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2008 Fiscal Year Annual Research Report

コヒーレントX線回折顕微法による生物試料のナノ構造解析

Research Project

Project/Area Number 19310084
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

西野 吉則  The Institute of Physical and Chemical Research, 石川X線干渉光学研究室, 専任研究員 (40392063)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 前島 一博  独立行政法人理化学研究所, 今本細胞核機能研究室, 専任研究員 (00392118)
KeywordsコヒーレントX線回折顕微法 / ナノ構造解析 / 細胞内構造 / 低温生物試料
Research Abstract

本研究は、可能な限り「生きた」状態に近い生物試料をコヒーレントX線回折顕微法で可視化する研究開発を行うことによって、生物現象の理解に貢献することを目的としている。コヒーレントX線回折顕微法では、生物学・医学上重要な「生きた」状態に近い凍結水和生物試料の観察の成功例は、世界的にまだない。凍結水和生物試料の測定においては試料構造の破壊を防ぐため、調整段階から測定に至るまで試料を低温に保つ必要がある。本年度は、凍結水和試料の観察に向け、試料を低温に保つ操作技術の開発を進めた。水和生物試料を急速凍結することによって、ガラス状の氷で試料を包埋した。その後、試料を液体窒素温度に保ち、SPring-8に搬送した。SPring-8では、前年度開発した「冷却試料操作装置」を用いて、試料を-150℃以下の温度に保ったままコヒーレントX線回折顕微鏡の真空チャンバに搬送する技術開発を行った。これにより、試料損傷の原因となる、氷晶の形成を押さえた試料搬送技術が実現した。また、コヒーレントX線回折顕微法による無染色ヒト染色体の可視化について論文にまとめ、Physical Review Letters誌に掲載された。無染色ヒト染色体の像再構成では、二次元のみならず、三次元の可視化にも成功した。コヒーレントX線回折顕微法による、三次元での生物試料観察は世界初である。可視化された染色体試料中には、電子密度の高い軸状構造が観察された。蛍光標識等をせず、染色体の軸状構造が観察されたのは世界初である。この研究により、コヒーレントX線回折顕微法が、厚さ1マイクロメートルを超える細胞や細胞小器官など、透過型電子顕微鏡にとっては厚すぎる生物試料の内部構造を、無染色で観察するのに有効であることが示された。この研究結果は、Nature、Physics Today、朝日新聞等、国内外で大きく紹介された。

  • Research Products

    (31 results)

All 2009 2008

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (26 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Three-Dimensional Visualization of a Human Chromosome Using Coherent X-Ray Diffraction2009

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Journal Title

      Physical Review Letters 102

      Pages: 018101

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X線回折顕微法2009

    • Author(s)
      西野吉則
    • Journal Title

      顕微鏡 44(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Element-specific hard x-ray diffraction microscopy2008

    • Author(s)
      Yukio Takahashi
    • Journal Title

      Physical Review B 78

      Pages: 092105

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of cryo-electron microscopy images does not support the existence of 30-nm chromatin fibers in mitotic chromosomes in situ2008

    • Author(s)
      Mikhail Eltsov
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105

      Pages: 19732-7

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 招待講演2009

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      Global COE International Workshop on Phase Retrieval in X-ray field
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      2009-03-26
  • [Presentation] Nanostructure Analysis by Using Coherent X-ray Diffraction (招待講演)2009

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      1st Workshop on FEL Science "Coherent Intense X-rays in Physics and Biology"
    • Place of Presentation
      Jeju, Korea
    • Year and Date
      2009-02-18
  • [Presentation] コヒーレントX線回折顕微法によるナノ構造物の電子密度分布定量評価法の開発(ポスター)2009

    • Author(s)
      久保英人
    • Organizer
      第22回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2009-01-12
  • [Presentation] コヒーレントX線回折顕微法によるエレクトロマイグレーションボイドの生成過程のその場観察(ポスター)2009

    • Author(s)
      古川隼人
    • Organizer
      第22回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2009-01-12
  • [Presentation] K-Bミラー集光コヒーレントX線回折顕微法の検討(ポスター)2009

    • Author(s)
      堤良輔
    • Organizer
      第22回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2009-01-12
  • [Presentation] How is genome DNA compacted into a mitotic chromosome?2008

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      The 1275th Biological Symposium, National Institute of Genetics (Idenken)
    • Place of Presentation
      Mishima, Japan(口頭発表)
    • Year and Date
      2008-12-24
  • [Presentation] X線回折顕微法(依頼講演)2008

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      日本顕微鏡学会関西支部特別企画講演会「生物科学・材料科学における立体像構築と位相情報抽出」
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      2008-12-21
  • [Presentation] Development of coherent x-ray diffraction microscopy for nanostructure analysis of metallic materials (ポスター)2008

    • Author(s)
      Yukio Takahashi
    • Organizer
      International Symposium at Frontier Research Base for Global Young Researchers
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      2008-12-16
  • [Presentation] Nanostructure analysis by using coherent X-ray diffraction (招待講演)2008

