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2008 Fiscal Year Annual Research Report

蛋白質の中性子構造解析を推進するための技術的基盤の確立

Research Project

Project/Area Number 19370046
Research InstitutionJapan Atomic Energy Agency

Principal Investigator

黒木 良太  Japan Atomic Energy Agency, 量子ビーム応用研究部門, 研究主席 (30391246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 城所 俊一  長岡技術科学大学, 工学部, 準教授 (80195320)
玉田 太郎  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹 (50391248)
安達 基泰  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究職 (60293958)
大原 高志  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究職 (60391249)
岡崎 伸生  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究職 (60391900)
Keywordsタンパク質 / 水和水 / 創薬標的タンパク質 / 結晶構造 / 中性子解析
Research Abstract

平成20年度は、下記の項目を実施した。
1)中性子利用のための基盤技術開発
ヒト免疫不全ウイルス由来のプロテアーゼ(HIV-PR)を試料として、バックグラウンド低減を目的とした完全重水素化試料を調製し、その試料を用いて中性子回折実験を行った。結晶体積が小さかったが、約3Å分解能の回折点を観測できた。タンパク質試料を逐次添加する結晶大型化技術開発では、大型化を自動化する装置を作製し、実際の結晶の大型化に用いた。生体水素水和水データベース(HHDB)による構造評価機能の高度化では、水分子の正確な位置の同定機能を付加した。
2)代表的な創薬標的タンパク質の結晶の大型化および中性子構造解析
ヒト免疫不全ウイルス由来のプロテアーゼ(HIV-PR)およびブタすい臓エラスターゼの阻害剤複合体の中性子回折データおよびX線回折データを同一結晶から収集し、立体構造解析を決定した。ヒト免疫不全ウイルス由来のプロテアーゼ(HIV-PR)全原子構造解析の結果をPNAS誌に発表(3/24)した。そしてブタすい臓エラスクーゼの阻害剤複合体の全原子構造解析の結果をJACS誌へ投稿中。

  • Research Products

    (10 results)

All 2009 2008

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Structure of HIV-1 protease in complex with potent inhibitor KNI-272 determined by high-resolution X-ray and neutron crystallography2009

    • Author(s)
      Adachi, M, et al.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106

      Pages: 4641-4646

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein2009

    • Author(s)
      Yamaguchi, et al.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106

      Pages: 440-444

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary neutron diffraction studies of HIV-1 protease cocrystallized with inhibitor KNI-2722008

    • Author(s)
      Matsumura H., et al.
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F : Structural Biology and Crystallization Communications 64

      Pages: 1003-1006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutagenesis of the crystal contact of acidic fibroblast growth factor2008

    • Author(s)
      Honjo, et al.
    • Journal Title

      J Synchrotron Radiat 15

      Pages: 285-287

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 中性子と放射光の相補的な利用による創薬標的タンパク質の立体構造解析2009

    • Author(s)
      黒木良太
    • Organizer
      日本薬学会第129回年回
    • Place of Presentation
      京都国際会議場
    • Year and Date
      2009-03-27
  • [Presentation] Neutron Crystallography for Investigation of Catalytic Mechanism of HIV-1 protease2009

    • Author(s)
      安達基泰 黒木良太, 他
    • Organizer
      ATI国際フォーラム
    • Place of Presentation
      テクノ交流間リコッティ(茨城県東海村)
    • Year and Date
      2009-03-10
  • [Presentation] HIV-1プロテアーゼの中性子結晶構造解析2008

    • Author(s)
      安達基泰
    • Organizer
      日本中性子科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2008-12-02
  • [Presentation] Structures of Drug-Target Proteins Determined by both X-ray and Neutron Diffraction2008

    • Author(s)
      黒木良太
    • Organizer
      IUCr-International Union of Crystall ography. IUCr Congress 08
    • Place of Presentation
      Grand Cube Osaka (大阪市)
    • Year and Date
      2008-08-25
  • [Presentation] 医薬品作用の基本原理:分子のかたちと分子認識2008

    • Author(s)
      黒木良太
    • Organizer
      九州大学薬学部公開講座
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡市)
    • Year and Date
      2008-07-20
  • [Book] 『たんぱく質結晶の新展開』第2編第6章抗体を用いた結晶化、第3編第2章中性子2008

    • Author(s)
      黒木良太(分担執筆)
    • Total Pages
      16
    • Publisher
      (株)シーエムシー出版

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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