• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

異物排出トランスポーターの構造・機能・制御と生理的役割

Research Project

Project/Area Number 19109002
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山口 明人  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (60114336)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中島 良介  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (20379100)
Keywords環境センシング / 異物排出トランスポーター / 発現制御 / インドール / 構造解析 / 多剤耐性 / 機能的回転機構 / ペリスタルティック機構
Research Abstract

サルモネラ菌が環境を感知して異物排出トランスポーターの発現を制御している制御系について研究し、インドールに応答するramA/acrABの発現誘導はRamRを介していることを解明した。また、これとは別にパラコートがramA非依存的にacrABの発現を誘導することを見出し、新たなacrAB発現誘導機構としてSoxSを介した経路を明らかとした。これらの成果をJBCに発表した。この他、異物排出による細菌の多剤耐性化に関する研究をまとめて5報の論文を発表した。
構造に基づく異物認識機構については大きな前進があった。これまで、ミノサイクリンとドキソルビシン2つの基質結合構造解析から、多剤認識の構造的基盤としてマルチサイト結合という考えを提唱してきた。本年度は、より大きな分子量を持つエリスロマイシンとリファンピシンとの結合構造決定に成功して、その結合位置を特定した。その結晶構造からミノサイクリンが結合するディスタルポケット(フェニルクラスター領域)とは別にプロキシマルポケットが存在することが明らかとなった。この2つのポケットは分子内チャンネルに沿って並んており、F617ループによって区切られている。排出される薬剤はまず待機モノマーのプロキシマルポケットに結合し、次いで結合モノマーへの構造変化に伴ってディスタルポケットに送り込まる。そして最終的には排出モノマーから排出されるという「ペリスタルティック機構」を提唱した(論文審査中)。

  • Research Products

    (40 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (29 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Regulation of AcrAB multidrug efflux pump in Salmonella enterica serovar Typhimurium in response to indole and paraquat2011

    • Author(s)
      E.Nikaido, I.Shirosaka, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 158 Pages: 648-655

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of overexpression of small non-coding DsrA RNA on multidrug efflux in Escherichia coli2011

    • Author(s)
      K.Nishino, S.Yamasaki, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi
    • Journal Title

      The Journal of Antimicrobial Chemotherapy

      Volume: 66 Pages: 291-296

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of Salmonella multidrug efflux pumps in tigecycline resistance2011

    • Author(s)
      T.Horiyama, E.Nikaido, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Journal Title

      The Journal of Antimicrobial Chemotherapy

      Volume: 66 Pages: 105-110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Small RNAによる多剤耐性制御2011

    • Author(s)
      西野邦彦、山崎聖司、西野-林美都子、山口明人
    • Journal Title

      日本化学療法学会雑誌

      Volume: 59 Pages: 1-7

  • [Journal Article] The sphingosine 1-phosphate transporter, SPNS2, functions as a transporter of the phosphorylated form of the immunomodulating agent FTY7202010

    • Author(s)
      Y.Hisano, N.Kobayashi, A.Kawahara, A.Yamaguchi, T.Nishi
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 286 Pages: 1758-1766

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Indole enhances acid resistance in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      H.Hirakawa, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi, K Nishino
    • Journal Title

      Microbial Pathogenesis

      Volume: 49 Pages: 90-94

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TolC dependency of multidrug efflux systems in Salmonella enterica serovar Typhimurium2010

    • Author(s)
      T.Horiyama, A.Yamaguchi, K Nishino
    • Journal Title

      Journal of Antimicrobial Chemotherapy

      Volume: 65 Pages: 1372-1376

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Macrophage ABCA5 deficiency influences cellular cholesterol efflux and increases susceptibility to atherosclerosis in female LDLr knockout mice2010

    • Author(s)
      Ye D, Meurs I, Ohigashi M, Calpe-Berdiel L, Habets KL, Zhao Y, Kubo Y, Yamaguchi A, Van Berkel TJ, Nishi T, Van Eck M
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 395 Pages: 387-394

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of NlpE overproduction on multidrug resistance in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      K.Nishino, S.Yamasaki, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi
    • Journal Title

