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2007 Fiscal Year Annual Research Report

蛋白質の中性子構造解析を推進するための技術的基盤の確立

Research Project

Project/Area Number 19370046
Research InstitutionJapan Atomic Energy Agency

Principal Investigator

黒木 良太  Japan Atomic Energy Agency, 量子ビーム応用研究部門, 研究主席 (30391246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 玉田 太郎  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹 (50391248)
城所 俊一  長岡技術科学大学, 工学部, 准教授 (80195320)
斎藤 稔  弘前大学, 理工学部, 教授 (60196011)
安達 基泰  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究員 (60293958)
大原 高志  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究員 (60391249)
Keywords中性子解析 / 水素原子 / 水和水 / 結晶構造 / タンパク質
Research Abstract

平成19年度は、ヒト免疫不全ウイルス由来のプロテアーゼ(HIV-PR)について、結晶格子内の接触部位にアミノ酸置換を導入し、結晶成長をコントロールすることによって蛋白質結晶の大型化を試みた。
まずHIV-PR結晶の成長方向と結晶内のパッキングを関連づけるため、結晶の外見から成長方向の遅い方向に向かってX線を照射し、一致する結晶格子軸を観測した。既に決定されたX線結晶構造から、結晶の成長方向に寄与する分子間接触部位のアミノ酸を同定した。さらに相互作用を疎水的相互作用に置き換え、得られた変異タンパク質を精製した、精製した変異タンパク質を結晶化し、その回折能と立体構造を決定したところ、変異体のいくつかは野生型タンパク質の結晶と同程度の回折分解能を示した。現在その置換効果をさらに検討中である。一方、取得したHIV-PRの大型単結晶の取得に成功したので、この結晶を用いて2.3A分解能の中性子回折データの収集にも成功した。
平成19年度の研究成果は、研究発表欄に記載のとおり、査読付き論文2報を発表するとともに、4件の学会発表を行った。

  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of polyketide synthase-1(PKS-1)from Cannabis sativa2008

    • Author(s)
      Taguchi, C, et. al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F 64

      Pages: 217-220

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protonation states of buried histidine residues in human deoxyhemoglobin revealed by neutron crystallography2008

    • Author(s)
      Chatake, T., et. al.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 129

      Pages: 14840-14841

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural refinement and extraction of hydrogen atomic positions in polyoxymethylene crystal based on first successful measurements of 2-dimensinal high-energy synchrotron x-ray diffraction and wide-angleneutron diffraction pattern of hydrogenated and deuterated species2007

    • Author(s)
      Tashiro, K.
    • Journal Title

      Polymer J. 39

      Pages: 1253-1273

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] X線と中性子を用いて観測した蛋白質水和水の熱力学的特徴2007

    • Author(s)
      黒木 良太
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会ワークショップ
    • Place of Presentation
      横浜国際会議場(横浜)
    • Year and Date
      2007-12-21
  • [Presentation] 定常炉中性子によるタンパク質立体構造解析2007

    • Author(s)
      黒木 良太
    • Organizer
      日本中性子科学会第7回年会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡)
    • Year and Date
      2007-11-28
  • [Presentation] Protein structure analysis using neutron diffraction2007

    • Author(s)
      黒木 良太
    • Organizer
      Lecture at Max Plank Inst.
    • Place of Presentation
      Max Plank Inst.
    • Year and Date
      2007-09-10
  • [Presentation] 甲性子を用いたタンパク質の立体構造解析の現状と新展開2007

    • Author(s)
      黒木 良太
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会ワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台国際会議場(仙台)
    • Year and Date
      2007-05-25
  • [Remarks] (更新作業中)

    • URL

      http://hhdb.tokai-sc.jaea.go.jp

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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