Development of determination system of viral nucleic acid sequences

2008 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19380179
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Clinical veterinary science
• Research Institution: National Institute of Infectious Diseases
• Principal Investigator: MIZUTANI Tetsuya National Institute of Infectious Diseases, ウイルス第1部, 主任研究官 (70281681)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): FUKUSHI Shuetsu 国立感染症研究所, ウイルス第1部, 主任研究官 (80373398) ; ENDOH Daiji 酪農学園大学, 獣医学部, 教授 (40168828) ; MAEDA Ken 山口大学, 農学部, 教授 (90284273) ; ESHITA Yuki 大分大学, 医学部, 准教授 (10082223) ; IKEDA Masanori 岡山大学, 医学部, 准教授 (30315767) ; SAKAI Kouji 国立感染症研究所, ウイルス第1部, 研究官 (70515535)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): AKASHI Hiroomi 東京大学, 農学部, 教授
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Keywords: ウイルス / 網羅的検出方法 / 迅速 / 蚊 / コウモリなど

Research Abstract

獣医学領域においては未知のウイルスの感染が疑われる疾患は少なくない。検体導入時に既知のウイルスを検出できるプライマーセットを用いてPCRをおこない、既知のウイルスが検出されない場合には網羅的に検出できる方法(Rapid determination system of viral RNA/DNA nucleic acid sequences : RDV法)を用いて未知のウイルスを検出できるシステムを構築した。本研究では、ウイルスの網羅的検出方法を感度や操作方法を改良しながら、どの研究室でも取り扱えるようなシステム作りを目指した。本研究の成果は、蚊から新しいブニヤウイルス、コウモリからヘルペスウイルスなどの検出に成功したことである。