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy

      Volume: 54 Pages: 2239-2243

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impact of RNA chaperone Hfq on multidrug resistance in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      J.Yamada, S.Yamasaki, H.Hirakawa, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Journal Title

      Journal of Antimicrobial Chemotherapy

      Volume: 65 Pages: 853-858

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Development of novel therapeutic strategies to tackle multidrug-resistant pathogens2011

    • Author(s)
      Nishino, K., S.Yamasaki, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi
    • Organizer
      The American Association for the Advancement of Science (AAAS) 2011 Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Washington, DC, U.S.A.
    • Year and Date
      2011-02-20
  • [Presentation] 排出ポンプ阻害剤Phe-Arg-ss-naphtylamide (PAN)の作用メカニズム2011

    • Author(s)
      松本佳巳、葉山浩平、飯野亮太、西野邦彦、野地博行、山口明人
    • Organizer
      第45回緑膿菌感染症研究会
    • Place of Presentation
      仙台、宮城
    • Year and Date
      2011-02-04
  • [Presentation] Streptococcus pneumoniaeの自然免疫回避におけるPfbAの役割2011

    • Author(s)
      山口雅也、寺尾豊、西野邦彦、山口明人、浜田茂幸、川端重忠
    • Organizer
      第3回口腔環境制御研究カテゴリー集会
    • Place of Presentation
      長崎
    • Year and Date
      2011-02-04
  • [Presentation] Function of mammalian sphingosin 1-phosphate transporter2011

    • Author(s)
      Nishi, T., Hisano, Y., Kawasaki-Nishi, S., Yamaguchi, A.
    • Organizer
      The 14^<th> SANKEN international symposium
    • Place of Presentation
      ロイヤルオークホテル、大津
    • Year and Date
      2011-01-25
  • [Presentation] Functional network of multi-component drug efflux systems in Salmonella enterica serovar typhimurium2011

    • Author(s)
      Yamasaki, S., S.Nagasawa, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Organizer
      The 14^<th> SANKEN international symposium
    • Place of Presentation
      ロイヤルオークホテル、大津
    • Year and Date
      2011-01-25
  • [Presentation] Functional analysis of a novel S1P transporter, SPNS22010

    • Author(s)
      Y.Hisano, A.Yamaguchi, T.Nishi
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] TolC dependency of multidrug efflux systems in Salmonella enterica serovar Typhimurium2010

    • Author(s)
      T.Horiyama, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrABの発現制御に関与するRamRの解析2010

    • Author(s)
      二階堂英司、櫻井啓介、中島良介、城阪郁江、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] RNA chaperone regulates the multidrug transporter AcrB in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      S.Yamasaki, J.Yamada, H.Hirakawa, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] Streptococcus pneumoniaeは赤血球に侵入し好中球免疫を回避する2010

    • Author(s)
      山口雅也、寺尾豊、八木哲也、西野邦彦, 山口明人、川端重忠
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrAB発現制御因子RamRの構造機能解析2010

    • Author(s)
      二階堂英司、櫻井啓介、中島良介、城阪郁江、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      平成22年度日本結晶学会年会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-12-03
  • [Presentation] Role of the RNA chaperon Hfq in multidrug resistance of Escherichia coli2010

    • Author(s)
      Nishino, K., S.Yamasaki, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi
    • Organizer
      Joint meeting of the NZ Microbiological Society and NZ Society for Biochemistry & Molecular Biology
    • Place of Presentation
      The Univ.Auckland, New Zealand
    • Year and Date
      2010-12-01
  • [Presentation] 免疫抑制剤FTY720の作用機序におけるS1P輸送体SPNS2の役割2010

    • Author(s)
      久野悠、山口明人、西毅
    • Organizer
      第32回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2010-11-29
  • [Presentation] S1P輸送体SPNS2の生理機能の解析2010

    • Author(s)
      西毅、久野悠、山口明人
    • Organizer
      第36回日本生体エネルギー研究会
    • Place of Presentation
      大阪大学銀杏会館
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] 排出ポンプ阻害剤Phe-Arg-ss-naphtylamide (PAN)の外膜障害作用2010

