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2007 Fiscal Year Annual Research Report

スフィンゴミエリン代謝系酵素の構造および細胞生物学的な解析

Research Project

Project/Area Number 19570113
Research InstitutionTokushima Bunri University

Principal Investigator

津下 英明  Tokushima Bunri University, 健康科学研究所, 教授 (40299342)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 勝沼 信彦  徳島文理大学, 健康科学研究所, 教授 (50035375)
小田 真隆  徳島文理大学, 薬学部, 助教 (00412403)
桜井 純  徳島文理大学, 薬学部, 教授 (80029800)
Keywordsスフィンゴミエリン代謝系酵素 / スフィンゴミエリナーゼ / スフィンゴシンキナーゼ / 結晶構造解析 / 巻き戻し / 局在化
Research Abstract

(1)Bc-SMase-阻害剤複合体の結晶構造解析:新規のスフィンゴミエリナーゼ阻害剤を用いて複合体結晶のスクリーニングおよびソーキングによりデータ収集を進めてきたが,残念ながら,まだ複合体結晶には至っていない。今後,基質も含めて複合体の構造を明らかにしたいと考えている。
(2)組み換え体ヒトスフィンゴシンキナーゼ(SPHK1)の発現,精製:SPHK1の大量発現系を構築するためにHis tagged SPHK1(pET15b)の発現を行った結果,可溶性画分に得られるSPHK1はわずかであった。このため大腸菌で発現のインクルージョンボディ(IB)を用いた巻き戻しを試みた。このSPHK1をニッケルキレートクロマトグラフィーにより精製した。このSPHK1は活性があることを確認し,さらに質量分析によりSPHK1である事を同定した。ただし巻き戻しが不完全な分子も混在していた。今後,結晶化に向けて,ゲル濾過により更なる精製が必要である。ニッケルキレートクロマトグラフィーにより精製したSPHK1はカルモジュリンに結合した。今後,大腸菌で高発現したカルモジュリンを用い共精製を計画している。
(3)SPHK1局在化機構の解明:SPHK1の細胞膜の他のキナーゼによるリン酸化による調節あるいは細胞膜への移行に他のタンパク質が関与するのか等まだ不明な点が多い。ヒト細胞でSPHK1を発現させ,膜への移行機構を明らかにするために,HEK293細胞での発現およびこのFlag tag SPHKIに結合するタンパク因子の同定をnano LC MS/MSを用いて進めており,現在得られている分子の確認を行っている。

  • Research Products

    (14 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (7 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of the YdiC-family protein TTHBO29 from Thermus thermophilus HB8:Structural relationship with peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase2008

    • Author(s)
      Tsuge H., Imagawa T., 等
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun 367-3

      Pages: 535-541

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of l-aspartate oxidase from the hyperthermophilic archaeon Sulfblobus tokodaii2008

    • Author(s)
      Tsuge H., Sakuraba H., 等
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta 1784-3

      Pages: 563-571

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of archaeal highly thermostable L-aspartate dehydrogenase/NAD/citrate ternary complex2007

    • Author(s)
      Tsuge H., Yoneda K., 等
    • Journal Title

      FEBS Journal 274-16

      Pages: 4315-4325

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sequential aldol condensation catalyzed by hyperthermophilic 2-deoxy-d-ribose-5-phosphate aldolase2007

    • Author(s)
      Tsuge H., Sakuraba H., 等
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol 73-22

      Pages: 7427-7434

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Human D-amino acid oxidase:an update and review2007

    • Author(s)
      Tsuge H., Kawazoe T., 等
    • Journal Title

      Chem Rec 7-5

      Pages: 305-315

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 「X線結晶構造解析と質量分析による生理活性タンパク質の構造機能相関の研究」『複合体タンパク質X線結晶構造から見る酵素反応機能』2008

    • Author(s)
      津下 英明
    • Organizer
      徳島文理大学・健康科学研究所私学助成研究発表会
    • Place of Presentation
      徳島文理大学徳島校(徳島市)
    • Year and Date
      20080126-27
  • [Presentation] アルギニンADPリボシル化の毒素のアクチン認識分子機構2007

    • Author(s)
      津下 英明、小田 真隆、櫻井 純, 等
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜会議センター(横浜市)
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] Crystal structure of Aeromonas sobria serine protease,prototype kexin/furin protease:the extra occluding domain regUlates protein substarte specificity2007

    • Author(s)
      Tsuge H., Kobayashi H., 等
    • Organizer
      5th General Meeting of the International Proteolysis Society(IPS2007)
    • Place of Presentation
      Patras,Greece
    • Year and Date
      20071020-24
  • [Presentation] Crystal structure of the YdiC famiy protein TTHBO29 from Thermus the rmos thermophjlus HB8 revealed structural sirnilarity with peptidogly can deacetylase2007

    • Author(s)
      Tsuge H., Imagawa T., 等
    • Organizer
      ISDSB2007(The2nd International Symposium on Diffraction Structure Biology2007)
    • Place of Presentation
      Tower Hall Funabori,Tokyo,Japan
    • Year and Date
      20070910-13
  • [Presentation] Substrate recognitio of ADP-ribosylating toxins2007

    • Author(s)
      Tsuge H
    • Organizer
      Brookhaven National Laboratory
    • Place of Presentation
      New York
    • Year and Date
      20070725-29
  • [Presentation] Crystallographic Study of Human D-Amino Acid OXidase:Structural Basis of D-DOPA OXidation2007

    • Author(s)
      Tsuge H., Kawazoe T., Fukui K
    • Organizer
      THE 21st SYMPOSIUM OF THE PROTEIN SOCIETY
    • Place of Presentation
      Boston,Massachusetts
    • Year and Date
      20070721-25
  • [Presentation] ADPリボシル化酵素とフラビン酵素の構造機能相関2007

    • Author(s)
      津下 英明
    • Organizer
      第410回ビタミンB研究協議会
    • Place of Presentation
      京大会館(京都市)
    • Year and Date
      2007-11-17
  • [Book] 構造生物学-ポストゲノム時代のタンパク質研究2007

    • Author(s)
      倉光 成紀、杉山 政則編
    • Total Pages
      261
    • Publisher
      共立出版
  • [Remarks]

    • URL

      http://inetsrv103.bunri-u.ac.jp/kenkou/

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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