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2008 Fiscal Year Annual Research Report

Chlamydia pneumoniae 慢性感染症に関する研究

Research Project

Project/Area Number 19591190
Research InstitutionKawasaki Medical School

Principal Investigator

宮下 修行  Kawasaki Medical School, 医学部, 講師 (50278917)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 尾内 一信  川崎医科大学, 医学部, 教授 (80351899)
Keywordsクラミジア / 慢性持続感染 / プラーククローニング / ゲノムタイピング
Research Abstract

Chlamydia pneumonia急性感染と慢性・持続感染を区別するためには菌株をゲノムタイピングすることが必要である。C.pneumoniaeのうち、現在全ゲノムの塩基配列が公開されている4菌株間で塩基配列が異なる領域を検索し(DNAの10塩基以上長さが異なる領域)、その結果poly Cを含む50〜60塩基からなる特有の配列を示すC.pneumoniae polymorphic protein(ppp)に注目し解析を行った。この領域の配列をシークエンス法で比較検討した結果、菌株(各国株、日本の地域株、集団発生株など)をグループ化することに成功したが、逆に領域ppp7は再現性が悪いことも判明した。再現性の悪い理由がそれぞれの菌株に複数のクローンが存在する可能性を考え、単クローンを精製する目的でプラークの作成を試みた。HEp-2細胞に菌株を感染後、1.1%寒天を重層し、さらに培養液を重層して至適条件を検討した。特殊条件下の12日間培養後、世界で初めてC.pneumoniaeプラークの形成に成功し、クローンを精製することが可能になった。
本邦分離株(J183株)を使用してプラークを作成し、初代〜3継代したものから、それぞれ3つのプラークを選定しPCRを施行した。増幅産物からDNAを抽出し、大腸菌のプラスミドに組み込み、50コロニーずつ選択し増幅産物のシークエンスを行った。結果、領域ppp7のシトシン数は多様で、増幅のたびに異なる数のクローンが現れ、タイピングには不適切であった。今後は異なったゲノム領域の解析も行い、さらにプラーククローニングによる急性株と持続感染株の比較解析も行っていく予定である。

  • Research Products

    (20 results)

All 2009 2008

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 12 results) Presentation (2 results) Book (6 results)

  • [Journal Article] Development and evaluation of a loop-mediated isothermal amplification method for rapid detection of Chlamydophila pneumoniae2009

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Eur J Clin Microbiol Infect Dis 28(in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rapid and simple diagnosis of Chlamydophila pneumoniae pneumonia by an immunochromatographic test for detection of IgM antibodies2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Clin Vaccine Immunol 15

      Pages: 1128-1131

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assessment of the usefulness of sputum Gram stain and culture for diagnosis of community-acquired pneumonia requiring hospitalization2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Med Sci Monit 14

      Pages: 171-176

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mycoplasma pneumoniae pneumonia in the elderly2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Med Sci Monit 14

      Pages: 387-391

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transitional change in the clinical features of pulmonary tuberculosis2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Respiration 75

      Pages: 304-309

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Usefulness of the QuantiFERON TB-2G test for the differential diagnosis of pulmonary tuberculosis2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Intern Med 47

      Pages: 237-243

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of clinical dosage of gatifloxacin for respiratory tract infections in elderly patients based on pharmacokinetics/pharmacodynamics (PK/PD)2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      J Infect Chemother 14

      Pages: 296-304

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An asymptomatic case of pulmonary cryptococcosis with endobronchial polypoid lesions and bilateral infiltrative shadow2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      J Infect Chemother 14

      Pages: 315-318

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical utility of the QuantiFERON TB-2G test for elderly patients with active tuberculosis2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Chest 133

      Pages: 1196-1202

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical evaluation for diagnosing active TB disease and transitional change of two commercial blood tests2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Scand J Infect Dis 40

      Pages: 629-634

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Long-term follow-up of the QuantiFERON TB-2G test for active tuberculosis disease2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Intern Med 47

      Pages: 1957-1961

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pulmonary mycosis (Cunninghamella bertholletiae) with cavitation diagnosed using Ultra-thin fibre-optic bronchoscopy2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Journal Title

      Respirology 13

      Pages: 312-314

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Rapid diagnosis of Chlamydophila pneumoniae pneumonia by using an immunochromatographic test for detection of IgM antibodies2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Organizer
      Sixth meeting of the European society for Chlamydia research
    • Place of Presentation
      Denmark
    • Year and Date
      2008-07-01
  • [Presentation] Plaque formation of Chlamydophila pneumoniae2008

    • Author(s)
      Miyashita N
    • Organizer
      Sixth meeting of the European society for Chlamydia research
    • Place of Presentation
      Denmark
    • Year and Date
      2008-07-01
  • [Book] 成人院内肺炎診療ガイドライン2008

    • Author(s)
      宮下修行
    • Total Pages
      72
    • Publisher
      社団法人日本呼吸器学会
  • [Book] 肺炎の画像診断と最新の診療2008

    • Author(s)
      宮下修行
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      医薬ジャーナル社
  • [Book] KEY WORD感染症第2版2008

    • Author(s)
      宮下修行
    • Total Pages
      2
    • Publisher
      先端医学社
  • [Book] 感染症内科クリニカルスタンダードー必携ベッドサイドで必ず役立つ臨床感染症学のエッセンス2008

    • Author(s)
      宮下修行
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      文光堂
  • [Book] 腹痛診療ナビ2008

    • Author(s)
      宮下修行
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      日本医事新報社
  • [Book] 今日の耳鼻咽喉科頭頚部外科治療指針2008

    • Author(s)
      宮下修行
    • Total Pages
      1
    • Publisher
      医学書院

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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