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2009 Fiscal Year Annual Research Report

ハロロドプシンのクロライド輸送機構解明と3量体形成の意義

Research Project

Project/Area Number 19390009
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

加茂 直樹  Matsuyama University, 薬学部, 教授 (10001976)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 奈良 敏文  松山大学, 薬学部, 准教授 (30241350)
Keywordsexciton-coupling / Circular Dichroism / C1輸送 / dodecy1-β-D-maltoside / MALDI-TOF / 解離定数 / ホトサイクル / 微生物ロドプシン
Research Abstract

1)結晶からハロロドプシンHRは3量体を作っていることは推測されていたが、大腸菌で発現させ、0.1%から1%のDDM(dodecyl-β-D-maltoside)で可溶化状態でも3量体を形成していることを以下のように示した。1)可溶化したサンプルのCDを測定すると、exciton-couplingのスペクトルが得られる。2)ゲル濾過の溶離体積から見かけの分子量が得られた。ただし、吸着している界面活性剤の寄与を除く必要があり、これの推定を行い、3量体と仮定すると矛盾がないという結論を得た。3)グルタルアルデヒドで架橋をし、SDS-PAGEで解析した。反応時間に従って、3量体の分子量をもつ高分子量のものが生成した。MALDI-TOF massスペクトルで質量を測定した結果、3量体の生成が確認された。変異体の実験から、K65(Bヘリックス)とK148(Dヘリックス)間でグルタルアルデヒドによる架橋が行われることを示した。2)低C1濃度(Kd~22mM)で3量体は解離した。3)3量体を形成している条件では、熱的に安定であった。4)HRのホトサイクルを調べた。N中間体と0中間体の間に平衡があることを示した。N中間体とはC1結合型、0中間体はC1解離型である。この平衡のC1の解離定数は約1Mであった。T218変異体ではこの解離定数が0.1M程度までに低下する。すなわち、この変異体は野生型よりC1がHRから離れにくい。実際、T218変異体では、C1の放出速度が遅くなることを示した。5)無細胞タンパク系発現系でバクテリオロドプシンを効率よく(変性することなく)発現させることに成功した。

  • Research Products

    (17 results)

All 2010 2009

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] The photochemical reaction cycle and photoinduced proton transfer of sensory rhodopsin II(phoborhodopsin)from Halobacterium salinarum2010

    • Author(s)
      J.Tamogami, et al
    • Journal Title

      Biophys.J. 98

      Pages: 1353-1363

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proton release group of pharaonis phoborhodopsin revealed by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • Author(s)
      Y.Kitade, et al
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 1595-1603

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Halorhodopsin from Natronomonas pharaonis forms a trimer even in the presence of a detergent, dodecyle-β-D-maltoside2009

    • Author(s)
      T.Sasaki, et al
    • Journal Title

      Photochem.Photobiol. 85

      Pages: 130-136

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A tin oxide transparent electrode provides the means for rapid time-resolved pH measurements : Application to photoinduced proton transfer of bacteriorhodopsin and proteorhodopsin2009

    • Author(s)
      J.Tamogami, et al
    • Journal Title

      Photochem.Photobiol. 85

      Pages: 578-589

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of Arg123 in light-driven anion pump mechanism of pharaonis halorhodopsin2009

    • Author(s)
      M.Kubo, et al
    • Journal Title

      Photochem.Photobiol. 85

      Pages: 547-555

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reaction dynamics of halorhodopsin studied by time-resolved diffusion2009

    • Author(s)
      K.Inoue, et al
    • Journal Title

      Biophys.J. 96

      Pages: 3724-3734

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of chloride binding on the thermal trimer-monomer conversion of halorhodopsin in the solubilized system2009

    • Author(s)
      T.Sasaki, et al
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 12089-12095

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A simple and sensitive method for detection of Bacillus anthracis by loop-mediated isothermal amplification2009

    • Author(s)
      Y.Kurosaki, et al
    • Journal Title

      J.Appl.Microbiol. 107

      Pages: 1947-1956

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Production of functional bacteriorhodopsin by an Escherichia coli cell-free protein synthesis system supplemented with steroid detergent and lipid2009

    • Author(s)
      K.Shimono, et al
    • Journal Title

      Protein Sci. 18

      Pages: 2160-2171

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of molecular assembly on photocycle of reconstituted bacteriorhodopsin : significant blue shift of the late photointermediate in the liquid crystalline phase2009

    • Author(s)
      M.sonoyama, et al
    • Journal Title

      Chemistry Lett 39

      Pages: 1134-1135

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 固体NMRによる光受容タンパク質ppRとその変異体T204Aの局所構造変化の解析2009

    • Author(s)
      Tetsurou Hidaka
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] 固体^<13>C NMRによるppRの細胞質表面部位の相互作用変化の観測2009

    • Author(s)
      Takahiro Kondo
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] 大腸菌発現系を用いた salinarum ハロロドプシンの機能的再構成2009

    • Author(s)
      Yasutaka Yamashita
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] 共鳴ラマン分光法によるファラオニスフォボロドプシンN中間体の検出2009

    • Author(s)
      Masaahi Unno
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] ファラオニスフォボロドプシンの光反応サイクルに対するpHの影響2009

    • Author(s)
      Gang Dai
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] Halobacterium salinarum 由来のフォボロドプシン(センサリーロドプジンII)の光化学反応サイクルとプロトン移動2009

    • Author(s)
      Jun Tamogami
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] ファラオニスハロロドプシンのCl^-輸送機構におけるAs p252の役割2009

    • Author(s)
      Takashi Kikukawa
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アスティス徳島
    • Year and Date
      2009-10-30

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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