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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ハイブリダイゼーション活性化反応の細胞内遺伝子機能性制御法への展開

Research Project

Project/Area Number 19350079
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

永次 史  Tohoku University, 多元物質科学研究所, 教授 (90208025)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井本 修平  東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (20447189)
Keywordsクロスリンク / オリゴDNA / ペプチド核酸 / In Cell Chemistry / インベージョン / RNA標的 / 遺伝子発現制御
Research Abstract

細胞内で非常に単純な化学反応が様々な情報伝達に関わっていることが明らかにされてきている。このような化学反応の制御は遺伝子発現を調節する新たな方法となる可能性を持つと考えられるが、細胞内で遺伝子に対する選択的な化学反応を誘導する手法は現在のところほとんどない。本研究では遺伝子を標的とした選択的な化学反応により、細胞内における遺伝子機能を制御する方法、すなわち遺伝子を標的とするIn Cell Chemistryを提案し、その実現にむけた新しい分子の設計・合成、さらには細胞内における機能評価を行い、高機能を有する新規人工遺伝子制御分子の開発を目的としている。その方法論として我々が独自に開発したハイブリダイゼーション活性化反応を細胞内の遺伝子制御方法として展開することを目指した。本年度は以下の2項目について検討した。
(1) 2本鎖DNAを標的とするHybridization Promoted Reactionの開発
(2) Hybridization Promoted Reactionを起こす第2世代人工機能性核酸の開発
その結果、(1)に関しては2本鎖DNAを標的とする反応を目指し、反応性核酸を組み込んだペプチド核酸の合成に成功し、モデルDNAに対して反応することを確認することができた。さらに反応性核酸を組み込んだPNAはRNAにも反応することがわかった。(2)に関しては新たにグアニンを標的としてアルキル化反応する分子を設計し、合成について検討した。その結果、反応性塩基としてシトシン誘導体の合成に成功し、その誘導体を組み込んだオリゴヌクレオチドの合成に成功した。さらに合成した反応性オリゴヌクレオチドが設計とは異なり、チミジンンに対して非常に効率的に反応することを明らかにした。

  • Research Products

    (27 results)

All 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (20 results)

  • [Journal Article] Incorporation of an inducible nucleotide analog into DNA by DNA polymerases2009

    • Author(s)
      Md. M. Ali b, S. Imoto, Y. Li S. Sasaki F. Nagatsugi
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. 17(In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA Templated Click Chemistry for Creation of Novel DNA Binding Molecules2008

    • Author(s)
      S. Imoto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett. 18

      Pages: 5660-5663

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis and Evaluation of the Luciferase-Oligodeoxynucleotide for the Sequences-Selective Detection of Nucleic Acids2008

    • Author(s)
      F. Nagatsugi, R. Nakahara, K. Inoue, S. Sasaki
    • Journal Title

      Arch. Pharm. Chem. Life Sci., (2008) 341

      Pages: 562-567

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of the Peptide Nucleic Acid (PNA) Incorporating 2-Amino-6-vinylpurine Derivative and Evaluation of the Reactivity2008

    • Author(s)
      S. Imoto, A. Shimotazawa, M. Goto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser. 52

      Pages: 391-392

  • [Journal Article] Synthesis of the new nucleoside analogue connecting 2-amino-6-vinylpurine to the 2'-deoxyribose skeleton via the methylene linker2008

    • Author(s)
      Y. Kurose, Y. Taniguchi, F. Nagatsugi, S. Sasaki
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser. 52

      Pages: 43-44

  • [Journal Article] New Methodology to Search for DNA Binding Ligands Basedon Duplex DNA-Templated Click Chemistry2008

    • Author(s)
      S. Imoto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser. 52

      Pages: 381-382

  • [Journal Article] Synthesis and Evaluation of the Peptide Nucleic Acids (PNAs) Incorporating Reactive Artificial Molecules2008

    • Author(s)
      S. Imoto, M. Goto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Journal Title

      Collection symposium series (2008) 10

      Pages: 414-416

  • [Presentation] DNAの構造制御を目指したペプチド導入分子モーターの開発2009

    • Author(s)
      小林麻衣, 永谷直人, 桑原俊介, 永次史
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-29
  • [Presentation] 分子モーターを組み込んだオリゴDNAの合成とその機能評価2009

    • Author(s)
      永谷直人, 桑原俊介, 原田宣之, 永次史
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] RNA選択的クロスリンク剤の開発2009

