2008 Fiscal Year Annual Research Report
魚類多様性の進化ダイナミクス: 網羅的大規模分子系統樹からのアプローチ
Project/Area Number |
19207007
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
西田 睦 The University of Tokyo, 海洋研究所, 教授 (90136896)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
馬渕 浩司 東京大学, 海洋研究所, 助教 (50401295)
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Keywords | 進化 / 魚類 / ミトコンドリア / 多様性 / 分子系統 / メダカ / トゲウオ / シクリッド |
Research Abstract |
平成20年度は、昨年度に引き続き、スズキ類(Percomorpha)魚類のミトコンドリア(ミト)ゲノム全長塩基配列のデータ収集を行ったが、平行して行ったスズキ類の特定の一部を対象とした系統解析において、魚類学上重要な成果をいくつか得ることができた。代表的な成果としては、実験モデル生物として近年重要性がさらに増している2種類の魚類、メダカとトゲウオの系統的位置に関する成果が挙げられる。メダカを含むメダカ亜目は、ダツ類に近いという説とカダヤシ類に近いという説があったが、これまでの短い部分塩基配列に基づく解析では統計的に信頼のおける結果が得られていなかった。今回、ミトゲノム全長塩基配列に基づく解析を行ったところ、メダカ亜目は、カダヤシ類より、サンマやトビウオを含むダツ類により近いことが高い信頼性を持って提示された。更に、これらのスズキ類内部における系統的位置に注目すると、メダカやサンマ、トビウオ、カダヤシを含むトウゴロウイワシ系は、適応放散のモデル生物として注目されているシクリッド類とかなり近縁であることが判明した。一方、トゲウオの系統的位置に関しても新たな知見が得られた。これまでトゲウオ科の中で最も初期に分化したのは、これと姉妹群関係にあるクダヤガラ類と類似した細長い体型を持つS, spinachia であると考えられていたが、ミトゲノム全長配列と11個の核遺伝子に基づいた解析を行ったところS, spinachia は、トゲウオ科の中で最も派生的な種として位置づけられた。この結果は、トゲウオ科魚類の進化的柔軟性を示しており、今後トゲウオ類のゲノム進化を検証する上で非常に興味深い知見であるといえる。
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Research Products
(55 results)
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[Journal Article] Different hatching strategisc in embryos of two species, pacific herring Clupea pallasii and Japanese anchovy Engraulis japonicus, that belong tu the same order Clupeiformes, and their environmental adaptation.2009
Author(s)
Kawaguchi, M. , H. Fujita, N. Yoshizaki, J. Hiroi, H. Okouchi, Y. Nagakura, T. Noda, S. Watanabe, S. Katayama, S. Iwamuro, M. Nishida, I. Iuchi, and S. Yasumasu.
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Journal Title
Journal of Experimental Zoology, Part B: Molecular and Developmental Evolution 312B
Pages: 95-107
Peer Reviewed
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[Journal Article] Explosive speciation of Takifugu: another use of fugu as a model system for evolutionary biology.2009
Author(s)
Yamanoue, Y. , M. Miya, K. Matsuura, S. Miyazawa, N. Tsukamoto, H. Doi, H. Takahashi, K. Mabuchi, M. Nishida, and H. Sakai.
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Journal Title
Molecular Biology and Evolution 26
Pages: 623-629
Peer Reviewed
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[Journal Article] Interrelationships of Atherinomorpha (medakas, flyingfishes, killifishes, Silversides, and their relatives) : The first evidence based on whole mitogenome sequences.2008
Author(s)
Setiamarga, I)avin, H. E. , Masaki Miya, Yusuke Yamanoue, Kohji Mabuchi, Takashi P. Satoh, Jun G Inoue, Mutsumi Nishida.
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Journal Title
Molecular Phylogenetics and Evolution 49
Pages: 598-605
Peer Reviewed
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[Journal Article] Interrelationships of the 11 gasterosteiform families (sticklebacks, pipefishes, and their relatives) : a new pespective based on whole mitogerlme sequences from 75 higher teleosts.2008
Author(s)
Kawahara, R. , M. Miya, K. Mabuchi, S. Lavoue, J. G. Inoue, T. P. Satoh, A. Kawaguchi, and M. Nishida.
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Journal Title
Molecular Phylogenetics and Evolution 46
Pages: 224-236
Peer Reviewed
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[Journal Article] Population structure of two closely related pelagic cichlids in Lake Victoria, Haplochromis pyrrhocephalus and H. laparogramma.
Author(s)
Maeda, K. , M. Takeda, K. Kamiya, M. Aibara, S. I. Mzighani, M. Nishida, S. Mizoiri, T. Sato, Y. Terai, N. Okada, and H. Tachida.
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Journal Title
Peer Reviewed
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[Journal Article] Reconstructing thr phylogenetic relationships of the earth's most diverseclade of freshwater fishes-Order Cypriniformes (Actinopterygii: Ostariophysi): A case ctudy using multiple nuclear loci and the mitochondrial genome.
Author(s)
Mayden, R. L. , Wei-Jen Chen, H. L. Bart, M. H. Doosey, A. M. S. , K. L. Tang, R. M. Wood, M. K. Agnew, L. Yang, M. V. Hirt, M. D. Clements, K. Saitoh, T. Sado, M. Miya, and M. Nishida.
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Journal Title
Molecular Phylogenetics and Evolution (in press)
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