Research Products

• [Journal Article] Novel reovirus isolation from an Ostrich (Struthio camelus) in Japan. (2009)
  • Author(s): Kouji Sakai, Yuichi Ueno, Shuhei Ueda, Kaori Yada, Shuetsu Fukushi, Masayuki Saijo, Ichiro Kurane, Kenichiro Mutoh, Kazuki Yoshioka, Masayuki Nakamura, Kazuaki Takehara, Shigeru Morikawa, Tetsuya Mizutani.
  • Journal Title: Vet. Microbiol. 134 Pages: 227-232
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Novel virus discovery from field-collected mosquito larvae using an improved system for rapid determination of viral RNA sequences (RDV ver4.0). (2009)
  • Author(s): Yamao T, Eshita Y, Kihara Y, Satho T, Kuroda M, Sekizuka T, Nishimura M, Sakai K, Watanabe S, Akashi H, Rongsriyam Y, Komalamisra N, Srisawat R, Miyata T, Sakata A, Hosokawa M, Nakashima M, Kashige N, Miake F, Fukushi S, Nakauchi M, Saijo M, Kurane I, Morikawa S, Mizutani T.
  • Journal Title: Arch Virol. 154 Pages: 153-158
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Isolation of a novel adenovirus from a fruit bat (Pteropus dasymallus yayeyamae). (2008)
  • Author(s): Maeda K, Hondo E, Terakawa J, Kiso Y, Nakaichi M, Endoh D, Sakai K, Morikawa S, Mizutani T.
  • Journal Title: Emerging Infectious Diseases 14 Pages: 347-349
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Ligation-mediated amplification for effective rapid determination of viral RNA sequences (RDV). (2008)
  • Author(s): Shumpei Watanabe, Tetsuya Mizutani, Kouji Sakai, Kentaro Kato, Yukinobu Tohya, Shuetsu Fukushi, Masayuki Saijo, Yasuhiro Yoshikawa, Ichiro Kurane, Shigeru Morikawa, Hiroomi Akashi.
  • Journal Title: J. Clin. Virol. 43 Pages: 56-59
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] An improved procedure for rapid determination of viral RNA sequences for avian RNA virus. (2007)
  • Author(s): Kouji Sakai, Tetsuya Mizutani, Shuetsu Fukushi, Masayuki Saijo, Daiji Endoh, Ichiro Kurane, Kazuaki Takehara and Shigeru Morikawa
  • Journal Title: Arch. Virol. 152 Pages: 1763-1765
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Rapid determination of viral RNA sequences in field-collected mosquitoes. (2007)
  • Author(s): Yuki Kihara, Tomomitsu Satho, Yuki Eshita, Kouji Sakai, Akira Kotaki, Tomohiko Takasaki, Yupha Rongsriyam, Narumon Komalamisra, Raweewan Srisawat, Parichat Lapcharoen, Suchada Sumroiphon, Shiroh Iwanaga, Hiroshi Ushijima, Daiji Endoh, Takeshi Miyata, Akira Sakata, Nobuhiro Kashige, Fumio Miake, Shuetsu Fukushi, Masayuki Saijo, Ichiro Kurane, Shigeru Morikawa and Tetsuya Mizutani.
  • Journal Title: J. Virol. Methods. 146 Pages: 372-374
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 新興ウイルス感染症の網羅的検出方法(RDV法)の確立と応用 (2007)
  • Author(s): 水谷哲也
  • Journal Title: ウイルス 57 Pages: 217-226
• [Journal Article] Detection of a new bat gammaherpesvirus in the Philippines.
  • Author(s): Shumpei Watanabe, Naoya Ueda, Koichiro Iha, Joseph S. Masangkay, Hikaru Fujii, Phillip Alviola, Tetsuya Mizutani, Ken Maeda, Daisuke Yamane, Azab Walid, Kentaro Kato, Shigeru Kyuwa, Yukinobu Tohya, Yasuhiro Yoshikawa, Hiroomi Akashi.
  • Journal Title: Virus Genes. In press. Pages: 0
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 網羅的ウイルスゲノム検出法(RDV法)の改良 (2008)
  • Author(s): 渡辺俊平・水谷哲也・酒井宏治・福士秀悦・緒方もも子・遠矢幸伸・吉川泰弘・森川茂・倉根一朗・明石博臣
  • Organizer: 第56回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081000
• [Presentation] ヒト胃癌由来培養細胞に持続感染しているウイルスの同定 (2008)
  • Author(s): 大黒恵理子・水谷哲也・酒井宏治・高崎智彦・中村昇太・中屋隆明
  • Organizer: 第56回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081000
• [Presentation] 抗HCV活性を示すアラキドンサン代謝産物5-HETEの同定 (2008)
  • Author(s): 池田正徳、阿部健一、黒木美沙緒、有海康雄、團迫浩方、加藤宣之
  • Organizer: 第56回日本ウイルス学会学術集会・総会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081000
• [Presentation] 急性呼吸器患者から分離された新型レオウイルスの性状解析及びウスでの感染実験 (2008)
  • Author(s): 酒井宏治・網康至・水谷哲也・岩切章・山本正悟・平井明香・須崎百合子・滝本一広・田原口元子・飯塚愛恵・福士秀悦・西條政幸・永田典代・片山紀代・長谷川秀樹・山田靖子・倉根一郎・森川茂
  • Organizer: 第56回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081000
• [Presentation] ウイルスの網羅的検出法(RDV法)と次世代シーケンサーによる新しいウイルスの発見 (2008)
  • Author(s): 水谷哲也・山尾卓也・江下優樹・片野晴隆・黒田誠・関塚剛史・渡辺俊平・明石博臣・竹原一明・木原悠希・佐藤朝光・西村美保・酒井宏治・福士秀悦・西條政幸・緒方もも子・中内美名・倉根一郎・森川茂
  • Organizer: 第56回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081000
• [Presentation] 動物園飼育下オオコウモリの背景病変に関する病理組織学的研究 (2008)
  • Author(s): 河内岳史、柳井徳磨、酒井洋樹、柵木利昭、渡辺俊平、前田健、水谷哲也、中根利明、中谷隆二、川上博史、浜夏樹
  • Organizer: 第14回野生動物医学会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] コウモリ由来新規ヘルペスウイルス遺伝子の検出 (2008)
  • Author(s): 渡辺俊平、水谷哲也、上田直也、伊波興一朗、加藤健太郎、遠矢幸伸、久和茂、吉川泰弘、明石博臣
  • Organizer: 第146回日本獣医学会学術集会
  • Place of Presentation: 宮崎
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] ウイルスの網羅的方法の改良と新しいブニヤウイルスの発見 (2008)
  • Author(s): 水谷哲也、山尾卓也、江下優樹、木原悠希、佐藤朝光、黒田誠、関塚剛史、西村美保、酒井宏治、福士秀悦、緒方もも子、中内美名、倉根一郎、森川茂
  • Organizer: 第146回日本獣医学会学術集会
  • Place of Presentation: 宮崎
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] 網羅的ウイルスゲノム検出方法を用いたダチョウレオウイルスの同定 (2008)
  • Author(s): 酒井宏治、水谷哲也、福士秀悦、西條政幸、上野勇一、上田修平、平井明香、網康至、岡村雅史、中村政幸、竹原一明、山田靖子、倉根一郎、森川茂
  • Organizer: 第146回日本獣医学会学術集会
  • Place of Presentation: 宮崎
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] 新興ウイルス感染症の網羅的検出法の確立と応用 (2007)
  • Author(s): 水谷哲也、西村秀一、酒井宏治、前田健、清水博之、遠藤大二、福士秀悦、西條政幸、緒方もも子、倉根一郎、森川茂
  • Organizer: 第55回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 北海道
  • Year and Date: 20071000
• [Presentation] コウモリ由来ウイルスの分離・増殖のための新規培養細胞の樹立とその利用 (2007)
  • Author(s): 前田健、本道栄一、安本茂、遠藤大二、森川茂、水谷哲也
  • Organizer: 第55回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 北海道
  • Year and Date: 20071000
• [Presentation] キクガシラコウモリ由来新規ヘルペスウイルスの分離・同定 (2007)
  • Author(s): 前田健、本道栄一、寺川純平、木曽康郎、水谷哲也、遠藤大二、安本 茂
  • Organizer: 第22回ヘルペスウイルス研究会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 20070600
• [Presentation] オオコウモリ由来新規アデノウイルスの分離と同定 (2007)
  • Author(s): 前田健、本道栄一、寺川純平、木曽康郎、水谷哲也、酒井宏治、遠藤大二
  • Organizer: 第23回中国四国ウイルス研究会
  • Place of Presentation: 愛媛
  • Year and Date: 20070600
• [Book] 「ウイルスの変異」(p101-107)「ウイルスの不活化」(p107-108)「ウイルスの濃縮と精製」(p108-111)「ウイルスワクチン」(p111-117)「ウイルス剤と化学療法」(p117-120)動物微生物学、明石博臣、木内明男、原澤亮、本多英一編集 (2008)
  • Author(s): 前田 健
  • Publisher: 朝倉書店
• [Book] 「Pesticide Chemistry. Crop Protection, Public Health, Environmental Safety」 Wiley-VCH (2008)
  • Author(s): Eshita, Y.
  • Total Pages: 217-225
  • Publisher: Weinheim
• [Book] Host Cell Proteins, and Manipulation of the Cell Cycle by Viruses. In Progress in cell growth process research. (edited by T. Hayashi) (2008)
  • Author(s): Kazuya Shirato and Tetsuya Mizutani. Viral Proteinsv
  • Total Pages: 135-147
  • Publisher: Nova Publishers