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2007 Fiscal Year Annual Research Report

複製開始複合体の高次構造に基づく、複合体形成・DNA開裂・解離の分子機構解明

Research Project

Project/Area Number 19370077
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

片山 勉  Kyushu University, 大学院・薬学研究院, 教授 (70264059)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 植田 正  九州大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (90184928)
阿部 義人  九州大学, 大学院・薬学研究院, 准教授 (60315091)
KeywordsDNA複製 / DnaA / 細胞周期 / タンパク質複合体 / タンパク質機能構造解析 / ATP / ヘリカーゼ / DNA動態変化
Research Abstract

本研究計画では、DnaAによる複製開始複合体の高次構造を解析し、DNA開裂のためキーとなる複製開始複合体の機能構造を同定すること、および、DNA開裂のメカニズムを開始複合体の機能構造と連関させて解明すること、さらに、DNA開裂後におこる、DnaC依存DnaBヘリカーゼ装着機構を解析することなどを目的とした。初年度である本年度では、複製開始複合体の機能構造を同定するため、複製開始複合体形成とDnaBヘリカーゼ装着に関わるDnaA N末ドメインの機能構造解明を行った。まず、NMR解析により、このドメインの立体構造決定に成功した。加えて、変異体の解析により、DnaBヘリカーゼ装着に必要な機能構造を同定した。これに基づき、DnaBヘリカーゼ装着に必要な複製開始複合体の4次構造とメカニズムをモデル化した。この成果はJournal of Biological Chemistry誌で高く評価され上位1%の論文に授与される"Paper of the Week"に選定された。第2には、複製開始複合体の独自のモデルに基づき、1本鎖DNAとの相互作用に関わると推測されるDnaAの部分領域を推定した。この領域に多数の変異を独立に導入し分子遺伝学的かつ生化学的に解析したところ、実際、複製開始反応と2本鎖DNA開裂反応に特異的に必要とされるアミノ酸残基の同定した。これに基づき解析を進め、DNA開裂のためキーとなる複製開始複合体の機能構造の同定に成功した。さらに開始反応の制御メカニズムの検討も行い、さらに新たなモデルを発表した。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Roles for the AAA+motifs of DnaA in the initiation of DNA replication2008

    • Author(s)
      Katayama. T.
    • Journal Title

      Biochem.Soc.Trans. 36

      Pages: 78-82

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A common mechanism for the ATP-DnaA-dependent formation of open complexes at the replication origin2008

    • Author(s)
      Ozaki, S., et. al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 283

      Pages: 8351-8362

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The interaction of DiaA and DnaA regulates the replication cycle in E.coli by directly promoting ATP-DnaA-specific initiation complexes2007

    • Author(s)
      Keyamura, K., et. al.
    • Journal Title

      Genes Dev. 21

      Pages: 2083-2099

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and function of DnaA N-terminal domains:Specific sites and mechanisms in inter-DnaA interaction and in DnaB helicase loading on oriC2007

    • Author(s)
      Abe, Y., et. al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 282

      Pages: 17816-17827

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assignment of^1H,^<13>C and^<15>N resonances of N-terminal domains of DnaAprotein2007

    • Author(s)
      Abe, Y., et. al.
    • Journal Title

      Biomol.NMR Assign. 1

      Pages: 57-59

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 複製再開始抑制の分子機構2007

    • Author(s)
      片山 勉
    • Journal Title

      実験医学 25

      Pages: 49-55

  • [Presentation] 複製開始複合体中で特異的に形成されるDnaA機能領域を介した複製開始点開裂の分子機構2008

    • Author(s)
      尾崎 省吾, et. al.
    • Organizer
      2007年度組換え・第19回複製分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      修善寺
    • Year and Date
      20080304-07
  • [Presentation] Role for the DnaA sensorl motifin the tight affinity for ATP/ADP2008

    • Author(s)
      Shogo Ozaki, et. al.
    • Organizer
      Keysone Symposia in Molecular and Cellular Biology
    • Place of Presentation
      Santa Fe, NM, USA
    • Year and Date
      20080210-15
  • [Presentation] DnaAによる複製開始複合体の形成と2重鎖開裂機構モデル2007

    • Author(s)
      片山 勉, et. al.
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会ワークショップ
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] 染色体複製開始点の2重鎖DNA開裂を制御するDnaA新奇機能構造の解析2007

    • Author(s)
      尾崎 省吾, et. al.
    • Organizer
      日本遺伝学会第79回大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20070919-21
  • [Presentation] Biochemical analysis of DnaA AAA+domain on the ATP-dependentregulation for the initiation of chromosomal replication2007

    • Author(s)
      Tsutomu Katayama, et. al.
    • Organizer
      The Seventh International Meeting on AAA Proteins
    • Place of Presentation
      Royal Agricultural College, Cirencester, England
    • Year and Date
      20070909-13
  • [Presentation] Role for specific residues of DnaA AAA+domain in duplex DNA unwinding during the initiation of chromosomal replication2007

    • Author(s)
      Shogo Ozaki, et. al.
    • Organizer
      The Seventh International Meeting on AAA Proteins
    • Place of Presentation
      Royal Agricultural College, Cirencester, England
    • Year and Date
      20070909-13
  • [Remarks]

    • URL

      http://210.233.60.66/~bunsei/

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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