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2009 Fiscal Year Annual Research Report

DNAポリカテナンの合成と光制御および機能の探索

Research Project

Project/Area Number 19350062
Research InstitutionKansai University

Principal Investigator

大矢 裕一  Kansai University, 化学生命工学部, 教授 (10213886)

Keywords超分子化学 / 自己組織化 / ポリカテナン / 光反応 / 核酸 / DNA / 分子スイッチ / 電気泳動
Research Abstract

本年度はDNAカテナンのナノ(分子)マシンとしての機能を評価することを目的として研究を行った。以前報告したTAC法を応用して,蛍光色素としてフルオレセインとTAMRAを所定の位置に導入した蛍光色素導入DNA[2]-カテナンの合成を酵素法により行った。電気泳動法により,目的とする色素導入DNA[2]-カテナンの生成を確認した。8Mの尿素を含む12%ポリアクリルアミドゲルを調製し,100Vで5時間泳動させ,目的とする二種類の蛍光色素を導入したDNA[2]-カテナンが得られていることを確認した。
続いて,合成した蛍光色素導入DNA[2]-カテナンのナノマシンとしての機能評価を行った。駆動力となるFuel DNAを添加する前後での蛍光スペクトルを測定し,ナノマシンとしての動作を確認した。このシステムでは,初期状態では,フルオレセインとTAMRAが近接するように,Fuel DNA添加後にはDNAの相補鎖の組み換わり・回転が起こり,それらが空間的に離れるよう設計した。初期状態での蛍光スペクトルを測定し,蛍光共鳴エネルギー移動により,フルオレセインの蛍光消光とTAMRAの発光が見られることを確認した。次にFuel DNAを加えて,アニーリングを行い,フルオレセインの蛍光強度が増大することを確認した。さらに,Fuel DNAと相補的なAnti-fuel DNAを加えた後に再度アニーリングを行ったところ蛍光消光が起こり,初期の状態に戻っていることを確認した。これらの結果から,設計通りにDNA[2]-カテナンがナノ(分子)マシンとして働くことが示唆された。

  • Research Products

    (5 results)

All 2009

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Synthesis of Oligo-DNA Containing Hydrophilic Porphyrin in the Main Chain, and Its Energy Transfer Behavior in Duplex State2009

    • Author(s)
      大矢裕一
    • Journal Title

      Supramol.Chem. 21

      Pages: 301-309

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNAナノアレイと開閉可能なDNAナノボックス-DNAはナノマテリアルとして実用可能か?2009

    • Author(s)
      大矢裕一
    • Journal Title

      化学 64

      Pages: 72-73

  • [Presentation] Synthesis and Characterization of DNA Catenane as Nanomachine2009

    • Author(s)
      上原岳暁
    • Organizer
      JST-CREST International Symposium 2009
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo(Tokyo)
    • Year and Date
      2009-11-10
  • [Presentation] 光連結反応によるDNAオリゴカテナン合成手法の検討2009

    • Author(s)
      上原岳暁
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県)
    • Year and Date
      2009-09-14
  • [Presentation] DNAカテナンの合成と分子マシンとしての機能評価2009

    • Author(s)
      上原岳暁
    • Organizer
      第19回バイオ・高分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2009-07-30

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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