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2008 Fiscal Year Annual Research Report

核酸-生体高分子相互作用解析を目指した光アフィニティーラベル法の開発

Research Project

Project/Area Number 19510210
Research InstitutionObihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine

Principal Investigator

橋本 誠  Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine, 畜産学部, 准教授 (90292094)

Keywords光アフィニティーラベル / ジアジリン / 核酸-蛋白質相互作用 / 構造活性相関 / 機能部位解析
Research Abstract

光反応性trifluoromethylphenyldiazirine含有核酸親和性プラチナ化合物の合成とその性質検討ならびにマイクロアレー法を用いた網羅的相互作用解析法の確立
プラチナ含有エチレンジアミン化合物骨格が核酸親和性を持つことを利用し、種々の光反応性誘導体へと変換反応を検討し、その親和性などのパラメーターを測定により構造活性相関を網羅的に探索することで、核酸-蛋白質(糖質)の光アフィニティーラベルによる相互作用解析を検討する。
今年度は昨年度合成に成功した光反応性基trifluoromethylphenyldiazirineを持つ2価プラチナ化合物の性質を種々検討した。光分解性については、0.1mM以下において、350nm付近の光照射によりカルベンが発生し標的生体分子との間にクロスリンク反応が進行することをUVおよび^(19)F-NMRを測定することで、確認した。また核酸との相互作用のモデル系としてGMP(グアノシンー1-リン酸)との相互作用を検討した。1^H-NMR解析によるグアニジン塩基のケミカルシフトの変化を追跡し、trifluoromethylphenyldiazirineをもつプラチナ化合物がGMPと相互作用を起こしている事を確認した。この事から合成した化合物が、目的とした核酸親和性を持つことが明らかとなり、有機プラチナ化合物に光反応性trifluoromethylphenyldiazirineを修飾してもその親和性に大きな変化が見られない事を明らかとし、マイクロアレイによる解析法の基礎を確立した。

  • Research Products

    (4 results)

All 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Effective Friedel-Crafts acylations of O- and C- aryl glycosides with triflic acid2009

    • Author(s)
      M. Hashimoto, M. Takahashi
    • Journal Title

      Heterocycles 77

      Pages: 227-231

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel biotinyl and diazirinyl ceramide analogue for photoaffinity labeling2008

    • Author(s)
      M. Hashimoto, Y. Hatanaka
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett 18

      Pages: 650-652

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recent progress in diazirine-based photoaffinity labeling2008

    • Author(s)
      M. Hashimoto, Y. Hatanaka
    • Journal Title

      European Journal of Organic Chemistry

      Pages: 2513-2523

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Convenient synthesis of deuterium labelled diazirinyl alpha-amino acids for photoaffinity labeling2008

    • Author(s)
      M. Hashimoto, Y. Hatanaka
    • Organizer
      The Twentieth French-Japanease Symposium on Medicinal and Fine Chemistry
    • Place of Presentation
      Bordeaux, France
    • Year and Date
      20080900

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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