    • Author(s)
      堀常晃, 井本修平, 萩原伸也, 永次史
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] 反応性核酸を含むペプチド核酸(PNA)の合成と機能評価2009

    • Author(s)
      下田沢梓, 井本修平, 廣濱智哉, 後藤真, 永次史
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] DNAの構造制御を目指した分子モーターの合成とその機能評価2009

    • Author(s)
      永次史, 永谷直人, 小林麻衣子, 桑原俊介
    • Organizer
      日本薬学会第129年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2009-03-27
  • [Presentation] 2本鎖DNAの構造制御を目指した分子モーターの合成2008

    • Author(s)
      永次史
    • Organizer
      第11回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      群馬
    • Year and Date
      2008-11-28
  • [Presentation] RNA型クロスリンク剤の合成とその機能評価2008

    • Author(s)
      永次史, 堀常晃, 井本修平, 萩原伸也
    • Organizer
      第18回アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-11-18
  • [Presentation] グアニンを標的とした新規クロスリンク剤の設計と合成2008

    • Author(s)
      服部恵一, 井本修平, 永次史
    • Organizer
      第34回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-11-15
  • [Presentation] DNAの構造制御を目指した新規分子モーターの設計と合成2008

    • Author(s)
      小林麻衣子, 永谷直人, 桑原俊介, 永次史
    • Organizer
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-09-19
  • [Presentation] 遺伝子発現の選択的制御を目指した機能性分子の合成2008

    • Author(s)
      永次史
    • Organizer
      第2回機能性分子ミニシンポジウム
    • Place of Presentation
      筑波
    • Year and Date
      2008-09-10
  • [Presentation] Development of New DNA Binding Ligand Based on duplex DNA Templated Click Chemistry2008

    • Author(s)
      S. Imoto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Organizer
      Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRTXVIII) and 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-09-10
  • [Presentation] Synthesis of the Peptide Nucleic Acid (PNA) Incorporating 2-Amino-6-vinylpurine Derivative and Evaluation of the Reactivity2008

    • Author(s)
      S. Imoto, A. Shimotazawa, M. Goto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Organizer
      Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRTXVIII) and 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-09-10
  • [Presentation] Synthesis of the new nucleoside analogue connecting 2-amino-6-vinylpurine to the 2'-deoxyribose skeleton via the methylene linker2008

    • Author(s)
      Kurose Y., Taniguchi Y., Nagatsugi F., Sasaki S
    • Organizer
      Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRTXVIII) and 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-09-10
  • [Presentation] Development of the New Strategies by Artificial Molecules for Regulation of Gene Expression2008

    • Author(s)
      Fumi Nagatsugi
    • Organizer
      G-COE Sumer School
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2008-08-18
  • [Presentation] 遺伝子発現の選択的制御を目指した機能性分子の合成2008

    • Author(s)
      永次史
    • Organizer
      第20回生体機能関連化学若手の会
    • Place of Presentation
      白石
    • Year and Date
      2008-08-10
  • [Presentation] 応性ペプチド核酸の合成と機能評価2008

    • Author(s)
      下田沢梓, 井本修平, 廣濱智哉, 後藤真, 永次史
    • Organizer
      第20回生体機能関連化学若手の会
    • Place of Presentation
      白石
    • Year and Date
      2008-08-10
  • [Presentation] DNAの構造制御を目指した分子モーター導入オリゴDNAの合成とその機能評価2008

    • Author(s)
      小林麻衣子, 永谷直人, 桑原俊介, 永次史
    • Organizer
      第20回生体機能関連化学若手の会
    • Place of Presentation
      白石
    • Year and Date
      2008-08-10
  • [Presentation] 細胞内におけるDNA高次構造認識分子の開発2008

    • Author(s)
      永次史
    • Organizer
      第4回ライフサーベイヤシンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-06-26
  • [Presentation] Synthesis and Evaluation of the Peptide Nucleic Acids (PNAs) Incorporating Reactive Artificial Molecules2008

    • Author(s)
      S. Imoto, M. Goto, T. Hirohama, F. Nagatsugi
    • Organizer
      XIV Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components
    • Place of Presentation
      Czech Republic
    • Year and Date
      2008-06-10
  • [Presentation] 誘起反応性クロスリンク核酸を用いた遺伝子配列特異的な薬物放出システムの開発2008

    • Author(s)
      永次史, 中山静香, 志茂祐輔, 井本修平, 佐々木茂貴
    • Organizer
      第3回ケミカルバイオロジー研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-05-20

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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