2009 Fiscal Year Annual Research Report
| Project/Area Number |
19300045
|
|---|
| Research Institution | Japan Advanced Institute of Science and Technology |
|---|
Principal Investigator |
TU・BAO Ho 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 教授 (60301199)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
高林 克日己 千葉大学, 医学部附属病院, 教授 (90188079)
DAM Hieu Chi 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 講師 (70397230)
河崎 さおり 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 助教 (40377437)
|
|---|
| Keywords | 知識発見 / データマイニング / 科学データ / 構造化データ |
|---|
| Research Abstract |
平成21年度も研究計画に基づき3群の研究課題に対し、以下の内容で研究を実施し、成果を得、発表を行った。
1.データマイニング手法に関する研究:相互情報量および2-PART完全分散(2PFD)を用い情報検索で複合語を抽出する手法を開発しExpert Systems with Applicationsその他において発表したほか、およびプライバシー保護データマイニングにおける新たな課題とその解消方法を提案し、IEICEの論文として発表した。
2.生物医学分野における計算手法:(a)ヒトゲノムにおけるmiRNAの機能を発見するために、miRNAと転写因子(TF)の関係、つまりmiR-TF調整モジュールを見つけるルールベース手法を開発し、182のモジュールを発見し、その多くの妥当性が検証された。(b)病因遺伝子発見のために、複数情報源からタンパク質間相互作用ネットワークを構築を目指した準教師つき学習手法を開発し、2010年度のAI in medicineで発表した。(c)ヌクレオソームの特性を調べるために、他の諸手法との比較で優位性のあるルールベース手法を開発し、成果をBMC Genomicsにおいて発表した。(d)肝炎研究:omicsデータと臨床データとの組合わせについて研究を継続しており、とくにC型肝炎ウイルスのNS5A領域とインタフェロン/リバビリン併用療法との関係に取り組み始めたところである。
3.マテリアルサイエンスにおける計算手法:計算材料科学のアプローチを採用し、量子力学の基本方程式を基づいて多数のナノスケール材料の構造や電子状態を予測し、データベースを構築する。データマイニングの手法を導入する事で、構築されたシミュレーションデータベースにから白金金属ナノクラスター材料における触媒反応の解明及び触媒反応場の設計を行った。金属ナノクラスターの動的な構造や担持表面との相互作用などを調べ、プライミング電子及び「fluxionality」の概念を導入し、触媒反応場の制御方法の指針を提案し、成果をPhysical Review Bなどに発表した。
|
Research Products
(20 results)
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Substrate-mediated interactions of Pt atoms adsorbed on single-wall carbon nanotubes : Density functional calculations2009
Author(s)
Dam H.C., Nguyen T.C., Sugiyama, A., Ozaki, T., Fujiwara, A., Mitani, T., Okada, S.
-
Journal Title
Physical Review B
Volume: 79
Pages: 115426
Peer Reviewed
-
-
-
[Presentation] Towards service-oriented knowledge discovery in biomedicine Research2009
Author(s)
Ho, T.B., Takabayashi, K., Pham T.H., Nguyen, T.P., Kawasaki, S., Tran, D.H.
Organizer
International Workshop on Third Generation Data Mining, ECML/PKDD 2009
Place of Presentation
Bled, Slovenia
Year and Date
20090907-20090911
-
-
-
[Presentation] An Empirical Study of Vietnamese Noun Phrase Chunking with Discriminative Sequence Models2009
Author(s)
Nguyen, L.M., Nguyen, H.T, Nguyen, P.T., Ho, T.B., Shimazu, A.
Organizer
7th Workshop on Asian Language Resources at 47th Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics, ACL-IJCNLP 2009
Place of Presentation
Singapore
Year and Date
20090802-20090807
-
-
-
-
-