    • Author(s)
      松本佳巳、葉山浩平、飯野亮太、西野邦彦、野地博行、山口明人
    • Organizer
      第39回薬剤耐性菌研究会
    • Place of Presentation
      伊香保、群馬
    • Year and Date
      2010-11-12
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrAB発現制御因子RamRのX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      二階堂英司、櫻井啓介、西野邦彦、山口明人、中島良介
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大、宮城
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] TolC dependency of multidrug efflux systems in Salmonella enterica serovar Typhimurium2010

    • Author(s)
      T.Horiyama, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Organizer
      The 10th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      Awaji, Hyogo
    • Year and Date
      2010-09-09
  • [Presentation] Impact of Hfq on multidrug resistance in Escherichia coli2010

    • Author(s)
      S.Yamasaki, J.Yamada, H.Hirakawa, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Organizer
      The 10th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      Awaji, Hyogo
    • Year and Date
      2010-09-09
  • [Presentation] The analysis of sphingosine 1-phosphate secretion from cells expressing Spns22010

    • Author(s)
      Hisano, Y., Yamaguchi, A., Nish, T.
    • Organizer
      51st International conference on the Bioscience of Lipids
    • Place of Presentation
      Alhondiga Conference Center, Bilbao, Spain
    • Year and Date
      2010-09-07
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrAB発現制御メカニズムの解析2010

    • Author(s)
      二階堂英司、櫻井啓介、中島良介、城阪郁江、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第22回微生物シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-09-04
  • [Presentation] 大腸菌多剤耐性化におけるRNAシャペロンHfqの役割2010

    • Author(s)
      山崎聖司、山田純子、平川秀忠、西野美都子、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第22回微生物シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-09-04
  • [Presentation] Structural basis of multidrug recognition2010

    • Author(s)
      Akihito Yamaguchi
    • Organizer
      Nanofair 2010 8th International Nanotechnology Symposium
    • Place of Presentation
      International Congress Center Dresden, Germany(招待講演)
    • Year and Date
      2010-07-06
  • [Presentation] Sphingoshine 1-Phosphate Efflux Transporter2010

    • Author(s)
      Akihito Yamaguchi
    • Organizer
      The 27th Naito Conference, Membrane Dynamics and Lipid Biology[I]
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2010-07-01
  • [Presentation] Analysis of the mammalian sphingosine 1-phosphate transporters2010

    • Author(s)
      Nishi T., Hisano Y., Kobayashi N., Yamaguchi A.
    • Organizer
      The 27th Naito Conference, Membrane Dynamics and Lipid Biology[I]
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2010-07-01
  • [Presentation] Functional analysis of novel S1P transporter, Spns22010

    • Author(s)
      Hisano, Y., Yamaguchi, A., Nishi T.
    • Organizer
      The 27th Naito Conference, Membrane Dynamics and Lipid Biology[I]
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2010-06-29
  • [Presentation] サルモネラ異物排出トランスポーターAcrABの発現制御機構解析2010

    • Author(s)
      二階堂英司、城阪郁江、中島良介、櫻井啓介、山口明人、西野邦彦
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] スフィンゴシン1リン酸輸送体の同定と生理機能の解析2010

    • Author(s)
      西毅、久野悠、山口明人
    • Organizer
      第52回日本脂質生化学会
    • Place of Presentation
      伊香保・森秋旅館
    • Year and Date
      2010-06-14
  • [Presentation] Overexpressed Lipoprotein Increases Multidrug Resistance by Induction of Multidrug Transporters in E.coli2010

    • Author(s)
      S.Yamasaki, M.Hayashi-Nishino, A.Yamaguchi, K.Nishino
    • Organizer
      American Society for Microbiology 110th General Meeting
    • Place of Presentation
      San Diego, U.S.A.
    • Year and Date
      2010-05-25
  • [Presentation] Electron Tomography Revealed the Endoplasmic Reticulum as a Source of Autophagosomal Membranes2010

    • Author(s)
      M.Hayashi-Nishino, N.Fujita, T.Noda, A.Yamaguchi, K.Nishino, T.Yoshimori, A.Yamamoto
    • Organizer
      American Society for Microbiology 110th General Meeting
    • Place of Presentation
      San Diego, U.S.A.
    • Year and Date
      2010-05-24
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/cmb/

URL: 

Published: 2013-06-26   Modified: 2014-03-12  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi