• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2009 Fiscal Year Annual Research Report

DNA組換えにおける、相同性識別忠実度を支配する分子機構

Research Project

Project/Area Number 19370004
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

柴田 武彦  The Institute of Physical and Chemical Research, 柴田遺伝制御科学研究室, 上席研究員 (70087550)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 美川 務  独立行政法人理化学研究所, 城生体金属科学研究室, 専任研究員 (20321820)
井上 仁  独立行政法人理化学研究所, 柴田遺伝制御科学研究室, 協力研究員 (10469893)
Keywordsゲノム構築・機能・再編・発現・維持 / 相同DNA組換え / RecA / Rad51型相同的対合蛋白質 / 相同DNA組換え酵素 / 組換えメディエーター / ヘテロ二重鎖形成 / 並行三重鎖DNA / DNAトポロジー
Research Abstract

相同的組換えは、遺伝情報の維持と多様化という相反する機能を担う。一対のDNAの塩基配列相同性を識別してヘテロ二重鎖組換え中間体をつくる相同DNA対合蛋白質の、数千塩基対にも及ぶ相同性の識別と、相同性識別忠実度の制御解明が本研究の当初の目的である。そこで高忠実度相同性識別を行なうRecA/Rad51型蛋白質と、ATP分解活性をもたず、識別が甘いと考えられるRecO,Rad52などの相同対合蛋白質とを比較解析してきた。生体内でRecA/Rad51の結合を阻害する単鎖DNA結合蛋白質(SSB/RPA)で覆われた単鎖DNA領域へRecA/Rad51を載せるのが、RecO,Rad52のもう一つの顔である組換えメディエーターである。組換えメディエーターの全てがATP不要の相同対合活性をもつが、意義は不明である。昨年度、ミトコンドリアでRecAを伴わずに相同DNA組換えを行うATP不要型相同対合蛋白質Mhr1が、RecAやRad51と全く異なる機構で、Dループではなく三重鎖DNAと考えられる反応産物を作ることを明らかにした。特に重要な点は、周囲に左巻きの超らせんを生じるRecA/Rad51の場合と異なり、トポロジカルな影響を周囲に与えずに相同対合をおこなうという、反応機構の本質に関わる意外な特性である。そこで、ヒトRAD51とATP不要型相同対合蛋白質であるRecO,Mhr1に加えてウイルスのRecTについて相同対合中間体である蛋白質・単鎖DNA複合体中の単鎖DNA構造をNMRで比較解析したところ、全て共通に先にRecAについて明らかにした特異な伸長構造をとっており、それは、一昨年解かれたRecA-単鎖DNA複合体結晶中の単鎖DNAの構造と共通であった。そこで、相同DNA対合、それが必須な相同DNA組換えは蛋白質の機能ではなくDNA分子固有の機能であるという我々の主張が裏付けられた。

  • Research Products

    (11 results)

All 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (7 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Analysis of DNA-binding sites on Mhr1, a yeast mitochondrial ATP-independent homologous pairing protein2010

    • Author(s)
      Masuda, T.
    • Journal Title

      FEBS J. 277

      Pages: 1440-1452

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A non-canonical DNA structure enables homologous recombination in various genetic systems2009

    • Author(s)
      Masuda, T.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 284

      Pages: 30230-30239

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Heteroduplex joint formation free of net topological change by Mhr1, a mitochondrial recombinase2009

    • Author(s)
      Ling, F.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 284

      Pages: 9341-9353

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 相同DNA組換えにおける2種の相同DNA対合蛋白質の役割分担2010

    • Author(s)
      柴田武彦
    • Organizer
      第27回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      静岡県御殿場市
    • Year and Date
      20100121-20100122
  • [Presentation] The universal structure of ssDNA in homologous recombination2009

    • Author(s)
      増田ときは
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20091207-20091210
  • [Presentation] NMR analyses of inter-actions of RecO with SSB and ssDNA2009

    • Author(s)
      井上仁
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20091207-20091210
  • [Presentation] RecAの最小機能単位-単量体及び二重体の活性-2009

    • Author(s)
      笠置原央
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20091207-20091210
  • [Presentation] Search for new functions of a recombination mediator, RAD522009

    • Author(s)
      柴田武彦
    • Organizer
      International Symposium on Chromosome cycle and genome dynamics
    • Place of Presentation
      Nasu, Tochigi
    • Year and Date
      20091111-20091112
  • [Presentation] Thermus thermophilusHB8のDNA相同組換え系2009

    • Author(s)
      井上仁
    • Organizer
      理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第8回連携研究会」
    • Place of Presentation
      兵庫県播磨
    • Year and Date
      20090821-20090823
  • [Presentation] NMR解析によるRecO上のSSB結合部位の同定2009

    • Author(s)
      井上仁
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      熊本県熊本市
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Book] "Epitope mapping by region-specified pcr-mutagenesis" in Epitope mapping protocols : second edition. Methods in Molecular Biology. vol.524, (Reineke, U.and Schutkowski, M., eds)pp.305-3132009

    • Author(s)
      Mikawa, T.
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      The Humana Press Inc., New York, NY, USA

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi