• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2009 Fiscal Year Self-evaluation Report

in silico analysis of molecular interactions between commercially available drugs in Japan and proteins

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 19200024
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Bioinformatics/Life informatics
Research InstitutionTokai University

Principal Investigator

HIRAYAMA Noriaki  Tokai University, 医学部, 教授 (70238393)

Project Period (FY) 2007 – 2010
Keywords医薬分子 / タンパク質 / 分子認識 / ドッキング / 分子力学
Research Abstract

現在国内で使用されている医薬分子はおおよそ1000種類ほどあり、これらの分子は有用な薬理活性を示すと共に、副作用も有している。これら典型的な医薬分子がそれらの標的分子を含めて、生体内の種々のタンパク質とどのように相互作用するかを知ることは非常に重要である。そうした知見は新たな医薬分子の発見に有用なだけではなく、医薬分子の副作用や機能未知のタンパク質の機能を理解する上でも、非常に重要である。
しかし、これらの相互作用をウェット実験で測定することは、経済的にもまた時間的にも事実上不可能である。本研究課題の最終目的は、これらの相互作用をin silico解析によって求めることである。本研究においては、X線解析で立体構造が明らかになっているヒト由来の重要なタンパク質と現在日本国内で使用されている医薬分子との相互作用を主にドッキング・シミュレーションで解析する。この目的を達成するために、新しい方法論の研究および開発も併せて行う。

  • Research Products

    (5 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Alpha Sphere Filter Method : Application of Pseudomolecular Descriptors in Virtual Screening of 2D Chemical Structures2010

    • Author(s)
      M. Muta, N. Hirayama
    • Journal Title

      J.Comput.Chem. 31

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Use of amino acid composition to predict epitope residues of individual antibodies2010

    • Author(s)
      S. Soga, D. Kuroda, H. Shirai, M. Kobori, N. Hirayama
    • Journal Title

      Protein Eng.Des.Sel. 23

      Pages: 441-448

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemocavity : specific concavity in protein reserved for the binding of biologically functional small molecules2008

    • Author(s)
      S. Soga. H. Shirai, M. Kobori, N. Hiravama
    • Journal Title

      J.Chem.Inf. 48

      Pages: 1679-1685

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] PLB法を用いた低分子結合部位の差別化2009

    • Author(s)
      平山令明
    • Organizer
      第10回日本バイオインフォマティクス学会
    • Place of Presentation
      木産業技術総合研究所 (東京)
    • Year and Date
      2009-12-02
  • [Presentation] Chemocavity : Specific concavity in protein reserved for the binding of biologically functional small molecules2009

    • Author(s)
      S. Soga, H. Shirai, M. Kobori, N. Hirayama
    • Organizer
      17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
    • Place of Presentation
      ストックホルム (スウェーデン)
    • Year and Date
      2009-07-01

URL: 

Published: 2011-06-18   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi