2008 Fiscal Year Annual Research Report
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19300045
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| Research Institution | Japan Advanced Institute of Science and Technology |
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Principal Investigator |
TU Bao Ho Japan Advanced Institute of Science and Technology, 知識科学研究科, 教授 (60301199)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
高林 克日己 千葉大学, 医学部附属病院, 教授 (90188079)
DAM Hieu Chi 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 講師 (70397230)
河崎 さおり 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 助教 (40377437)
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| Keywords | 知識発見 / データマイニング / 科学データ / 構造化データ |
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| Research Abstract |
本研究では、(1)カーネル手法(2)半教師付学習などマイニング手法の基礎研究、(3)医学生物学データ、(4)ナノテクデータでの科学データマイニングを課題とし、平成20年度はそれぞれについて以下の成果を得た。(1a)カーネルマトリクス自動評価用のFMS指標によるカーネル設計での研究成果がPattern Recognitionに採録。(1b)特徴類似度による特徴選択の研究で、幾何学的モデリングと識別カーネル学習を開発し「DMSS'08」にて発表。(1c)タンパク質間相互作用(PPI)やヘアピン型miRNAの応用研究をRIVF'08, JBSEで発表。(2a)準教師付学習と構造予測に関して、複合語での情報検索(JICIC, ESA)、統計的機械翻訳(JSNST, CNLL'08, AMALP'08)等で研究成果を発表。(2b)科学データでの仮説探索では、ヒトゲノムのmiRNA調節モジュールの発見(BMC Bioinformatics),多変量例外検出と個人情報保護(KICSS'08),材料科学における計算手法(JCMS, JKPS, PCCP, PRB)での成果を発表。(3a, 3b)PPIネットワークでは、複数データ源を組合せた予測について発表した(JBCB)。(3c)PPIネットワークからのシグナル伝達経路(STP)予測とPPIネットワークのSTPにおける生物学的機能推論についてSRLB'08で発表。(3d)肝炎における病原遺伝子間関係や肝炎治療での複数投薬の副作用に関し、前年の病原遺伝子予測手法を改良しmiRNAとタンパク質ネットワークによる病原遺伝子予測手法とmiRNA発現プロファイルによる組織サンプルの解析手法を新たに開発し、KICSS'08で発表。また、ヌクレオソーム・ダイナミクスにおけるヒストン修飾とDNA配列の効果についてKLLBI'08で発表。
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Research Products
(23 results)
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[Journal Article] Substrate-mediated interactions of Pt atoms adsorbed on single-wall carbon nanotubes : Density functional calculations2009
Author(s)
Dam, H. C., Nguyen, T. C., Sugiyama, A., Ozaki, T., Fujiwara, A., Mitani, T., Okada, S.
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Journal Title
Physical Review B (PRB) 79
Pages: 115426
Peer Reviewed
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[Presentation] A Tree-to-String Phrase-based Model for Statistical Machine Translation2008
Author(s)
Nguyen, P. T., Shimazu, A., Ho, T. B., Nguyen, L. M., Nguyen, V. V.
Organizer
Twelfth Conference on Computational Natural Language Learning (CNLL'08)
Place of Presentation
Manchester, UK
Year and Date
20080816-20080817
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[Presentation] Simple but effective methods of combining kernels for the prediction problem in biology2008
Author(s)
Tanabe, H., Ho, T. B., Nguyen, C. H., Kawasaki, S.
Organizer
IEEE International Conference on Research, Innovation, and Vision for the Future in Computing and Communication Technologies, (RIVF'08)
Place of Presentation
Ho Chi Minh City, Vietnam
Year and Date
20080713-20080717
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[Book] Rational, Robust, and Secure Negotiations in Multi-Agent Systems中 "Asynchronous Constraint-Based Approach : New Solution for any Constraint Problem" (Hassine, B. A., Ho, T. B. 分担執筆, pp. 169-184)2008
Author(s)
Ito, T., Hattori, H., Zhang, M., Matsuo, T. 編
Total Pages
169-184
Publisher
Springer
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