• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2008 Fiscal Year Final Research Report

Comparative functional analysis based on the 3D-structures of plant and microbial family 19 chitinases

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 19580084
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

WATANABE Takeshi  Niigata University, 自然科学系, 教授 (10201203)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Keywords微生物機能
Research Abstract

イネクラスI キチナーゼCht2からループIIを削除した欠失変異キチナーゼを構築し、野生型Cht2とその性質を比較した結果、ループIIが+3サブサイトを形成していることが明らかとなった。また、ループIIは顕著な生理活性を持つ4糖以上の長鎖キチンオリゴ糖の生成に重要な役割を果たしていることがわかり、植物クラスIキチナーゼがキチンエリシター産生において中心的役割を果たしていることが強く示唆された。また、放線菌ファミリー19キチナーゼChiCのキチン吸着には、吸着に重要であることがわかっているTrp59とTrp60に加えて、その周辺に存在するThr43, Glu64, Gln62, Asp70が関与していることが明らかとなった。

  • Research Products

    (26 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (13 results) Book (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The importance of chitobiase and N-acetylglucosamine(GlcNAc)uptake in N,N'-diacetylchitobiose[(GlcNAc)2]utilization by Serratia marcescens 21702008

    • Author(s)
      T. Toratani, T. Shoji, T. Ikehara, K. Suzuki, and T. Watanabe
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 487-495

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of the loop structure of the catalytic domain in rice class I chitinase2008

    • Author(s)
      R. Mizuno, T. Fukamizo, S. Sugiyama, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki and T. Watanabe
    • Journal Title

      J. Biochem 143

      Pages: 893-895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification and characterization of recombinant chitinase from E. coli carrying the cDNAof family 19 chitinase from rice(Oryza sativa L.)2008

    • Author(s)
      R. Mizuno, Y. Itoh, Y. Nishizawa, K. Suzuki, and T. Watanabe
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem 72

      Pages: 893-895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chitinase 3-like-1 enhances bacterial adhesion to colonic epithelial cells through the interaction with bact erial chitin-binding protein2008

    • Author(s)
      M. Kawada, C.-C. Chen, A. Arihiro, K. Nagatani, T. Watanabe and E. Mizoguchi
    • Journal Title

      Lab. Invest 88

      Pages: 883-895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Takahashi, S. Yanagi and H. Kihara, SaxsMDView : a three-dimensional graphics program for displaying force vectors2008

    • Author(s)
      M. Kojima, Y. Kezuka, T. Nonaka, Y. Hiragi T. Watanabe, K. Kimura, K. Takahashi, S. Yanagi and H. Kihara
    • Journal Title

      Journal of Synchrotron Radiation 15

      Pages: 535-537

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phage display screening for peptidic chitinase inhibitors2008

    • Author(s)
      C. Peter, C. Scholz, H. Wessner, G. Hansen, P. Henklein, T. Watanabe and W. Hohne
    • Journal Title

      J. Mol. Recogn 21

      Pages: 401-409

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chitinase inhibitor allosamidin promotes chitinase production of Streptomyces generally2008

    • Author(s)
      S. Suzuki, E. Nakanishi, K. Furihata, K. Miyamoto, H. Tsujibo, T. Watanabe, Y. Ohnishi, S. Horinouchi, H. Nagasawa, S. Sakuda
    • Journal Title

      Int. J. Biol. Macromol 43

      Pages: 13-19

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The role of exposed tryptophan and tyrosine residues on the surface of chitinase B from Serratia marcescens 21702008

    • Author(s)
      M. Muto, A. Ohara, K. Azuma, K. Suzuki, and T. Wat anabe
    • Journal Title

      Proceeding of MIE BIOFORUM 2008

  • [Presentation] イネクラスIキチナーゼ活性ドメインのループIIの機能解析2008

    • Author(s)
      杉山真一・水野亮二・西澤洋子・深溝慶・毛塚雄一郎・野中孝昌・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアアイランド
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] The role of exposed tryptophan and tyrosine residues on the surface of chitinase B from Serratia marcescens 21702008

    • Author(s)
      M. Mut o, A. Ohara, K. Azuma, K. Suzuki, and T. Wat anabe
    • Organizer
      MIE BIOFORUM
    • Place of Presentation
      三重県志摩市
    • Year and Date
      20080901-05
  • [Presentation] Streptomyces griseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明2008

