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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ファイトケミカルゲノミクス:植物化学的多様性のゲノム基盤

Research Project

Project/Area Number 19201043
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

斉藤 和季  Chiba University, 大学院・薬学研究院, 教授 (00146705)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山崎 真巳  千葉大学, 大学院・薬学研究院, 准教授 (70222370)
吉本 尚子  千葉大学, 大学院・薬学研究院, 助教 (10415333)
Keywordsメタボロミクス / トランスクリプトミクス / フラボノイド / シロイヌナズナ / ゲノム機能科学 / システイン
Research Abstract

モデル植物であるシロイヌナズナのメタボロミクス研究において網羅的な代謝産物の単離・構造決定は必須である。そこで、植物メタボロミクスに応用することを目的としてシロイヌナズナの代謝物の同定を行った。シロイヌナズナにおけるアントシアニンおよびフラボノール生合成を制御する転写因子を2個同時発現したラインを作出し、そのフラボノイド成分の探索および遺伝子発現ネットワークを解析した。その結果、新規のフラボノイド成分の単離構造決定に成功した。また、シロイヌナズナのフラボノイド生合成の包括的解明を目的として、メタボロミクス/トランスクリプトミクスに基づいたフラボノイド生合成遺伝子の網羅的同定を試みた。フラボノイドの多様性に寄与する配糖化酵素遺伝子をターゲットとした遺伝子共発現解析を行い、配糖化酵素遺伝子およびその他の関連遺伝子の絞り込みを行った。相関の高い遺伝子について、一次配列による候補遺伝子の機能推定、該当T-DNA挿入変異体のフラボノイドターゲット分析、組換え蛋白質を用いた生化学実験を行い、フラボノール3位アラビノース配糖化酵素をコードしていることを明らかにした。また、システイン合成系に関与するセリンアセチル転移酵素の遺伝子群の網羅的な解析を多重挿入転移体を用いて行った。さらに、カンプトテシンアルカロイドを生産する細胞に特異的に発現する遺伝子の機能解析を、RNA干渉法を用いたin vivoアッセイで検討した。

  • Research Products

    (10 results)

All 2008 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Characterization of PAP1-upregulated Glutathione S-transferase genes in Arabidopsis thaliana2008

    • Author(s)
      Bunyapa Wangwattana, Yoko Koyama, Yasutaka Nishiyama, Masahiko Kitayama, Mami Yamazaki, Kazuki Saito
    • Journal Title

      Plant Biotechnology 25

      Pages: 191-196

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comprehensive Flavonol Profiling and Transcriptome Coexpression Analysis Leading to Decoding Gene-Metabolite Correlation in Arabidopsis2008

    • Author(s)
      Keiko Yonekura-Sakakibara, Takayuki Tohge, Fumio Matsuda, Ryo Nakabayashi, Hiromitsu Takayama, Rie Niida, Akiko Watanabe-Takahashi, Eri Inoue, Kazuki Saito
    • Journal Title

      The Plant Cell 20

      Pages: 2160-2176

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparative Genomics and Reverse Genetics Analysis Reveal Indispensable Functions of the Serine Acetyltransferase Gene Family in Arabidopsis2008

    • Author(s)
      Mutsumi Watanabe, Keiichi Mochida, Tomohiko Kato, Satoshi Tabata, Naoko Yoshimoto, Masaaki Noji, Kazuki Saito
    • Journal Title

      The Plant Cell 20

      Pages: 2484-2496

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 二つのMYB遺伝子の同時過剰発現体におけるトランスクリプトームとフラボノイドプロファイル2008

    • Author(s)
      中林亮,榊原圭子,松田史生,北島満里子,高山廣光,山崎真巳,斉藤和季
    • Organizer
      第26回日本植物細胞分子生物学会大阪大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20080901-20080902
  • [Presentation] UDP-糖供給系がフラボノイド代謝系に及ぼす影響2008

    • Author(s)
      榊原圭子,峠隆之,新井田理絵,高橋晶子,斉藤和季
    • Organizer
      第26回日本植物細胞分子生物学会大阪大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20080901-20080902
  • [Presentation] Flavonoid profiling and transcriptome in Arabidopsis overexpressing two MYB genes2008

    • Author(s)
      R.Nakabayashi, K.Yonekura-Sakakibara, F.Matsuda, T.Tohge, M.Kitajima, H.Takayama, M.Yamazaki, K.Saito
    • Organizer
      5^<th> International Conference on Plant Metabolomics
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      20080715-20080718
  • [Presentation] Characterization of transcription factor expressed in camptothecin producing hairy roots2008

    • Author(s)
      M.Yamazaki, J.Okuyama, T.Asano, K.Saito
    • Organizer
      5^<th> International Conference on Plant Metabolomics
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      20080715-20080718
  • [Presentation] Integration of metabolomics and transcriptomics for phytochemcal genomics in Arabidopsis and non-model plants2008

    • Author(s)
      K.Saito
    • Organizer
      The 1^<st> International Conference on Plant Secondary Metabolism
    • Place of Presentation
      Kunming, China
    • Year and Date
      20080608-20080610
  • [Presentation] Roles of gene families of O-acetylserine thiol-lyase and serine acetyltransferase in Arabidopsis : Just redundancy or hidden secret?2008

    • Author(s)
      M.Watanabe, M.Kusano, A.Oikawa, A.Fukushima, M.Noji, K.Saito
    • Organizer
      7^<th> Workshop on Sulfur in Plants
    • Place of Presentation
      Warsaw, Poland
    • Year and Date
      20080513-20080517
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.p.chiba-u.ac.jp/lab/idenshi/index.htm

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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