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 6th Workshop on X-ray and Neutron Scattering Techniques for Surface Nano-Characterization
    • Place of Presentation
      Pohang, Korea
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] Mitotic chromosome structure : Irregular folding of nucleosome fibers (招待講演)2008

    • Author(s)
      前島一博
    • Organizer
      日本分子生物学会・生化学会合同年会(BMB2008)シンポジウム転写シグナリングと複合体ダイナミクスの新展開
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] Mitotic chromosome structure : Irregular folding of nucleosome fibers (招待講演)2008

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      The 3rd Asian Chromosome Colloquium "molecular regulation of Chromosome assembly and Segregation"
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] 分裂期染色体の構造(依頼発表)2008

    • Author(s)
      前島一博
    • Organizer
      大阪大学・蛋白質研究所セミナー「クロマチン-構造とダイナミクス」
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2008-10-31
  • [Presentation] コヒーレントX線で切り開く構造可視化の新手法(依頼講演)2008

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      「北海道大学大学院工学研究科応用物理学専攻」「日本生物物理学会北海道支部」共催講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] コヒーレントX線回折顕微法によるCu細線のボイド生成過程のその場観察2008

    • Author(s)
      古川隼人
    • Organizer
      日本金属学会秋期大会
    • Place of Presentation
      熊本大学(口頭発表)
    • Year and Date
      2008-09-24
  • [Presentation] コヒーレントX線回折顕微法による金属材料の電子密度分布定量評価法の開発(ポスター)2008

    • Author(s)
      久保英人
    • Organizer
      日本金属学会秋期大会
    • Place of Presentation
      熊本大学
    • Year and Date
      2008-09-23
  • [Presentation] Nanostructure analysis by using coherent X-ray diffraction (招待講演)2008

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      IUCr2008 Satellite Meeting on Development of Advanced Instruments for New Electron Microscopy and Diffraction
    • Place of Presentation
      Nagoya, Japan
    • Year and Date
      2008-09-02
  • [Presentation] 3D view of mesoscopic internal structure by coherent hard X-ray diffraction (招待講演)2008

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      2008-08-28
  • [Presentation] Nanostructure analysis by using coherent X-ray diffraction (招待講演)2008

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      IUCr2008 Satellite Meeting on X-ray and Neutron Techniques for Nano-Structural Research
    • Place of Presentation
      Hyogo, Japan
    • Year and Date
      2008-08-22
  • [Presentation] Nanotstructure analysis of metallic materials by coherent x-ray diffraction microscopy2008

    • Author(s)
      Yukio Takahashi
    • Organizer
      2008 Denver X-ray Conference
    • Place of Presentation
      Denver, Colorad, USA(口頭発表)
    • Year and Date
      2008-08-07
  • [Presentation] 分裂期染色体内のヒトゲノムDNAの高次構造(依頼講演)2008

    • Author(s)
      前島一博
    • Organizer
      九州工業大学情報工学部生命情報工学科講演会
    • Place of Presentation
      九州工業大学
    • Year and Date
      2008-08-05
  • [Presentation] 元素識別可能なコヒーレントX線回折顕微法の開発2008

    • Author(s)
      久保英人
    • Organizer
      精密工学会関西支部2008年度関西地方定期学術講演会
    • Place of Presentation
      堺市産業振興センター(口頭発表)
    • Year and Date
      2008-07-29
  • [Presentation] Nanostructure analysis by coherent hard x-ray Diffraction2008

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 9th International Conference on X-Ray Microscopy
    • Place of Presentation
      Zurich, Switzerland(口頭発表)
    • Year and Date
      2008-07-24
  • [Presentation] Development of element-specific hard-x-ray diffraction microscopy (ポスター)2008

    • Author(s)
      Yukio Takahashi
    • Organizer
      9th International Conference of X-ray Microscopy
    • Place of Presentation
      Zurich, Switzerland
    • Year and Date
      2008-07-23
  • [Presentation] 細胞機能の3次元ナノイメージング(招待講演)2008

    • Author(s)
      前島一博
    • Organizer
      「分裂期染色体の構造」日本細胞生物学会年会ミニシンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-06-29
  • [Presentation] Mitotic chromosome structure : irregular folding of nucleosome fiber2008

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      International Symposium on Chromosome Dynamics
    • Place of Presentation
      Ise, Japan(口頭発表)
    • Year and Date
      2008-05-30
  • [Presentation] Coherent X-ray diffraction microscopy (招待講演)2008

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      Symposium "Present Status and Future Prospect of Microscopy by Leading Young Asian Researchers" at the 2008 annual meeting of the Japanese Society of Microscopy (JSM-2008)
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2008-05-21
  • [Book] 細胞工学別冊「電子顕微鏡で読み解く生命のなぞ(ナノワールドに迫るパワフル技術入門)」2008

    • Author(s)
      前島一博
    • Total Pages
      147
    • Publisher
      秀潤社(執筆分担)

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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