2008 Fiscal Year Annual Research Report
クロストリディウム・ディフィシル北米流行強毒株の迅速直接検出法の開発と実用化
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19590578
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
加藤 はる National Institute of Infectious Diseases, 細菌第二部, 室長 (00273136)
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| Keywords | 院内感染 / 細菌 / 診断検査 / 遺伝子 |
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| Research Abstract |
1.クロストリディウム・ディフィシル臨床分離株の解析
(1)平成20年度に収集された臨床分離菌株をPCR ribotypingおよびslpA sequence typingにより解析したところ、北米流行株BI/NAP1/027と同定された菌株は2株認められた。
(2)この2株について、tcdCの解析を行ったところ、その遺伝子配列は、BI/NAP1/027で報告されているtcdCの遺伝子配列と同一であった。
(3)薬剤感受性試験を行ったところ、2株ともガチフロキサシンおよびモキシフロキサシンに感性で、historic isolateであった。
2.Loop-mediated isothermal amplification(LAMP)によるBI/NAP1/027株の同定法の確立
(1)BI/NAP1/027株の特異的なslpA遺伝子を、LAMP法により増幅し検出するためにプライマーを設計した。
(2)検討した欧米および日本で分離されたBI/NAP1/027株、26菌株すべてにおいてLAMP陽性となり、BI/NAP1/027株の同定が可能と考えられた。
(3)PCR ribotype 027以外のPCR ribotypeの39株中38株で、LAMP陰性であった。PCR ribotypeは異なるもののLAMP陽性であった1菌株は、BI/NAP1/027標準株のslpA遺伝子と8 amino acid異なるslpA遺伝子を保有していた。
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Research Products
(5 results)
