2007 Fiscal Year Annual Research Report
メチル化プロフィールとEGFR遺伝子変異に基づいた肺癌診療体系の構築
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19591614
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
村川 知弘 The University of Tokyo, 医学部・付属病院, 助教 (50359626)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中島 淳 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (90188954)
深見 武史 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (40396742)
高井 大哉 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (90361493)
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| Keywords | 癌 / ゲノム / 外科 / 遺伝子 |
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| Research Abstract |
発癌の一因に遺伝子のメチル化による不活化があり、肺癌でも複数の遺伝子でメチル化の報告がなされている。従来は遺伝子のメチル化を調べる方法として、MSP (methylation specific PCR)が用いられてきたが、我々の研究室ではより感度・特異度に優れたQAMA (quantitative analysis of methylated alleles)を利用して、肺癌切除検体における複数遺伝子のメチル化プロフィールの報告を行った(Sano A, et. al., Oncogene 26(45):6518-25,2007)。従来肺癌でメチル化の報告がなかった遺伝子を新たに検索するため、Bioinformatics的手法を用いて、肺癌で発現の低下している遺伝子を抽出し、COBRA (combined bisulfite restriction analysis)とQAMAを用いて、肺癌でメチル化の存在する遺伝子を新たに8つ同定した。これらの新たに同定した遺伝子も含め19の遺伝子で、肺癌切除検体(98症例、101検体)におけるメチル化プロフィールをQAMAを用いて作成した。平均追跡期間がまだ2年弱のため、メチル化プロフィールと予後の関連に関しては今後の追跡を待たねばならないが、組織型との関連など新たな知見を得ることができた。メチル化の他に、肺癌切除検体のEGFR変異の検索も引き続き行っており、メチル化プロフィールとの関連も含め、今後解析を継続していく予定である。
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[Journal Article] A second-generation profiling system for quantitative methylation analysis of multiple gene promoters: application to lung cancer.2007
Author(s)
Sano A, Kage H, Sugimoto K, Kitagawa H, Aki N, Goto A, Fukayama M, Nakajima J, Takamoto S, Nagase T, Yatomi Y, Ohishi N, Takai D.
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Journal Title
Oncogene 26
Pages: 6518-25
Peer Reviewed
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[Journal Article] Hypoxia increases the motility of lung adenocarcinoma cell line A549 via activation of the epidermal growth factor receptor pathway.2007
Author(s)
Wang T, Niki T, Goto A, Ota S, Morikawa T, Nakamura Y, Ohara E, Ishikawa S, Aburatani H, Nakajima J, Fukayama M.
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Journal Title
Cancer Sci 98
Pages: 506-11
Peer Reviewed
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[Presentation] The Induction of H3K9 Methylation by PIWIL4 at the p16^<Ink4a> Iocus2007
Author(s)
Aki N, Sugimoto K, Kage H, Sano A, Kutomi T, Kusakabe M, Kitagawa H, Nagase T, Yatomi Y, Ohishi N, Takai D.
Organizer
An AACR Special Conference in Cancer Research The Role of Non-Coding RNAs in Cancer
Place of Presentation
Hyatt Regency Cambridge Cambridge, Massachusetts
Year and Date
2007-11-01
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