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2008 Fiscal Year Annual Research Report

チオシアネート加水分解酵素コバルト反応中心の機能と形成の分子機構

Research Project

Project/Area Number 19350080
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

尾高 雅文  Tokyo University of Agriculture and Technology, 大学院・共生科学技術研究院, 准教授 (20224248)

Keywords加水分解酵素 / チオシアネート加水分解酵素 / ニトリルヒドラターゼ / 翻訳後修飾 / アクセサリー蛋白質 / 金属酵素 / 結晶構造解析 / 無細胞タンパク質合成
Research Abstract

チオシアネート加水分解酵素(SCNase)はチオシアネートの水和、加水分解反応を触媒する酵素であり、アミノ酸配列や立体構造の高い相同性からニトリルヒドラターゼ(NHase)と同ファミリーに分類される。触媒中心は翻訳後修飾を受けた2つのシステイン配位子を含む特異な構造のコバルトセンターであり、γサブユニットに結合している。本年度はコバルト反応中心の機能を明らかにするために以下の研究を行った。SCNase基質ポケットに存在する2つのアルギニン残基(βArg90,γArg136)をそれぞれNHaseで保存されているフェニルアラニンとトリプトファンに置換した変異体を作成し、酵素活性に対する影響を解析した。その結果いずれの変異体もSCNase活性を示さず、弱いNHase活性を示した。すなわち、両酵素の基質選択性は基質ポケットの環境の違いにあり、触媒反応機構自体は同様に進行すると考えられた。SCNaseの触媒反応は早すぎて時間経過を構造から追跡することは不可能なため、通常基質の1/100000程度のkcatで反応する非常に弱い基質t-butylisonitrileを用い、鉄型NHaseの時間分割結晶構造解析を行った。その結果、基質は鉄反応中心の第6配位座に結合した後、システインスルフェン酸酸化修飾の酸素原子で活性化された水分子の攻撃を受け、水和されることが示唆された。前述の変異体の実験から両酵素の反応機構は基本的に同一であることが予測されるため、SCNaseにおいても、コバルト反応中心のシステインスルフェン酸酸化修飾が触媒反応において、溶媒の水分子を活性化して基質に求核攻撃をしていることが予測された。

  • Research Products

    (18 results)

All 2009 2008

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (13 results)

  • [Journal Article] アクリルアミド生産反応の謎2009

    • Author(s)
      尾高雅文
    • Journal Title

      現代化学 458

      Pages: 51-58

  • [Journal Article] Catalytic mechanism of nitrile hydratase proposed by time-resolved x-ray crystallography using a novel substrate, tert-butylisonitrile2008

    • Author(s)
      Koichi Hashimoto
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 283

      Pages: 36617-36623

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel catalytic activity of nitrile hydratase from Rhodococcus sp. N77 12008

    • Author(s)
      Kayoko Taniguchi
    • Journal Title

      Journal of Bioengineering and Bioscience 106

      Pages: 174-179

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and molecular dynamics simulation of archaeal prefoldin : the molecularmechanism for binding and recognition of nonnative substrate proteins2008

    • Author(s)
      Akashi Ohtaki
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology 376

      Pages: 1130-1141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of aspartate racemase complexed with a dual substrate analogue, citric acid, and implications for the reaction mechanism2008

    • Author(s)
      Akashi Ohtaki
    • Journal Title

      Proteins 70

      Pages: 1130-1141

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] チオシアネート加水分解酵素基質特異性に対する基質ポケット近傍アミノ酸残基の影響2008

    • Author(s)
      浪間聡志、堀祥太、荒川孝俊、養王田正文、尾高雅文
    • Organizer
      第3回バイオ化学関連合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20080900
  • [Presentation] 変異体結晶構造解析による鉄型Nitrile Hydratase触媒反応機構の研究2008

    • Author(s)
      山中保明、橋本浩一、養王田正文、尾高雅文
    • Organizer
      第3回バイオ化学関連合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20080900
  • [Presentation] 全反射吸収赤外分光法と時間分割X線結晶構造解析 : ニトリルヒドラターゼの水和反応機構解析2008

    • Author(s)
      橋本浩一、鈴木博行、谷口佳代子、野口巧、養王田正文、尾高雅文
    • Organizer
      第35回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      20080600
  • [Presentation] チオシアネート加水分解酵素の成熟機構2008

    • Author(s)
      尾高雅文、堀祥太、荒川孝俊、片山葉子、中山洋、堂前直、三野広幸、養王田正文
    • Organizer
      第35回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      兵庫
    • Year and Date
      20080600
  • [Presentation] 基質ポケット近傍アミノ酸残基のチオシアネート加水分解酵素基質特異性に対する影響2008

    • Author(s)
      浪間聡志、養王田正文、尾高雅文
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080500
  • [Presentation] 変異体結晶構造解析によるFe-type Nitrile Hydratase触媒反応機構の研究2008

    • Author(s)
      山中保明、橋本浩一、養王田正文、尾高雅文
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080500
  • [Presentation] Maturation mechanism of a new nitrile hydratase family protein, thiocyanate hydrolase2008

    • Author(s)
      Masafumi Odaka
    • Organizer
      the 4th Asian Biological InorganicChemistry Conference
    • Place of Presentation
      済州島
    • Year and Date
      2008-11-13
  • [Presentation] 活性イヒ蛋白質15Kによるチオシアネート加水分解酵素の成熟機構2008

    • Author(s)
      尾高雅文
    • Organizer
      第58回錯体化学討論会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2008-09-21
  • [Presentation] コバルト型nitrile hydratase 成熟過程における活性化タンパク質P14Kの機能解析2008

    • Author(s)
      清水敏史
    • Organizer
      第3回バイオ化学関連合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-18
  • [Presentation] Maturation mechanism of a new nitrile hydratase family protein, thiocyanate hydrolase2008

    • Author(s)
      Masafumi Odaka
    • Organizer
      The 9th European Biological ChemistryConference, EUROBIC 9
    • Place of Presentation
      ボロツワフ
    • Year and Date
      2008-09-03
  • [Presentation] Structural evidence for the catalytic mechanism of nitrile hydratase proposed bytime-resolved x-ray crystallography using a novel substrate. tert-butylisonitrile2008

    • Author(s)
      Koichi Hashimoto
    • Organizer
      The 9th European Biological ChemistryConference, EUROBIC 9
    • Place of Presentation
      ボロツワフ
    • Year and Date
      2008-09-03
  • [Presentation] Delay-Time Resolved x-ray Crystallographic Analysis of ReactionMechanism of Nitrile Hydratase2008

    • Author(s)
      Koichi Hashimoto
    • Organizer
      xxI Congress and General Assembly of TheInternational Union of Crystallography (IUCr)
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      2008-08-26
  • [Presentation] チォシアネート加水分解酵素の成熟機構2008

    • Author(s)
      尾高 雅文
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-06-11

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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