizer
      第4回トランスポーター研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-05-23
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrAB誘導に関与するRamAおよびRamRの解析2009

    • Author(s)
      城阪郁江、二階堂英司、中島良介、山口明人
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      2009-05-20
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/cmb/

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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