• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2007 Fiscal Year Annual Research Report

ヌクレオソーム構造変換機構を介した染色体機能領域形成機構

Research Project

Project/Area Number 19370049
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

堀越 正美  The University of Tokyo, 分子細胞生物学研究所, 准教授 (70242089)

Keywordsクロマチン / 染色体 / 遺伝子サイレンシング / ヒストンシャペロン / ヒストン化学修飾
Research Abstract

本研究課題では,i)染色体機能領域及び境界領域の形成機構に関する共通性と多様性の解明,及び,ii)染色体機能領域の形成に伴うヌクレオソーム構造変換機構の解明,を主目的としている。それぞれについて,当該年度の研究の成果を報告する。
i)の解析では,出芽酵母の接合型遺伝子座領域であるHMR locusに位置するtRNA遺伝子(RNAポリメラーゼIII転写系遺伝子)に焦点を当て,同遺伝子周辺領域の染色体機能領域及び境界領域の形成機構の解析を行った。ヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)であるSir2pの脱アセチル化活性が関与しないことを明らかにしていたが,同領域のヒストンH4-K16のアセチル化レベルが低く抑えられていることから,他のHDACの関与が考えられた。そこで,他のHDAC9種類それぞれに対してSir2pとの二重欠損株を作製し,ヒストンH4-K16のアセチル化レベルが上昇するかをクロマチン免疫沈降法により解析したが,アセチル化レベルの上昇は見られなかった。今後,H4-K16以外の残基の化学修飾の関与の可能性,RNAポリメラーゼIII転写系特有の因子の関与の可能性等を検証することで,同課題の解決を目指す。
ii)の解析では,ヒストンシャペロンCIAと転写基本因子TFIID最大サブユニットであるCCG1のブロモドメイン(アセチル化残基認識ドメイン)との複合体立体構造を,X線結晶構造解析により3.3Aの解像能で明らかにした。本結果及び研究代表者が解明したCIA-ヒストンH3-H4複合体構造により,細胞内外から伝達された情報の集約と考えられるヒストン化学修飾からヌクレオソーム構造変換反応に至るまでのDECODE過程の反応中間状態を世界に先駆けて示すことができた。また,ヒストン化学修飾,脱修飾による染色体機能領域の規定からヌクレオソーム構造変換による染色体機能領域の形成に至る反応の流れを予測可能にした点でも,当該研究の前進に大きく貢献したといえる。

  • Research Products

    (21 results)

All 2008 2007

All Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 13 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esalpresumed chromodomain2008

    • Author(s)
      S. Hideaki, et. al.
    • Journal Title

      J. Mol. Biol (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Promoter region-specific histone incorporation by the novel histone chaperone ANP32B and DNA-binding factor2008

    • Author(s)
      Y. Munemasa, et. al.
    • Journal Title

      Mol. Cell. Biol 28

      Pages: 1171-1181

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hisone chaperones: 30 years from isolation to elucidation of the mechanisms of nucleosome assembly and disassembly2008

    • Author(s)
      M. Eitoku, et. al.
    • Journal Title

      Cell. Mol. Life Sci 65

      Pages: 414-444

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for the recognition between the regulatory particles Nas6 and Rpt3 of the yeast 26S proteasome2007

    • Author(s)
      Y. Nakamura, et. al.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun 359

      Pages: 503-509

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional interaction between the transcription factor Kruppel-like factor 5 and poly(ADP-ribose) polymerase-12007

    • Author(s)
      T. Suzuki, et. al.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 282

      Pages: 9895-9901

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and function of the histone chaperone CIA/ASF1 complexed with hisontes H3 and H42007

    • Author(s)
      R. Natsume, et. al.
    • Journal Title

      Nature 446

      Pages: 338-341

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Relationship between the structure of SET/TAF-Iβ/INHAT and its histone chaperone activity2007

    • Author(s)
      S. Muto, et. al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A 104

      Pages: 4285-4290

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strucyure of the Oncoprotein Gankyrin in Complex with S6 ATPase of the 26S Proteasome2007

    • Author(s)
      Y. Nakamura, et. al.
    • Journal Title

      Structure 15

      Pages: 179-189

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the human Brd2 bromodomain:Insights into dimerization and recognition of acetylated2007

    • Author(s)
      Y. Nakamura, et. al.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 282

      Pages: 4193-4201

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural polymorphism of chromodomains in Chd12007

    • Author(s)
      M. Okuda, et. al.
    • Journal Title

      J. Mol. Biol 365

      Pages: 1047-1062

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification, crystallization and prelimilary X-ray diffraction analysis of the non-ATPase subunit Nas6 in complex with the ATPase subunit Rpt3 of the 26S proteasome from Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      Y. Nakamura, et. al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F 63

      Pages: 190-192

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Global analysis of functional surfaces of core histones with comprehensive point mutants2007

    • Author(s)
      K. Matsubara, et. al.
    • Journal Title

      Genes Cells 12

      Pages: 13-33

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene selectors consisting of DNA-binding proteins, histones, and histone-binding proteins regulate the three major stages of gene expression2007

    • Author(s)
      S. Mutoand M. Horikoshi
    • Journal Title

      Nuclear Dynamics:Molecular blology and visualization of the nucleus

      Pages: 145-175

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] From hitonr modification to nuclesome disassembly2008

    • Author(s)
      M. Horikoshi
    • Organizer
      Keystone Symposia-Molecular Basis for Chromatin Modifications and Epigenetic Phenomena
    • Place of Presentation
      Denver,CO,USA
    • Year and Date
      2008-04-08
  • [Presentation] From histone modification to nuclesome disassembly2008

    • Author(s)
      M. Horikoshi
    • Organizer
      Keystone Symposia-Regulatory Mechanisms in Eukaryotic Transcription
    • Place of Presentation
      Denver,CO,USA
    • Year and Date
      2008-02-05
  • [Presentation] ヒストンシャペロン;半保存的ヌクレオソーム複製及びエピジェネティック情報伝達-ヒストンシャペロン単離からヌクレオソーム構造変換機構までの30年-2007

    • Author(s)
      堀越 正美
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-11
  • [Presentation] DNAの半保存的複製からヌクレオソームの半保存的複製モデルへFrom DNA semi-conservative replication to nucleo somesemi-conservative replication model2007

    • Author(s)
      堀越 正美
    • Organizer
      国際シンポジウム"Geneexpressioncontrolandgenomeevolution"日本遺伝学会第79回大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2007-09-19
  • [Presentation] Gene regulation on both transcription and replication at nucleosomal levei-Combinatory analyses of comprehensive mutant library and microarray-2007

    • Author(s)
      M. Horikoshi
    • Organizer
      World Microarray Congress2007
    • Place of Presentation
      Vancouver,Canada
    • Year and Date
      2007-06-29
  • [Presentation] Watson-CrickによるDNAの半保存的複製からヌクレオソームの半保存的複製モデルへ2007

    • Author(s)
      堀越正美
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-26
  • [Presentation] From DNAsemi-conservative replication to nucleosome semi-conservative replication model2007

    • Author(s)
      M. Horikoshi
    • Organizer
      The 7th MBSJ Spring Symposium"Bioiogy-old codes and new molecules"
    • Place of Presentation
      Awaji,Hyogo,Japan
    • Year and Date
      2007-04-23
  • [Presentation] Structure and functional basis of the histone chaperone CIA/ASFI-histoneH3-H4 complex2007

    • Author(s)
      M. Horikoshi
    • Organizer
      Keystone Symposia:Mechanisms of Eukaryotic Transcription
    • Place of Presentation
      Denver,CO,USA
    • Year and Date
      2007-04-12

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi