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2010 Fiscal Year Annual Research Report

シロアリ腸内の原生生物と細胞共生細菌の代謝共生機構の解明

Research Project

Project/Area Number 19380055
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

大熊 盛也  独立行政法人理化学研究所, 微生物材料開発室色, 室長 (10270597)

Keywords共生 / 原生生物 / 難培養微生物 / シロアリ / 微生物ゲノム / 共進化 / 細胞共生
Research Abstract

シロアリ腸内に高密度で生息する原生生物(単細胞の真核生物)と腸内細菌の大半を占める原生生物の細胞共生細菌は、腸内全体の代謝のほとんどを担うと考えられ、これらの細胞レベルでの共生機構を解明し、シロアリ共生微生物群によるバイオマス資源の効率的な利用について理解することを目的とする。特にセルロース分解に重要な大型原生生物の細胞内共生細菌のうち、未培養新門TG1とBacteroidales目のものは昨年度までに培養を介さずに完全ゲノムを解読して、セルロース分解代謝中間産物である糖を利用する代わりに窒素栄養化合物を生合成して宿主に供給するという共生機構を解明した。このうち、Bacteroidales目細胞内共生細菌は、生化学的に水素を利用する活性を確認していたが、解読ゲノム上には水素利用に働くはずのヒドロゲナーゼに相同性を有する遺伝子配列は認められず、新規の水素利用酵素・遺伝子の存在が示唆されている。腸内に共生する超鞭毛虫目原生生物について、メタEST情報に基づいて主要な代謝を推定し、特徴を考察した。シロアリ腸内共生原生生物には、これまでに水素生成能が示されていた超鞭毛虫目のものに加え、水素産生性の細胞内小器官であるヒドロゲノソームをもたないオキシモナス目の原生生物がいる。細胞を分画して、また、in situで細胞レベルでヒドロゲナーゼ活性の有無を検出した結果、オキシモナス目の原生生物にも高い水素生成活性があることが判明した。きらに、オキシモナス目原生生物の代表的な種から鉄型ヒドロゲナーゼの相同遺伝子を取得・同定した。これにより、オキシモナス目原生生物もセルロースを分解・代謝して水素を生成していることが示唆され、それらの細胞共生細菌も水素利用能を有する可能性が考えられた。

  • Research Products

    (17 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results) Book (7 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Symbiosis-symbiosis in the omics era2010

    • Author(s)
      Bonfante P, Visick K, Ohkuma M
    • Journal Title

      Environ.Microbiol.Rep

      Volume: 2 Pages: 475-478

  • [Journal Article] A great leap forward in microbial ecology2010

    • Author(s)
      Okabe, et al., (12名中10番目)
    • Journal Title

      Microbes Environ.

      Volume: 25 Pages: 230-240

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Reconstruction of primary metabolism and efficient cellulose utilization caused by independent lateral gene transfers in symbiotic protists in the gut of the termite Coptotermes formosanus2010

    • Author(s)
      Inoue J-I, Ohkuma M
    • Organizer
      Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology
    • Place of Presentation
      筑波市
    • Year and Date
      20101207-20101208
  • [Presentation] Studies on hydrogenase genes of symbiotic oxymonad protists in the gut of the termite Reticulitermes speratus2010

    • Author(s)
      Inoue J-I, Sashida K, Usami R, Ohkuma M
    • Organizer
      第26日本微生物生態学会
    • Place of Presentation
      筑波市
    • Year and Date
      20101124-20101125
  • [Presentation] 複数遺伝子の結合データに基づくパラバサリア門原生生物の系統進化2010

    • Author(s)
      野田悟子、Eric Viscogliosi、大熊盛也
    • Organizer
      第43回日本原生動物学会大会
    • Place of Presentation
      水戸市
    • Year and Date
      20101106-20101107
  • [Presentation] シロアリ類に共生するSpirotrichonymphida目原生生物の分子系統解析2010

    • Author(s)
      高柳美希、栗崎倫江、大槻隆司、宇井定春、大熊盛也、野田悟子
    • Organizer
      第43回日本原生動物学会大会
    • Place of Presentation
      水戸市
    • Year and Date
      20101106-20101107
  • [Presentation] Symbioses of cellulolytic protists and their intracellular bacteria in the gut of termites2010

    • Author(s)
      Ohkuma M
    • Organizer
      The 2nd Japan-Korea International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      筑波市
    • Year and Date
      2010-11-26
  • [Presentation] Complete Genome Sequence of Bacterial Endosymbionts of Termite-Gut Protists and Exploiting Yet-Uncultured Microbial Resources2010

    • Author(s)
      Ohkuma M
    • Organizer
      The International Symposium for the Conservation and Sustainable Use of Asian Microbial Resources
    • Place of Presentation
      東京都品川
    • Year and Date
      2010-10-13
  • [Presentation] Complete genomes of uncultured bacterial endosymbionts of cellulolytic protists in the gut of termites2010

    • Author(s)
      Ohkuma M
    • Organizer
      International Conference on Culture Collections 12 (ICCC12)
    • Place of Presentation
      Florianopolis, Brazil
    • Year and Date
      2010-09-28
  • [Book] Biology of Termites : A Modern Synthesis2011

    • Author(s)
      Ohkuma M, Brune A
    • Total Pages
      413-438
    • Publisher
      Springer
  • [Book] Biology of Termites : A Modern Synthesis2011

    • Author(s)
      Brune A, Ohkuma M
    • Total Pages
      439-475
    • Publisher
      Springer
  • [Book] Microbiology Monographs vol.9 : (Endo)symbiotic methanogenic archaea2010

    • Author(s)
      Hongoh Y, Ohkuma M
    • Total Pages
      55-79
    • Publisher
      Springer
  • [Book] 難培養微生物研究の最新技術II2010

    • Author(s)
      大熊盛也
    • Total Pages
      281-287
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] 難培養微生物研究の最新技術II2010

    • Author(s)
      本郷裕一、大熊盛也
    • Total Pages
      51-60
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] メタゲノム解析技術の最前線2010

    • Author(s)
      野田悟子、大熊盛也
    • Total Pages
      127-136
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] IFO微生物学概論2010

    • Author(s)
      大熊盛也
    • Total Pages
      437-444
    • Publisher
      培風館
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.jp/r-world/info/release/news/2009/aug/frol_01.html

URL: 

Published: 2012-07-19  

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