    • Author(s)
      吉田優・菅丈司・水野亮二・毛塚雄一郎・野中孝昌・池上貴久・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第22回キチン・キトサンシンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟市コンベンションセンター
    • Year and Date
      20080805-06
  • [Presentation] Serratiamarcescens 2170由来キチナーゼBの表面に露出したトリプトファン及びチロシン残基の機能2008

    • Author(s)
      武藤亜紀子・大原麻子・吾妻香織・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第22回キチン・キトサンシンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟市コンベンションセンター
    • Year and Date
      20080805-06
  • [Presentation] Serratia marcescensのキチナーゼ発現におけるybfM 5'-UTRの重要性2008

    • Author(s)
      虎谷忠幸・山内友恵・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第22回キチン・キトサンシンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟市コンベンションセンター
    • Year and Date
      20080805-06
  • [Presentation] Streptomycesgriseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明2008

    • Author(s)
      吉田優・水野亮二・菅丈司・毛塚雄一郎・野中孝昌・池上貴久・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第22回キチン・キトサンシンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟市コンベンションセンター
    • Year and Date
      20080805-06
  • [Presentation] 転写因子chiRを破壊したSerratiamarcescensのプロテオーム解析2008

    • Author(s)
      庄司俊裕・虎谷忠幸・宮本勝城・辻坊裕・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      日本農芸化学会2008年度大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      20080326-29
  • [Presentation] Serratia marcescens 2170由来キチナーゼBの表面に露出したトリプトファンおよびチロシン残基の機能2008

    • Author(s)
      武藤亜紀子・大原麻子・吾妻香織・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      日本農芸化学会2008年度大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      20080326-29
  • [Presentation] Serratia marcescensのキチナーゼ発現におけるybfM 5'-UTRの重要性2008

    • Author(s)
      虎谷忠幸・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      日本農芸化学会2008年度大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      20080326-29
  • [Presentation] Antifungal chitinases : structure, functi on and possible application to biocontrol2007

    • Author(s)
      T. Watanabe, R. Mizuno, K. Suzuki, Y. Kezuka, T. Nonaka, And Y. Nishizawa
    • Organizer
      1^<st>international meeting for developme nt of IPM in Asia and Afri ca
    • Place of Presentation
      タイチェンマイ
    • Year and Date
      20071126-28
  • [Presentation] Structure and function of family 19 chitinases2007

    • Author(s)
      T. Watanabe, Y. Kezuka, T. Nonaka, T. Ikegami, Y. Nishizawa, M. Mitsutomi, and T. Fukamizo
    • Organizer
      8^<th>International Conference of the European ChitinSociety
    • Place of Presentation
      トルコアンタルア
    • Year and Date
      20070908-11
  • [Presentation] Serratia marcescens2170のキチン分解利用に関わるオペロンの機能解析2007

    • Author(s)
      虎谷忠幸・庄司俊裕・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第21回キチン・キトサンシンポジウム
    • Place of Presentation
      福井市
    • Year and Date
      20070726-27
  • [Presentation] Vibrio fisheri MKT20由来ファミリー19キチナーゼの機能解析2007

    • Author(s)
      水野亮二・大橋大輔・鈴木一史・渡邉剛志
    • Organizer
      第21回キチン・キトサンシンポジウム
    • Place of Presentation
      福井市
    • Year and Date
      20070726-27
  • [Book] 産業用酵素の応用技術と最新動向(井上國世監修)2009

    • Author(s)
      渡邉剛志他
    • Total Pages
      285-298
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] キチン・キトサン開発技術(平野茂樹監修, 第6章2 : 微生物のファミリー19キチナーゼ)2009

    • Author(s)
      渡邉剛志他
    • Total Pages
      135-142
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] キチン・キトサン開発技術(平野茂樹監修, 第7章4 : キチナーゼによる結晶性キチン分解)2009

    • Author(s)
      渡邉剛志他
    • Total Pages
      192-202
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] 酵素ハンドブック(八木達彦・福井俊郎・一島英治・鏡山博行・虎谷哲夫編)2008

    • Author(s)
      渡邉剛志他
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.agr.niigata-u.ac.jp/profile/watanabe/index.html

URL: 

Published: 2010-06-10   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi